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As mutações do genoma SARS-CoV-2 indicam a evolução convergente que indica vantagens adaptáveis fortes

Uma quantidade inaudita de dados genomic da seqüência está acumulando no tempo real durante a pandemia COVID-19. Sobre 1,2 milhão seqüências do coronavirus 2 da Síndrome Respiratória Aguda Grave (SARS-CoV-2) foram gerados durante os 15 meses passados, e a comunidade científica ganhou muito conhecimento destas seqüências.

De todas as mutações provadas até agora, somente alguns tornaram-se proeminentes na população viral. Muitas destas mutações têm emergido recentemente e em linhagens múltiplas. Isto um exemplo de livro de texto da evolução convergente a nível molecular que gera a curiosidade e também actua como uma motivação para estudar a base para a vantagem adaptável que conduz estes eventos.

Um relatório recente, liberado como uma pré-impressão no server do bioRxiv*, por uma equipe dos pesquisadores centrados sobre a extensão da evolução convergente SARS-CoV-2 na proteína do ponto (s). O relatório confirma que as linhagens da parte superior SARS-CoV-2 do interesse têm as mutações as mais convergentes da proteína do ponto. Isto indica sua vantagem adaptável fundamental.

Analisando a extensão da evolução convergente no SARS-CoV-2 crave (s) a proteína

A grande maioria dos locais da proteína do ponto - 21 de 25 - sob a evolução convergente é aglomerada firmemente em 3 domínios funcionais - o domínio receptor-obrigatório (RBD), o domínio do N-terminal, e o local da segmentação de Furin. O estudo igualmente mostra que entre as mutações receptor-obrigatórias do motivo da proteína do ponto, as substituições que impulsionam a afinidade ACE2 seja preferível.

Os pesquisadores escrevem:

Para monitorar a evolução SARS-CoV-2, nós procuramos momentaneamente mudanças convergentes entre todos os genes do genoma SARS-CoV-2 em NextStrain.”

Quando o espaço da mutação analisado na proteína do ponto teve todos os ácidos aminados alcançáveis por únicas mudanças do nucleotide (SNCs), as substituições que exigiram duas mudanças do nucleotide ou mutações epistatic de resíduos múltiplos começaram emergir somente recentemente.

Os esforços da vacinação podem deslocar a pressão evolucionária de SARS-CoV-2 para a mutação do imune-escape às expensas da aptidão viral

SARS-CoV-2, como outros vírus, tem a pressão evolucionária aumentar a aptidão do vírus em um ambiente novo. Contudo, os programas de vacinação globais são esperados deslocar a pressão para a mutação do imune-escape, mesmo às expensas da aptidão viral.

Os resultados deste estudo mostram que do grande número de mutações detectadas nos genomas SARS-CoV-2, simplesmente alguns aumentaram às altas freqüências. Interessante, muitas destas mutações indicam a evolução convergente, que indica uma vantagem adaptável forte concedida pelas mutações específicas.

A maioria das mutações deimpulso alcançáveis por SNCs são vistas já na abundância no conjunto de dados genomic global. Ao contrário, o estudo identificou somente uma única mutação - Y505W - com uma representação relativamente alta e desempenho da afinidade-aumentação comparado ao selvagem-tipo mutação que exige 2 mudanças do nucleotide. Muitas mutações que exigem 2 mudanças do nucleotide com o emperramento mais apertado a ACE2 não têm sido provadas até agora.

A evolução convergente da proteína do ponto pode ajudar a produzir umas vacinas mais eficazes do universal 2nd-generation para proteger a população global

As 2 mudanças do nucleotide provadas até agora mostram um aumento drástico na riqueza destas mutações avançadas durante os últimos 3 meses, embora ainda com freqüências muito baixas. Isto oferece uma explicação a respeito de porque as mutações epistatic que exigem mudanças orquestradas em diversos nucleotides na proteína são ainda uma raridade.

A previsibilidade da evolução convergente da proteína do ponto pode aumentar as probabilidades das seqüências da proteína do ponto nas vacinas 2nd-generation universais, protegendo eficazmente a população mundial das variações virais actuais e futuras do interesse.

Apesar da associação física e da emergência convergente destas mutações adaptáveis, não são bons compreendida. Os pesquisadores apontam promover a pesquisa das variações actualmente de circulação que understudied e podem se transformar variações do interesse no futuro.

A equipe conclui:

Nossa análise mostra que entre o grande número de mutações quais foram detectadas nos genomas SARS-CoV-2 virais, simplesmente poucos aumentaram às altas freqüências.”

Observação *Important

o bioRxiv publica os relatórios científicos preliminares que par-não são revistos e, não devem conseqüentemente ser considerados como conclusivos, guia a prática clínica/comportamento saúde-relacionado, ou tratado como a informação estabelecida.

Journal reference:
Susha Cheriyedath

Written by

Susha Cheriyedath

Susha has a Bachelor of Science (B.Sc.) degree in Chemistry and Master of Science (M.Sc) degree in Biochemistry from the University of Calicut, India. She always had a keen interest in medical and health science. As part of her masters degree, she specialized in Biochemistry, with an emphasis on Microbiology, Physiology, Biotechnology, and Nutrition. In her spare time, she loves to cook up a storm in the kitchen with her super-messy baking experiments.

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