Aviso: Esta página é uma tradução automática da página original em inglês. Por favor note uma vez que as traduções são geradas por máquinas, não tradução tudo será perfeita. Este site e suas páginas da Web destinam-se a ler em inglês. Qualquer tradução deste site e suas páginas da Web pode ser imprecisas e imprecisos no todo ou em parte. Esta tradução é fornecida como uma conveniência.

A origem e a propagação curso-relacionadas de SARS-CoV-2 B.1.620 esticam

Os últimos meses consideraram a emergência de variações novas do coronavirus 2 da Síndrome Respiratória Aguda Grave (SARS-CoV-2), mesmo enquanto outras variações se desvanecem afastado. Algumas destas variações têm características biológicas ou epidemiológicas do interesse particular desde que podem promover o rapid do vírus espalhado ou causar uma doença mais severa.

Um artigo de investigação novo da pré-impressão afixado ao server do medRxiv* descreve uma variação nova B.1.620, que apareça em Lituânia, e é agora predominante em diversos países em Europa, assim como em África central.

Mais cedo, três linhagens virais foram classificadas como variações do interesse (VOCs), a saber a variação BRITÂNICA (B.1.1.7), o sul - africano (B.1.351), e a variação de Brasil (P.1). Um VOC tem um transmissibility ou uma virulência mais alta, que iludam potencial a neutralização imune.

Fundo da emergência B.1.620

A linhagem B.1.177 espalhou extensamente na Espanha primeiramente, antes de sua transmissão ao resto de Europa. Tais fenômenos são conduzidos em limitações em movimentos humanos, falta da monitoração da manifestação, e tempo. Em Europa, os projectos arranjando em seqüência genomic pegararam a elevação rápida ao domínio da tensão BRITÂNICA, deslocando a outra extensamente circulação esticam.

Em Uganda, também, a linhagem chamou A.23.1 aumentou à proeminência contra um ajuste de baixo arranjar em seqüência genomic. Tais linhagens virais são observadas frequentemente primeiramente, não em seu país da origem mas como um único caso ou como uma corrente da transmissão, começando com um viajante do país anfitrião, em um outro país que faça arranjar em seqüência em uma escala maior.

Porque mais países lançam seu próprio SARS-CoV-2 que arranja em seqüência programas, as tensões introduzidas são mais fáceis de detectar particularmente assim desde que tendem a ser atípicas da diversidade SARS-CoV-2 endémico de um país anfitrião, quando as linhagens introduzidas acumularam a diversidade genética não observada previamente, um fenômeno caracterizado por ramos longos em árvores filogenéticas.

Por exemplo, a linhagem B.1.380 era predominante em Ruanda e em Uganda por um momento mas foi encontrada então para levar de repente a A.23.1. O último foi arranjado em seqüência primeiramente em Uganda, que tinham começado arranjar em seqüência até lá. Este programa detectou então as primeiras ocorrências de B.1.1.7 e de B.1.351.

Árvore da probabilidade máxima da linhagem B.1.620 em Europa. Relacionamentos entre os genomas B.1.620, coloridos pelo país de origem (mesma que figura 1) com um esboço colorido mais grosso que indica o país de origem para casos do curso. Pelo menos sete genomas mostrados (as amostras recolhidas em Bélgica, Suíça, em França, e em Guiné Equatorial) são dos indivíduos que retornaram de República dos Camarões, um são de um viajante que retorna de Mali e de um caso lituano retornados de França. Os genomas do CARRO e do Czechia (viajante de retorno de Mali) estão descidos do genótipo B.1.620 original, quando o genoma da Guiné Equatorial for já estreitamente relacionado aos genomas encontrados no Reino Unido e acontecer ser um exemplo do curso de República dos Camarões. Cada genoma é conectado ao lugar geográfico disponível em Europa com os círculos os menores que indicam a precisão do municipalidade-nível, o tamanho intermediário que correspondem à informação do nível do condado (centrada no capital do condado) e os tamanhos os maiores do círculo que indicam a informação do nível de país (centrada no capital do país).
Árvore da probabilidade máxima da linhagem B.1.620 em Europa. Relacionamentos entre os genomas B.1.620, coloridos pelo país de origem (mesma que figura 1) com um esboço colorido mais grosso que indica o país de origem para casos do curso. Pelo menos sete genomas mostrados (as amostras recolhidas em Bélgica, Suíça, em França, e em Guiné Equatorial) são dos indivíduos que retornaram de República dos Camarões, um são de um viajante que retorna de Mali e de um caso lituano retornados de França. Os genomas do CARRO e do Czechia (viajante de retorno de Mali) estão descidos do genótipo B.1.620 original, quando o genoma da Guiné Equatorial for já estreitamente relacionado aos genomas encontrados no Reino Unido e acontecer ser um exemplo do curso de República dos Camarões. Cada genoma é conectado ao lugar geográfico disponível em Europa com os círculos os menores que indicam a precisão do municipalidade-nível, o tamanho intermediário que correspondem à informação do condado-nível (centrada no capital do condado) e os tamanhos os maiores do círculo que indicam a informação do nível de país (centrada no capital do país).

Linhagem B.1.620 em Europa

Os genomas B.1.620 foram encontrados não somente em Lituânia mas em outros lugares em Europa, embora não parecem ter sido provocados pelo mesmo evento da introdução. Em Alemanha e em França, os clades novos estão sendo observados que têm genomas quase idênticos.

França mostrou um conjunto das infecções B.1.620 assintomáticas como parte de uma única corrente da transmissão, com outros quatro casos fora desta área. O exemplo do deslocamento predeterminado deve ser identificada ainda, mas este mostra a comunidade espalhada um pouco do que a importação.

Além disso, a Espanha e Bélgica mostraram a presença dos genomas B.1.620 em arranjar em seqüência rotineiro da fiscalização.

Em Lituânia, a mutação de E484K em B.1.620 foi observada somente em B.1.1.7 diferentes de 13 casos da infecção com B.1.351 e um com a linhagem B.1.1.318. Nenhumas destas últimas linhagens estaram presente no condado de Utena.

Muitos casos em Europa tiveram uma história do curso de República dos Camarões, e arranjar em seqüência em países da África Central, a saber, República Centro-Africana, Guiné Equatorial e the Democratic Republic of the Congo, jogou repetidamente acima os genomas B.1.620.

Alvos do estudo

No estudo actual, os pesquisadores caracterizaram as mutações deste genoma. Muitos foram observados já em um ou em outro do VOCs, mas não junto. Igualmente concluíram que a linhagem colheu provavelmente acima primeiramente em República dos Camarões e são prováveis alcançar uma predominância alta em África central.

A linhagem B.1.620 tem mutações múltiplas

Muitos genomas de República dos Camarões transferidos ficheiros pela rede à base de dados de GISAID (iniciativa global para compartilhar de todos os dados da gripe) mostram a diversidade surpreendente. Alguns compartilham de mutações com o B.1.620, com o mais adiantado para parecer possivelmente sendo, mutações sinónimas em 15324 e a mutação T1027I do ponto. Estes estão igualmente actuais em B.1.619.

A mutação do ponto E484K é encontrada igualmente em uma linhagem estreitamente relacionada de República dos Camarões. Todas estas amostras foram recolhidas em janeiro e fevereiro de 2021.

A linhagem B.1.620 tem 23 mutações e os supressões comparados à referência esticam. Leva um grande número mutações e supressões originais, que são dissimilares à tensão relacionada a mais próxima em Lituânia. Embora estas mutações são compartilhadas por diversos VOCs, esta linhagem não parece ter elevarado pela recombinação de tais tensões.

A mutação de D614G está agora actual na maioria de tensões de circulação, incluindo este. Isto promove a infectividade viral, talvez aumentando “acima” da conformação do domínio receptor-obrigatório do ponto (RBD).

Evasão imune por B.1.620

A linhagem B.1.620 igualmente tem diversas mutações no domínio do N-terminal (NTD) da proteína do ponto, entre que algumas permanecem de impacto desconhecido. Do resto, todos resistem parcialmente a neutralização o soro convalescente e pela NTD-escolha de objectivos de anticorpos monoclonais. Isto pode apontar à origem destas mutações como a imune-ilusão de adaptações virais.

As mutações de S477N e de E484K no RBD são encontradas no outro VOCs, mas o B.1.620 não leva as mutações N501Y ou K417. Ambas as mutações anteriores facilitam a evasão larga da neutralização anticorpo-negociada. Igualmente promovem o emperramento da alto-afinidade do RBD a seu receptor, a enzima deconversão 2 (ACE2).

Ambos estão no mesmo laço periférico na relação obrigatória destas duas proteínas, e sua presença na combinação melhora o perfil energético favoràvel relativo ao genoma da referência.

Alta freqüência de B.1.620 provavelmente em África central

Quando o local que arranja em seqüência programas não é robusto, arranjar em seqüência de viajantes contaminados é a segunda opção da fiscalização para pegarar e monitorar linhagens diferentes. No estudo actual, os pesquisadores indicam que sete genomas B.1.620 eram dos viajantes República dos Camarões-retornados, quando seis eram das amostras localmente recolhidas em República Centro-Africana (CAR), perto de sua beira de República dos Camarões. Assim, esta linhagem parece ser predominante nesta região geográfica.

Arranjar em seqüência adequado está sendo realizado em diversos países República dos Camarões vizinha, a saber, África do Sul e Angola ao sul, Kenya ao leste, Togo, e Nigéria ao noroeste. A linhagem, parece conseqüentemente ter originado dentro da área de África central limitada pelas beiras destes países.

As histórias do curso dos casos europeus indicam introduções separadas, de República dos Camarões, e de Mali. Em um caso, pelo menos, a propagação da comunidade parece ter sido estabelecida, com o paciente do deslocamento predeterminado que desenvolve a infecção em Bélgica bem além do período de incubação do vírus e longo após seu retorno de República dos Camarões. Um outro caso não teve nenhuma história do curso de todo.

A filogenia de B.1.620

O estudo filogenética em África mostra que a variação elevarou provavelmente em República dos Camarões, e espalha-o então a República Centro-Africana e à Guiné Equatorial. Espalhou então aos vários países em Europa através das introduções múltiplas. Parece ter entrado nos EUA e na Inglaterra, quando entrou em Lituânia pelo menos duas vezes.

Muitos viajantes partiram de República dos Camarões para outros países africanos, indicando que esta linhagem é provável ser difundida em África até agora. Mesmo com os baixos níveis de arranjar em seqüência na Guiné Equatorial e no manual do transportador, sua detecção apoia esta suposição.

Que são as implicações?

“A descoberta de uma linhagem nova que carrega muitas mutações do interesse e com indicações que estão introduzidas dos lugar onde arranjar em seqüência não é rotineiro, está referindo-se, e tais ocorrências podem transformar-se uma norma alarming. A emergência de B.1.1.7 era inaudita e teve um impacto devastador no estado da pandemia, assim que está referindo-se que as diferenças de informação similares na fiscalização genomic global ainda persistem até hoje.”

Os programas genomic deficientes da fiscalização estão disponíveis em muito do mundo, quando as vacinas continuarem a ser pela maior parte a conserva de países desenvolvidos. Contudo, esta disparidade flagelará o mundo por décadas como o vírus continua a produzir variações e o rastejamento novos de novo em países previamente vacinados.

As medidas de controle contra as linhagens novas que vêm acima são limitadas para ser respostas do reflexo rotular, sendo insuficiente de impedir a evolução de tais variações. A fuga filogenética longa de B.1.620 própria sugere na evolução gradual ao longo do tempo, e talvez mesmo sobre distâncias vastas, ou devido às pressões da selecção durante a infecção crônica em povos immunosuppressed.

O pedido das mutações que conduzem a esta linhagem é igualmente impossível de recuperar, fazendo a difícil dizer se alguma mutação aqui promoveu directamente a ocorrência de outras mutações aumentando a aptidão viral. Este é um defeito crucial desde que esta linhagem tem o múltiplo a respeito das mutações.

Nosso trabalho destaca que as desigualdades globais, tanto quanto a monitoração da doença infecciosa, têm impactos reais em todo o mundo e que até que a pandemia SARS-CoV-2 esteja trazida colocar saltos em toda parte, é em nenhuma parte seguro para por muito tempo. Adicionalmente, nós destacamos a importância da coleta e compartilhar de metadata associados com as seqüências do genoma, em particular em relação às histórias individuais do curso, assim como à coleção data e os lugar, que são importantes executar análise filogenética e phylogeographic detalhada.”

Observação *Important

o medRxiv publica os relatórios científicos preliminares que par-não são revistos e, não devem conseqüentemente ser considerados como conclusivos, guia a prática clínica/comportamento saúde-relacionado, ou tratado como a informação estabelecida.

Journal reference:
Dr. Liji Thomas

Written by

Dr. Liji Thomas

Dr. Liji Thomas is an OB-GYN, who graduated from the Government Medical College, University of Calicut, Kerala, in 2001. Liji practiced as a full-time consultant in obstetrics/gynecology in a private hospital for a few years following her graduation. She has counseled hundreds of patients facing issues from pregnancy-related problems and infertility, and has been in charge of over 2,000 deliveries, striving always to achieve a normal delivery rather than operative.

Citations

Please use one of the following formats to cite this article in your essay, paper or report:

  • APA

    Thomas, Liji. (2021, May 11). A origem e a propagação curso-relacionadas de SARS-CoV-2 B.1.620 esticam. News-Medical. Retrieved on January 17, 2022 from https://www.news-medical.net/news/20210511/The-travel-related-origin-and-spread-of-SARS-CoV-2-B1620-strain.aspx.

  • MLA

    Thomas, Liji. "A origem e a propagação curso-relacionadas de SARS-CoV-2 B.1.620 esticam". News-Medical. 17 January 2022. <https://www.news-medical.net/news/20210511/The-travel-related-origin-and-spread-of-SARS-CoV-2-B1620-strain.aspx>.

  • Chicago

    Thomas, Liji. "A origem e a propagação curso-relacionadas de SARS-CoV-2 B.1.620 esticam". News-Medical. https://www.news-medical.net/news/20210511/The-travel-related-origin-and-spread-of-SARS-CoV-2-B1620-strain.aspx. (accessed January 17, 2022).

  • Harvard

    Thomas, Liji. 2021. A origem e a propagação curso-relacionadas de SARS-CoV-2 B.1.620 esticam. News-Medical, viewed 17 January 2022, https://www.news-medical.net/news/20210511/The-travel-related-origin-and-spread-of-SARS-CoV-2-B1620-strain.aspx.