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El estudio muestra la mutación distintiva en sublineage rápidamente emergente de SARS-CoV-2 B.1.1.7

En un nuevo estudio actualmente disponible en el servidor de la prueba preliminar del medRxiv*, los investigadores de los E.E.U.U. denuncian la detección de un sub-linaje específico de la variante del coronavirus 2 de la neumonía asiática B.1.1.7 (SARS-CoV-2) que abriga una novela S: La mutación de D178H y aclara su transmisión y configuraciones evolutivas.

La variante B.1.1.7 de SARS-CoV-2 emergió en el Reino Unido durante el COVID-19 en curso pandémico y fue determinada rápidamente pues la primera variante mayor de la preocupación que era más transmisible y, discutible, más virulenta.

Por lo tanto, debido a su infectiousness, explicó el aproximadamente 90% de las cajas COVID-19 en Europa y el 50% de cajas en los E.E.U.U. en mayo de 2020. Esta variante es caracterizada por la presencia de mutación de N501Y en el dominio receptor-obligatorio (RBD) de la glicoproteína del pico SARS-CoV-2, así como un puñado de otras mutaciones.

Tal presencia penetrante de esta variante abre la puerta para la adquisición contínua de mutaciones nuevas, y algunas de ellas pueden incitar la aparición de sub-linajes aún más infecciosos (y potencialmente más patógenos) de B.1.1.7.

Naturalmente, esto implica que hay una necesidad de la vigilancia genomic meticulosa para ser un paso delante de tales mutaciones desarrolladas recientemente en las variantes SARS-CoV-2 de la preocupación. Un grupo de investigación de la Facultad de Medicina de Keck de la Universidad de California del Sur en Los Ángeles decidía seguir el B.1.1.7-M: Sub-linaje de V70L que se ha observado recientemente con frecuencia creciente.

Abertura de una ranura en de mutaciones con análisis filogenético

En fin, esta secuencia entera incorporada estudio del genoma de 2900 muestras del hospital de niños Los Ángeles que fueron encontradas previamente para ser positivas para SARS-CoV-2 por la reacción en cadena reversa de la transcripción-polimerasa (RT-PCR).

Posteriormente, el análisis filogenético se ha perseguido con las herramientas complejas disponibles para los investigadores (tales como la tubería filogenética de NextStrain), así como la predicción de la estructura de la proteína de las glicoproteínas del pico del mutante.

Además, todas las mutaciones del candidato fueron divididas más a fondo por linaje del pangolin para establecer claramente cualquier mutación emergente en el contexto de un linaje específico (tal como variantes B.1.1.7 o B.1.351).

Alteración de la configuración de SARS-CoV-2

Usando la aproximación metodológica ya mencionada, este grupo de investigación ha determinado un sub-linaje de B.1.1.7 que emergió vía adquisiciones secuenciales de M: Mutación de V70L en noviembre de 2020, que fue seguida por una novela S: Mutación de D178H observada inicialmente a principios de febrero de 2021.

En abril de 2021, este sublineage comprendió 36,8% de todos los aislantes B.1.1.7 encontrados en Washington. Más concretamente, el análisis y la inferencia filogenéticos de la transmisión con Nextstrain implica que sus orígenes probables están en California o Washington.

Análisis estructural adicional revelado eso el S: La mutación de D178H está cercana a dos otras mutaciones de la firma de B.1.1.7 - Y144del y HV69-70del. Por otra parte, es superficie expuesta y puede alterar la configuración terciaria del dominio terminal de N (que es una parte de la glicoproteína del pico), afectando a la capacidad de la neutralización de anticuerpos.

Situación estructural del D178H y de otras mutaciones del rotein del pico p 333 en el linaje B.1.1.7. D178H está en gran proximidad a otros aminoácidos en los NTD que se afectan en el linaje B.1.1.7, el HV69-70del y el Y144/Y145del (superior derecho).
Situación estructural del D178H y de otras mutaciones de la proteína del pico p 333 en el linaje B.1.1.7. D178H está en gran proximidad a otros aminoácidos en los NTD que se afectan en el linaje B.1.1.7, el HV69-70del y el Y144/Y145del (superior derecho).

El potencial para el escape vaccíneo del `'

Las observaciones de este estudio muestran a eso el S: La mutación de D178H se observa pero se amplifica en varias ocasiones solamente exponencial en el contexto del linaje más patógeno B.1.1.7, sirviendo como argumento válido para su aptitud física.

“Estas conclusión destacan la importancia continuada de la vigilancia genomic activa para vigilar la extensión de este B.1.1.7-M: V70L-S: el linaje 178H”, dijo a autores del estudio en este papel del medRxiv. “El efecto potencial del S: La mutación de D178H en inmunidad y ` que el escape vaccíneo' también autoriza análisis adicional”, ellos agregó.

Hay un aumento de preocupación en el porcentaje de los aislantes B.1.1.7 en los E.E.U.U. que pertenecen a este sublineage, como los porcentajes subieron a partir de la 0,15% en febrero a 1,8% en abril de 2021. Hasta la fecha, este sublineage específico aparece ser específico para los E.E.U.U., con los casos denunciados en 31 estados (Hawaii incluyendo), pero la vigilancia contínua se autoriza definitivamente.

Advertencia *Important

el medRxiv publica los partes científicos preliminares que par-no se revisan y, por lo tanto, no se deben mirar como concluyentes, conduce práctica clínica/comportamiento relativo a la salud, o tratado como información establecida.

Journal reference:
Dr. Tomislav Meštrović

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Dr. Tomislav Meštrović

Dr. Tomislav Meštrović is a medical doctor (MD) with a Ph.D. in biomedical and health sciences, specialist in the field of clinical microbiology, and an Assistant Professor at Croatia's youngest university - University North. In addition to his interest in clinical, research and lecturing activities, his immense passion for medical writing and scientific communication goes back to his student days. He enjoys contributing back to the community. In his spare time, Tomislav is a movie buff and an avid traveler.

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