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Les tensions SARS-Cov-2 en pleine évolution peuvent provoquer des variantes d'évasion

Le nombre de variantes COVID-19 se développe rapidement, tellement que l'écaille et l'étendue de la mutation peuvent constituer un danger à l'utilisation couronnée de succès continue des vaccins et des traitements actuels.

Les découvertes, par une équipe internationale qui inclut des chercheurs d'Université de Californie, sont publiées dans l'édition de juin du médicament moléculaire pair-observé du tourillon EMBO. Le rythme de la variation des souches virales SARS-CoV-2 effectue tout simplement le danger que les tensions neuves en pleine évolution pourraient provoquer des variantes d'évasion, capables de limiter l'efficacité des vaccins, des traitements, et des tests diagnostique.

« Tandis qu'il y avait seulement environ 10 mutations dominantes du virus mondial en avril 2020, leur numéro avait monté à approximativement 100 mutations avant le printemps, 2021, » a dit M. Christina Ramirez, école de mise en place d'UCLA du professeur de santé publique de la Biostatistique et d'un auteur de Co-fil de l'étude, qui a examiné des mutations dans les séquences d'ARN SARS-CoV-2 d'isolement entre janvier 2020, et mars 2021.

Tout au long de 2020 et dans le premier trimestre de 2021, plus de mutations ont été trouvées et rapidement en association propagées, en dépit des lockdowns et d'autres efforts de contenir l'écart. La vitesse par laquelle le virus s'est déplacé, même pendant des lockdowns, met l'accent sur la difficulté en supprimant la boîte de vitesses des virus respiratoires hautement contagieux. »

M. Christina Ramirez, professeur, Biostatistique, école de mise en place d'UCLA de la santé publique

L'équipe de recherche, composée des scientifiques de l'UCLA ; l'Université de Californie, Davis ; et université de Friedrich-Alexandre (FAU) et l'université de Cologne en l'Allemagne, les mutations étudiées et les variantes d'isolement les Etats-Unis, en l'Inde, le Brésil, la Russie, le Royaume-Uni, la France, l'Espagne, l'Allemagne, l'Afrique du Sud, et Chine.

L'équipe définit des variantes pendant que des virus avec un ensemble spécifique de mutations, et par cette mesure, alors que jusqu'en avril 2020, seulement environ 10 mutations étaient répandues, au moins 77 - et probablement autant d'en tant que 100 mutations neuves - étaient trouvées jusqu'en janvier 2021.

« Fin avril de cette année, nous avons suivi la décomposition de l'infection SARS-CoV-2 en Inde avec plus de 353.000 cas et les 2.812 morts par jour - le nombre le plus élevé de cas a jamais enregistré mondial, » a dit M. co-auteur Stefanie Weber, avec le FAU. « Les variantes de virus connues jusqu'à présent ont pu être plus contagieuses et potentiellement plus de pathogène que le virus originel de Wuhan. »

En tant que juste un exemple cité dans l'analyse (publiée en tant que « réplication SARS-Cov-2 mondiale pilote l'augmentation et le choix rapides des mutations en travers du génome viral : Une étude de Temps-Cours - le défi potentiel pour des vaccins et des traitements »), la soi-disant variante BRITANNIQUE, également connue sous le nom de B.1.1.7 ou alternativement VOC202012/01 maintenant connu sous le nom d'alpha, a été recensé la première fois en Angleterre en septembre 2020.

En décembre, il était rapporté comme variante rapidement de propagation de préoccupation qui a eu 14 mutations au total. Cette variante a été associée à un transmissibility plus élevé et au moins à un cas confirmé de réinfection. Le 23 décembre 2020, la période du lockdown, la variante a été trouvée dans trois pays. À partir du 5 avril, on l'a trouvé dans 108.

« Ce procédé continue et, en dépit de la campagne vaccinique, pourrait se développer davantage s'il n'est pas possible de refouler l'écart assez rapidement, » a dit M. Walter Doerfler, avec l'institut pour la virologie, l'université Erlangen-Nürnberg de Friedrich-Alexandre et l'institut de la génétique, université de Cologne.

« Cependant, il est encore inconnu si l'infection avec certains mutants de coronavirus soient particulièrement liées au type et à la gravité de maladie COVID-19. Un autre aspect d'intérêt que nous avons poursuivi trouvait cela entre 40 et 70% des mutations SARS-CoV-2 neuves se produisant dans les 10 pays vérifiés étaient la cytidine (c) aux passages de l'uridine (NSC).

Apparemment, cette perte de résidus de C dans le génome viral a semblé être contrecarrée environ de 20% de guanosine (G) ou de mutations de C à l'adénosine (a) ou aux résidus d'U. Nous sommes encore déconcertés par les interactions compliquées de la mutagénèse dirigée et du choix des mutants SARS-CoV-2. »

Donné combien reste inconnu au sujet de COVID-19, et les risques d'autres de mutations et de variantes, les auteurs a dit que les agences de santé publique doivent affecter des moyens pour la recherche en profondeur et actuelle ; particulièrement important suit le potentiel pour des mutations en travers de l'intégralité du génome viral SARS-CoV-2, y compris des fonctionnements de réplication, les protéines variées de tout le virus, et le génome viral.

« Nos documents de travail la vitesse et le pouvoir du choix du mutant SARS-CoV-2, qui consécutivement peut réduire l'efficacité des traitements et des vaccins de COVID, » ont indiqué M. co-auteur Barbara Weiser, un spécialiste des maladies infectieuses chez Uc Davis. « L'ordonnancement moléculaire de Covid-19 pour trouver les mutants neufs et les variantes doit continuer afin d'optimiser la demande de règlement et la prévention de SARS-CoV-2. »

M. Harold Burger, aussi un médecin de co-auteur et de maladie infectieuse d'Uc Davis a ajouté que « idéalement, l'ordonnancement moléculaire devrait comprendre des virus des personnes asymptomatiques et doux mauvaises avec un éventail des âges en plus des spécimens obtenus à partir des patients plus malades.

Les personnes asymptomatiques peuvent et transmettent le virus à d'autres. Le degré de maladie est une conséquence de l'état du patient, non seulement un fonctionnement du virus. Cette approche fournira des données de valeur sur l'évolution et l'écart de l'épidémie. »

Source:
Journal reference:

Weber, S., et al. (2021) SARS-CoV-2 worldwide replication drives rapid rise and selection of mutations across the viral genome: a time-course study – potential challenge for vaccines and therapies. EMBO Molecular Medicine. doi.org/10.15252/emmm.202114062.