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La ricerca identifica i casi mancanti COVID-19 per la prova retrospettiva dei tamponi della gola

La ricerca pubblicata oggi nel giornale della virologia generale ha identificato i casi mancanti di SARS-CoV-2 dalla prova retrospettiva dei tamponi della gola.

I ricercatori all'università di Nottingham hanno schermato 1.660 esemplari diagnostici sistematici che erano stati raccolti ad un ospedale di Nottingham fra il 2 gennaio e l'11 marzo 2020 ed erano stati provati a SARS-CoV-2 dalla PCR. Allo stadio attuale della pandemia, c'erano prove pochissime COVID-19 disponibili in ospedali e qualificare i pazienti ha dovuto rispondere ad un criterio rigoroso, compreso il viaggio recente ai paesi sicuri in Asia o contatto con un caso positivo conosciuto.

Tre casi precedentemente non identificati dell'infezione SARS-CoV-2 sono stati identificati tramite la selezione retrospettiva, compreso una da una femmina di 75 anni di cui il tampone positivo è stato raccolto il 21 febbraio 2020. Questo paziente, citato come paziente 1, è morto il 3 marzo; i due giorni prima della prima morte ufficiale da COVID-19 sono stati registrati nel Regno Unito. Il paziente 1 recentemente non aveva viaggiato all'estero o non era stato in contatto con chiunque conosciuto per avere COVID-19 ed in modo da non si è qualificato per una prova di PCR allora. Oltre ad essere la prima morte, i ricercatori credi che il paziente 1 sia egualmente il caso descritto più in anticipo della trasmissione della comunità nel Regno Unito.

Ulteriori casi neo-identificati si sono presentati in un maschio di 64 anni e un maschio di 66 anni, entrambi i quali dati segni delle infezioni toraciche ed entrambi i quali recuperati. I campioni sono stati raccolti il 2 marzo e il 8 marzo 2020 rispettivamente. Il viaggio internazionale è stato eliminato soltanto come un criterio essenziale per un SARS-CoV-2 prova il 12 marzo 2020.

Il gruppo di ricerca ha collaborato con il consorzio BRITANNICO di genomica COVID-19 (COG-UK) per ordinare gli isolati SARS-CoV-2 raccolti dai tamponi utilizzati nello studio e per trovare la prova della trasmissione della comunità a Nottingham già febbraio 2020. Con questi dati di sequenza del genoma, il gruppo ha identificato le introduzioni multiple del virus in Nottingham durante alla fine di febbraio ed il mese di marzo, molti di cui erano uno stirpe distinto del virus che ha dominato le fasi in anticipo dello scoppio all'interno della regione.

Sulla base dei risultati, i ricercatori suggeriscono che provare dovrebbero essere messe a disposizione dei pazienti ricoverati con i sintomi compatibili ma nessuna cronologia di viaggio più presto nella risposta pandemica.

Source:
Journal reference:

Chappell, J.G., et al. (2021) Retrospective screening of routine respiratory samples revealed undetected community transmission and missed intervention opportunities for SARS-CoV-2 in the United Kingdom. Journal of General Virology. doi.org/10.1099/jgv.0.001595.