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Mutaciones distintas de la proteína del pico en la variante SARS-CoV-2 en Rusia

El coronavirus 2 (SARS-CoV-2), el agente causativo de la neumonía asiática para el coronavirus 2019 pandémicos (COVID-19), tiene duró para aproximadamente un año y medio, con sobre 173 millones de infecciones denunciadas por todo el mundo.

A pesar de detectar y determinar un gran número de series y de variantes genéticas desde el comienzo del pandémico, los científicos todavía hacen frente al reto de determinar nuevas variantes de la preocupación.

Las variantes genéticas de la preocupación incluyen el Reino Unido (20I/501Y), el Brasil (20J/501Y.V3), y Suráfrica (20H/501Y.V2).

Además, una variante nueva ha sido caracterizada recientemente por los investigadores de Rusia en los virus del gorrón. La variante, primero descubierta en enero de 2021 en Rusia del noroeste, es caracterizada por mutaciones distintas de la proteína del pico.

Genética de SARS-CoV-2

La información disponible sobre diversidad genética de SARS-CoV-2 en Rusia es relativamente conservadora porque solamente un número limitado de series se ha cargado por teletratamiento a las bases de datos genéticas tales como NCBI GenBank y GISAID.

La base de datos GISAID ha contorneado que las variantes genéticas mas comunes de Rusia pertenecen al clade 20B.

El virus SARS-CoV-2 consiste en los genes tales como S, E, M y N, que codifican las proteínas estructurales, con las regiones del ORF 1a y del ORF 1b codificando las proteínas no-estructurales incluyendo 3 quimotripsina-como la proteasa, papaína-como la proteasa, y la polimerasa de ARN ARN-relacionada.

La proteína de S incluye un N-término extracelular, un dominio de la transmembrana en la membrana viral y un C-término intracelular corto; esta proteína puede experimentar el cambio estructural cuando el virus SARS-CoV-2 obra recíprocamente con la célula huesped, permitiendo al virus fundir con la membrana de la célula huesped.

Los autores de este papel describen los resultados de dos series del genoma realizadas durante estudios rutinarios de la diversidad genética de las variantes encontradas en Rusia del noroeste, que se han encontrado para ser genético diferentes cuando están comparadas al gen que codifica la proteína del S de los virus.

Conclusión

El análisis de las series genéticas obtenidas ilustra mutaciones distintas en dos series situadas en el gen de la glicoproteína del pico. Estas mutaciones ambas incluyen una supresión de 27 nucleótidos en las posiciones 21,967-21,993 y una inserción de 12 nucleótidos en las posiciones 23,598-23,599.

Modelo estructural de la proteína de la variante SARS-CoV-2 S, deformación SPb-117 (nanovatio), sobre la base del PDB:estructura 7cwu.1 [24]. Las flechas negras indican las posiciones de las mutaciones principales de la deformación descrita: la supresión de nueve aminoácidos, C136_Y144del (residuos numerados deformación Wuhan-Hu-1); y la inserción de cuatro aminoácidos, N679delinsKGIAL. Mentira de ambas mutaciones en las regiones que resaltan de la cadena del aminoácido.
Modelo estructural de la proteína de la variante SARS-CoV-2 S, deformación SPb-117 (nanovatio), sobre la base del PDB: estructura 7cwu.1 [24]. Las flechas negras indican las posiciones de las mutaciones principales de la deformación descrita: la supresión de nueve aminoácidos, C136_Y144del (residuos numerados deformación Wuhan-Hu-1); y la inserción de cuatro aminoácidos, N679delinsKGIAL. Mentira de ambas mutaciones en las regiones que resaltan de la cadena del aminoácido.

La característica distintiva principal de la variante rusa del noroeste es una diferencia en la composición de aminoácido de la proteína de S, sin embargo, estos cambios no afectan a la estructura total de la proteína.

Además, otros análisis han revelado las mutaciones que afectaron a los sitios de la hendidura del variable, afectando a su asiento en la célula huesped, así como a las mutaciones que afectaban a la vesícula clathrin-revestida, que pudo haber afectado al asiento viral.

La importancia de la formación clathrin-revestida de la vesícula miente en su papel destacado en el tráfico vesicular que alcanza la división endosomal. El atascamiento del virus a la enzima angiotensina-que convierte 2 (ACE2) habilita la formación de huecos clathrin-revestidos; esto es importante para el endocytosis clathrin-mediado usado por SARS-CoV-2, según lo confirmado por un estudio 2021 mencionado en este papel.

La investigación describe la identificación de una nueva, sin descripción previa variante SARS-CoV-2, que hemos llamado la variante del noroeste (variante del nanovatio). A la luz de las diferencias importantes en la región exterior de la proteína de S, puede ser asumido que las propiedades de la variante del nanovatio serán importante diferentes de las de las otras variantes. Así, la variante del nanovatio pudo ser una variante de la preocupación (VOC). Sin embargo, esta suposición necesita más riguroso ser examinada.

La caracterización de esta variante rusa del noroeste nueva es integral para los gastos de conservación de la investigación global en variantes emergentes de la comunidad de la ciencia para entender y tratar competente la infección efectivo. Estas mutaciones genéticas habilitan más conocimiento en cómo los trabajos del virus y de qué maneras están transformando las variantes el virus de la base. Informará a la investigación vacunas y la terapéutica nueva que se puede hacer para asegurarse estas mutaciones genéticas también se considera.

Los investigadores han mostrado cómo las mutaciones genéticas de dos series SARS-CoV-2 afectan al gen de la proteína del pico, que puede cambiar la afinidad del receptor a ACE2.

Journal reference:
  • Gladkikh, A., Dolgova, A., Dedkov, V., Sbarzaglia, V., Kanaeva, O., Popova, A. and Totolian, A., 2021. Characterization of a Novel SARS-CoV-2 Genetic Variant with Distinct Spike Protein Mutations. Viruses, 13(6), p.1029. https://www.mdpi.com/1999-4915/13/6/1029
Marzia Khan

Written by

Marzia Khan

Marzia Khan is a lover of scientific research and innovation. She immerses herself in literature and novel therapeutics which she does through her position on the Royal Free Ethical Review Board. Marzia has a MSc in Nanotechnology and Regenerative Medicine as well as a BSc in Biomedical Sciences. She is currently working in the NHS and is engaging in a scientific innovation program.

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