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Os pesquisadores criam o atlas o mais detalhado do transcriptome humano

Junto com a faculdade de Baylor da medicina e da empresa arranjando em seqüência de condução do mundo, Illumina, pesquisadores na universidade de Ghent construiu um dos catálogos os mais detalhados do transcriptome humano nunca. Inteligente combinando técnicas arranjando em seqüência complementares aprofundaram nossa compreensão da função de moléculas conhecidas do RNA e de milhares descobertos de RNAs novo. Uma compreensão melhor de nosso transcriptome é essencial compreender melhor processos da doença e descobrir os genes novos que podem servir como alvos ou biomarkers terapêuticos.

O artigo “o atlas do RNA expande o catálogo da não-codificação humana RNAs”, publicado hoje na biotecnologia da natureza, é o resultado de mais de cinco anos de trabalho duro para desembaraçar mais a complexidade do transcriptome humano. Um esforço tão detalhado foi empreendido nunca antes para caracterizar todas as RNA-moléculas em pilhas humanas e em tecidos.

RNAs em todas as formas e tamanhos

Nosso transcriptome é - análogo a nosso genoma - a soma de todas as moléculas do RNA que são transcritas das costas do ADN que compo nosso genoma. Contudo, não há nenhum relacionamento 1 on-1 com os últimos. Em primeiro lugar, cada pilha e tecido têm um transcriptome original, com a produção do RNA e as composições de variação, incluindo RNAs tecido-específico. Em segundo lugar, não todo o RNAs é transcrito - codificação da proteína - dos genes típicos que produzem eventualmente proteínas. Muitas de nossas moléculas do RNA não são usadas como um molde para construir proteínas, mas originam do que foi chamado uma vez sucata ADN: seqüências longas do ADN com funções desconhecidas.

Estes não-codificação RNAs (ncRNAs) vêm em todos os tipos das formas e dos tamanhos: curto, por muito tempo, e mesmo RNAs circular. Muitos deles mesmo falta a cauda das adenina-moléculas que é típica para a proteína-codificação RNAs.

300 tipos da pilha humana e do tecido e três métodos arranjando em seqüência

Houve outros projectos para catalogar nosso transcriptome mas o projecto do RNA-Atlas é original devido aos métodos arranjando em seqüência aplicados. Não somente nós olhamos o transcriptome do tanto como como 300 tipos da pilha humana e do tecido, mas mais importante ainda, nós fizemos assim com três tecnologias arranjando em seqüência complementares, um RNAs pequeno visado, um (polyA) RNAs polyadenylated visado e uma técnica chamada RNA total que arranja em seqüência.”

Pieter Mestdagh, professor, centro para a genética médica, universidade de Ghent

Esta última tecnologia arranjando em seqüência conduziu à descoberta dos milhares de genes novos do RNA da não-codificação, incluindo uma classe nova de únicos genes non-polyadenylated do exon e muito RNAs circular novo. Combinando e comparando os resultados dos métodos arranjando em seqüência diferentes os pesquisadores podiam definir para cada transcrito medido do RNA, a abundância nas pilhas diferentes e tecidos, se tem uma polyA-cauda ou não (parece que aquele para alguns genes esta pode diferir do tipo da pilha ao tipo da pilha), e se é linear da circular.

Além disso, o consórcio procurarou e encontrou indícios importantes em determinar a função de alguns dos ncRNAs. Olhando o abundancy do RNA diferente em tipos diferentes da pilha encontraram as correlações que indicam funções reguladoras, e puderam determinar se este regulamento acontece no nível da transcrição (impedindo ou estimulando a transcrição de genes da codificação da proteína) ou cargo-transcricional (por exemplo dividindo RNAs).

Um recurso inestimável para a ciência biomedicável

Todos os dados, análises e resultados (equivalentes a algumas bibliotecas da informação) estão disponíveis para a transferência e a interrogação no portal da web R2, permitindo a comunidade de executar este recurso como uma ferramenta para a exploração da biologia e da função do RNA da não-codificação.

Prof. Pavel Sumazin da faculdade de Baylor da medicina: “Combinando todos os dados em um catálogo detalhado, nós criamos um recurso valioso novo para os cientistas biomedicáveis em todo o mundo que estudam processos da doença. Uma compreensão melhor da complexidade do transcriptome é certamente essencial compreender melhor processos da doença e descobrir os genes novos que podem servir como alvos ou biomarkers terapêuticos. A idade da terapêutica do RNA está aumentando rapidamente - nós todos testemunhamos a criação impressionante de vacinas do RNA, e já as primeiras medicinas que o RNA do alvo está usado na clínica. Eu sou certo que nós veremos lotes mais destas terapias nos próximos anos e décadas.”

Source:
Journal reference:

Lorenzi, L., et al. (2021) The RNA Atlas expands the catalog of human non-coding RNAs. Nature Biotechnology. doi.org/10.1038/s41587-021-00936-1.