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COVID-19, contrôle de masse et l'installation de l'épidémiologie d'eaux usées

Jusqu'à présent, la maladie 2019 (COVID-19) de coronavirus, provoquée par le coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de syndrôme respiratoire aigu sévère, a été responsable de plus de 170 millions d'infections et plus de 3,54 millions de morts. De diverses méthodes de contrôle sont utilisées pour évaluer l'écaille du fardeau de la maladie et de l'exposition de la population ; celles-ci comprennent le contrôle de communauté, le traçage de contact et la surveillance de la morbidité et des taux de mortalité.

Actuel, l'épidémiologie basée sur eaux usées (WBE) est explorée comme un outil neuf pour suivre l'écart de COVID-19. Les personnes symptomatiques et asymptomatiques sont rapportées pour jeter l'ARN viral dans leurs fèces, et beaucoup d'études indiquent la détection du virus en eaux d'égout et eaux usées en travers du monde.

Dans une étude récente, publiée comme prétirage sur le serveur de medRxiv*, les chercheurs ont développé une méthodologie pour trouver l'ARN SARS-CoV-2 en eaux usées avec le potentiel pour trouver une association entre la charge de l'ARN viral SARS-CoV-2 de la centrale de traitement des eaux résiduaires (WWTP) et les cas COVID-19 affluants dans la communauté. Cette étude indique qu'une épidémiologie basée sur eaux usées d'écaille nationale peut jouer un rôle dans le contrôle COVID-19.

Les chercheurs ont expliqué que la concentration et l'ARN viral SARS-CoV-2 quotidien chargent des eaux usées sont associés aux cas COVID-19. Ceci peut être employé pour prévoir le nombre de cas trouvés dans le bassin de captation de WWTP. « On observe statistiquement une relation significative claire entre ces deux variables au-dessus des seuils de cas de site-détail, » les chercheurs remarquables.

Bien que s'avérer efficace comme outil de contrôle, comprenant le choc de la dynamique de rejet virale en fèces, persistance du virus dans des débits d'eaux usées et d'eaux usées sur la détection du virus demeurent des sérieux défi, » écrit l'équipe.

Ils ont développé une méthodologie basée sur filtration pour concentrer le SARS-CoV-2 des eaux à traiter de WWTP. Alors ils ont par la suite trouvé et ont mesuré la charge virale en optimisant Droite-qPCR (réaction en chaîne inverse quantitative de transcription-polymérase).

Cette méthodologie, adoptée par l'Agence pour la Protection écossaise d'environnement (SEPA), a surveillé 28 WWTPs en travers de l'Ecosse, servant 50% de la population, environ 2,66 millions de personnes. Y compris de grandes agglomérations, ainsi que communautés rurales et distantes à basse densité d'île, ces sites couvrent les eaux à traiter rurales et urbaines d'eaux usées dans l'étude.

Actuellement, le contrôle d'eaux usées a été augmenté pour couvrir 75% de la population, d'échantillonnage de sous-captation étant employé pour orienter le contrôle de saut de pression, les chercheurs avisés.

Pour chaque bassin de captation de WWTP, les chercheurs ont également rassemblé des caractéristiques sur les cas COVID-19 et les morts. Dans l'étude, ceci est présenté en tant que relations spatiales et temporelles mesurées entre l'ARN SARS-CoV-2 en eaux usées et COVID-19 les cas, la force dont était intense dans le WWTPs plus grand.

De manière significative, l'étude rapportée que le seuil recensé pour le dépistage est type au-dessous de 25 cas, alors que pour un certain plus petit WWTPs, un cas trouvé unique de communauté était suffisante pour donner un résultat positif d'eaux usées.

Sur les limites du dépistage à basse altitude, les chercheurs ont dit, le « contrôle d'eaux usées peuvent être particulièrement précieux pour des endroits atteignant la prévalence inférieure et sont pour cette raison adaptés comme système de première alerte logistiquement viable et rentable, rendant une stratégie visée de contrôle de communauté viable. »

D'une manière primordiale, nous expliquons comment WBE peut être adopté en travers d'une gamme des captations, des zones urbaines en masse peuplées (Edimbourg et Glasgow) vers de plus petites villes, des zones rurales et des îles. »

On le sait que les patients COVID-19 jettent l'ARN SARS-CoV-2, avec le rejet prolongé observé jusqu'à 33 jours après le début initial des sympt40mes ou des hospitalisations. On le trouve même après la guérison totale. Dans cette étude, les chercheurs ont également estimé le niveau du rejet viral dans les fèces et comment ceci varie au fil du temps.

Ils ont observé relativement une courte période dont les personnes infectées contribuent considérablement au signe d'eaux usées. Discutant la sensibilité, les facteurs variés et les corrélations qui affectent leur étude, les chercheurs ont présenté un modèle neuf pour prévoir la charge affluante quotidienne d'ARN viral de WWTP SARS-CoV-2 utilisant des débits affluants quotidiens.

Cette étude confirme l'existence d'un intense et mesurable, statistiquement la relation significative entre l'ARN viral quotidien de SARS-CoV-2 WWTP chargent et le nombre de cas COVID-19 trouvés dans la collection précédente témoin d'eaux usées de semaine.

L'épidémiologie basée sur eaux usées (WBE) et le dépistage SARS-CoV-2 variable, l'évaluation de la vaccination sur la boîte de vitesses de communauté et le contrôle pour d'autres maladies infectieuses représentent de futures applications prometteuses. Cette étude explique le commencement rapide, développement, validation et l'utilisation opérationnelle d'un programme national de COVID-19 WBE pour fournir le contrôle hautement rentable de communauté pendant la pandémie, les chercheurs concluent.

Avis *Important

le medRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
  • Stephen F. Fitzgerald, Gianluigi Rossi, Alison S. Low, Sean P. McAteer, Brian O’Keefe, David Findlay, Graeme J. Cameron, Peter Pollard, Peter T. R. Singleton, George Ponton, Andrew C. Singer, Kata Farkas, Davey Jones, David W Graham, Marcos Quintela-Baluja, Christine Tait-Burkard, David L. Gally, Rowland Kao, Alexander Corbishley. COVID-19 mass testing: harnessing the power of wastewater epidemiology. medRxiv preprint server. 2021.05.24.21257703; doi: https://doi.org/10.1101/2021.05.24.21257703, https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.05.24.21257703v1  
Dr. Ramya Dwivedi

Written by

Dr. Ramya Dwivedi

Ramya has a Ph.D. in Biotechnology from the National Chemical Laboratories (CSIR-NCL), in Pune. Her work consisted of functionalizing nanoparticles with different molecules of biological interest, studying the reaction system and establishing useful applications.

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