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La technologie neuve active un traçage plus rapide et plus précis de COVID-19 et d'autres virus

Jeremy Edwards, directeur du laboratoire de calcul de génomique et (CGaT) de technologie à l'université du Nouveau Mexique, et ses collègues aux technologies de Centrillion à l'université de Palo Alto, de la Californie et de la Virginie Occidentale, ont développé une frite qui fournit une méthode plus simple et plus rapide de séquençage du génome pour des virus comme COVID-19.

Leur recherche, intitulée, « Resequencing à puces hautement précis des échantillons SARS-CoV-2 cliniques » était publiée récent dans le Langmuir de la société chimique américaine. En tant qu'élément de la recherche, les scientifiques ont produit un choix carrelé de génome qu'ils ont développé pour plein le génome viral rapide et peu coûteux resequencing et se sont appliqués leur choix de carrelage de génome de SARS-CoV-2-specific resequenced à rapidement et exactement le génome viral de huit échantillons cliniques acquis des patients au Wyoming qui a vérifié le positif pour SARS-CoV-2. Éventuel, ils pouvaient à la séquence 95 pour cent du génome de chaque échantillon avec plus grand que 99,9 pour cent d'exactitude.

Cette technologie neuve tient compte d'un traçage plus rapide et plus précis de COVID et d'autres virus respiratoires, y compris l'apparence des variantes neuves. Avec cette méthode d'essai simple et rapide, les scientifiques pourront plus exactement à la piste l'étape progressive et éviteront mieux le début de la prochaine pandémie. »

Jeremy Edwards, professeur, département de chimie d'UNM et biologie de produit chimique

Le mondial de plus de 142 millions de personnes ayant été contracté le virus, le contrôle et le traçage vigilants de contact sont les la plupart des façons efficaces de ralentir l'écart de COVID-19. Les méthodes traditionnelles de tests cliniques produisent souvent des faux positifs ou des négatifs, et les méthodes traditionnelles d'ordonnancement sont longues et chères. Cette technologie neuve éliminera presque entièrement tous ces barrages.

« Depuis la présentation du papier, la technologie a davantage évolué avec l'exactitude améliorée et sensibilité, » a dit Edwards. « La technologie de frite est la meilleure technologie procurable pour le contrôle de grande puissance et la surveillance de génome viral des variantes virales. Cette technologie a pu non seulement aider à régler cette pandémie et à éviter également de futures pandémies. »

La mission du laboratoire de calcul de génomique et (CGaT) de technologie est de fournir la formation dans la recherche en matière de bio-informatique pour l'étudiant préparant une licence, le maître et les stagiaires de Ph.D., ainsi que les boursiers post-doctoraux ; fournissez les interactions de collaboration de recherches pour utiliser la bio-informatique calculant des outils pour des chercheurs à UNM, et pour conduire la bio-informatique de pointe et novatrice et la recherche de génomique dans le centre.

Source:
Journal reference:

Hoff, K., et al. (2021) Highly Accurate Chip-Based Resequencing of SARS-CoV-2 Clinical Samples. Langmuir. doi.org/10.1021/acs.langmuir.0c02927.