Avertissement : Cette page est une traduction automatique de cette page à l'origine en anglais. Veuillez noter puisque les traductions sont générées par des machines, pas tous les traduction sera parfaite. Ce site Web et ses pages Web sont destinés à être lus en anglais. Toute traduction de ce site et de ses pages Web peut être imprécis et inexacte, en tout ou en partie. Cette traduction est fournie dans une pratique.

les écrans de la Génome-écaille CRISPR indiquent exactement les composés antiviraux prometteurs contre SARS-CoV-2

Dans un papier de recherche récente actuellement disponible sur le serveur de prétirage de bioRxiv*, les scientifiques aux USA ont utilisé les écrans knockout de la génome-écaille CRISPR pour recenser les facteurs qui introduisent l'infection avec le coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de syndrôme respiratoire aigu sévère, indiquant le potentiel pour l'activité à large spectre en travers de la famille de coronavirus.

Tandis que des vaccins efficaces contre la maladie de coronavirus (COVID-19) sont administrés mondial à un rythme sans précédent, il y a toujours un besoin extrême pour des traitements antiviraux, particulièrement vu l'émergence des variantes antigénicalement distinctes SARS-CoV-2 de la préoccupation en travers du monde.

Des Antivirals peuvent être groupés dans deux catégories fondamentales, hôte-visant et virus-visant, qui justifient une compréhension complète des mécanismes moléculaires employés par les agents viraux pour reproduire en cellules.

En outre, nous nous rendons compte que réplique de coronaviruses à l'aide d'une suite bien établie d'événements moléculaires, où les facteurs d'hôte sont présents à chaque opération - représentation consécutivement des objectifs potentiellement druggable.

Tenant compte du besoin de compréhension adéquate des écrans de la taille du génome dans l'identification des facteurs d'hôte nécessaires pour la réplication virale, ainsi que du choc global énorme de la pandémie du courant COVID-19, c'est sans merveille que beaucoup d'organismes de recherche emploient cette approche pour étudier SARS-CoV-2.

En conséquence, un organisme de recherche du dirigé par les USA par M. Marco Grodzki du Service de Génétique Moléculaire et la microbiologie, université de médicament à l'université de la Floride - a exécuté une analyse globale des interactions entre l'hôte et les coronaviruses d'être humain des écrans de la taille du génome dans deux lignées cellulaires différentes.

Écrans Knockout et contrôle d'inhibiteur

Plus particulièrement, cet organisme de recherche a poursuivi les écrans knockout de la génome-écaille CRISPR dans deux lignées cellulaires avec SARS-CoV-2 et coronavirus humain OC43 qui entraîne le rhume. Les lignées cellulaires qu'elles ont employées étaient Vero E6 (cellules épithéliales de rein d'un callitriche africain) et HEK293T (cellules embryonnaires humaines de rein) exprimant ectopically le récepteur ACE2.

Ils ont également déterminé si des voies spécifiques et les produits de gène recensés dans des ces écrans pourraient être visés avec les inhibiteurs disponibles dans le commerce pour arrêter l'infection avec les coronaviruses humains. Beaucoup de gènes impliqués dans la régulation du cycle cellulaire ont été testés, et des copies de génome viral ont été mesurées en cellules traitées avec chacun composé.

En conclusion, les chercheurs également ont effectué jusqu'à présent une analyse comparative complète de tous les écrans SARS-CoV-2 de la taille du génome publiés dans un effort pour recenser les objectifs saillants et pour aviser le développement ultérieur de médicament.

Antivirals visant des facteurs identifiés d'hôte

En bref, les écrans de la taille du génome de CRISPR en Vero E6 et les cellules HEK293T-hACE2 ont recensé des facteurs spécifiques d'hôte exigés pour l'infection avec les coronaviruses humains. Un sous-ensemble de candidats de gène qui introduisent la réplication virale a été également validé.

D'ailleurs, les médicaments visant l'hôte sélecté factorise l'efficacité in vitro manifestée contre SARS-CoV-2, qui a compris les inhibiteurs variés de cycle cellulaire, un inhibiteur d'endocytose et un inhibiteur Bidon-grippant de la kinase 1. Ces médicaments ont pu repurposed pour la demande de règlement de COVID-19 dans un avenir proche.

Des facteurs d'hôte impliqués dans la régulation du cycle cellulaire ont été enrichis dans les écrans qui ont été poursuivis dans cette étude, de même que quelques autres éléments clé de la voie programmée de délabrement d'ARN messager. Selon les résultats obtenus, des différences de cellule-type-détail dans l'utilisation des lysosomes pour la sortie humaine de coronavirus ont été également proposées.

Vers la compréhension des interactions principales

« Nos études justifient et augmentent le fuselage croissant de la littérature concentré sur des interactions cellulaires humaines principales de compréhension de coronavirus-hôte », disent les auteurs de cet article de bioRxiv.

« La suppression d'emploi assez limitée dans des facteurs proviral recensés en travers de notre étude et d'autres études publiées utilisant les écrans de la taille du génome de CRISPR met en valeur l'étendue considérable de ces interactions et propose qu'encore plus les facteurs d'hôte restent à découvrir », elles ajoutent.

En tous cas, les différences dans des types de cellules et des états variables d'infection influencent incontestablement les résultats des écrans ; par conséquent, ceci a pu être une voie d'obtenir des analyses neuves dans les mécanismes subtile et les caractéristiques de la réplication SARS-CoV-2.

Par conséquent, les études moléculaires méticuleuses qui évaluent des hypothèses apparentées à celle-ci (et à provenir des écrans analogues de génome-écaille CRISPR) représentent une prochaine opération pivotalement. Le travail complémentaire est nécessaire également pour déterminer le mécanisme de l'action des composés nouveaux avant qu'elles puissent être employées dans le milieu clinique.

Résumé des gènes trouvés en cela et d
Le résumé des gènes a trouvé en cela et d'autres études et leurs rôles potentiels dans la durée de la vie utile SARS-CoV-2. Les facteurs d'hôte recensés dans des écrans de CRISPR sont présentés à côté de l'étape putative de la réplication virale où ils fonctionnent. Les gènes sont de code à couleurs basés sur leur identification dans nos et autres études publiées, comme indiqué dans la légende. Des facteurs d'hôte de HCoV de carter de candidat sont indiqués avec les astérisques rouges. Les répliques de virus par une suite d'opérations moléculaires bien définies. 1-2) Après le virion grippant à ACE2, SARS-CoV-2 peut protéger par fusible à la membrane de plasma ou après endocytose. Les protéoglycanes de héparane-sulfate améliorent la pièce d'assemblage virale aux cellules ainsi les facteurs d'hôte impliqués dans la biosynthèse de héparane-sulfate (B3GAT3, EXT1, EXTL3, SLC35B2) et la glycosylation (A4GALT, ALG5, ALG9) peuvent jouer un rôle dans l'entrée virale. Les protéines d'IFITM sont proposées pour introduire la fusion sur la surface de cellules mais pour empêcher la fusion dans les endosomes. Hébergez les facteurs impliqués dans l'endocytose (C18orf8, CCZ1, CCZ1B, CLTC, EPN1, WDR81, WDR91), le transport vésiculaire (DNM2, PIK3C3, RAB7A, TMEM106B, SNX27, VAC14, VPS35), et la fusion amphisome de maturation/lysosome (ATP6VIE1, ATPCV1G1, ATP6V1A, CTSL, GDI2, TMEM41B) facilitent vraisemblablement le virion uncoating. 3) le génome d'ARN de positif-sens est alors traduit pour produire les polyproteins nonstructural qui sont Co-de translation fendues pour former les nsps matures. Certains facteurs d'hôte comme RNH1 et DAZ3 peuvent servir à protéger le génome viral contre la dégradation par des enzymes d'hôte. 4) les nsps forment le replicase viral qui se réunit sur les membranes organellar pour former les composés de réplication et de transcription (RTC) où des génomes de progéniture et transcriptions structurelles/annexes de protéine sont produits, respectivement. les composantes EDC4 et XRN1 de P-fuselage, recensés dans cette étude, peuvent jouer un rôle dans la stabilité d'ARN viral ou l'ensemble de mise à jour du RTC. 5) des protéines structurelles et annexes sont traduites, et garniture intérieure de protéines de structure en membrane d'ER. SLC39A1 Heu-localisé peut jouer un rôle dans ce procédé. 6) le bourgeon de Nucleocapsids dans l'ERGIC, potentiellement facilité par l'hôte factorise ERGIC3, SEC63, SLC33A1, et SCAP. 7) les virions de progéniture forment pendant qu'ils traversent par le Golgi et les protéines de structure sont glycosylées. 8) les virions quittent la cellule par l'exocytose particulière (DNM2, EXOC2, EXT1, EXTL3, MYH13, SNX27, VPS35) ou la sortie lysosomal nonclassical (GNPTAB, GNPTG, NAGPA, NPC1, TMEM106B, PIP4P1). Des facteurs nombreux d'hôte avec des rôles directs moins évidents en introduisant des opérations dans la durée de vie utile virale ont été également recensés dans des écrans de CRISPR. Par exemple, de nombreux facteurs réglant le cycle cellulaire (BAX, CDK4, CDKN1A, DYRK1A, HRK, MPLKIP, PTCH1, STRADA, TP53) ont été recensés dans des nos écrans en missile air-sol et cellules humaines. En outre, des facteurs d'hôte nucléaire-localisés par multiple comprenant de divers régulateurs transcriptionnels et deux composantes du composé d'intégrateur (INTS6, INTS12) ont été recensés. De façon générale, le grand nombre de divers facteurs d'hôte qui s'introduisent la réplication SARS-CoV-2 illustre l'exploitation de grande puissance des processus cellulaires exigés pour le bouturage viral couronné de succès. Adapté de la matrice de BioRender a intitulé la durée de vie utile du coronavirus produit par le laboratoire de Britt Glaunsinger.

Avis *Important

le bioRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
Dr. Tomislav Meštrović

Written by

Dr. Tomislav Meštrović

Dr. Tomislav Meštrović is a medical doctor (MD) with a Ph.D. in biomedical and health sciences, specialist in the field of clinical microbiology, and an Assistant Professor at Croatia's youngest university - University North. In addition to his interest in clinical, research and lecturing activities, his immense passion for medical writing and scientific communication goes back to his student days. He enjoys contributing back to the community. In his spare time, Tomislav is a movie buff and an avid traveler.

Citations

Please use one of the following formats to cite this article in your essay, paper or report:

  • APA

    Meštrović, Tomislav. (2021, June 07). les écrans de la Génome-écaille CRISPR indiquent exactement les composés antiviraux prometteurs contre SARS-CoV-2. News-Medical. Retrieved on September 26, 2021 from https://www.news-medical.net/news/20210607/Genome-scale-CRISPR-screens-pinpoint-promising-antiviral-compounds-against-SARS-CoV-2.aspx.

  • MLA

    Meštrović, Tomislav. "les écrans de la Génome-écaille CRISPR indiquent exactement les composés antiviraux prometteurs contre SARS-CoV-2". News-Medical. 26 September 2021. <https://www.news-medical.net/news/20210607/Genome-scale-CRISPR-screens-pinpoint-promising-antiviral-compounds-against-SARS-CoV-2.aspx>.

  • Chicago

    Meštrović, Tomislav. "les écrans de la Génome-écaille CRISPR indiquent exactement les composés antiviraux prometteurs contre SARS-CoV-2". News-Medical. https://www.news-medical.net/news/20210607/Genome-scale-CRISPR-screens-pinpoint-promising-antiviral-compounds-against-SARS-CoV-2.aspx. (accessed September 26, 2021).

  • Harvard

    Meštrović, Tomislav. 2021. les écrans de la Génome-écaille CRISPR indiquent exactement les composés antiviraux prometteurs contre SARS-CoV-2. News-Medical, viewed 26 September 2021, https://www.news-medical.net/news/20210607/Genome-scale-CRISPR-screens-pinpoint-promising-antiviral-compounds-against-SARS-CoV-2.aspx.