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L'iniziativa di Chan Zuckerberg annuncia quasi $28 milioni per il proteomics visivo

Oggi, l'iniziativa di Chan Zuckerberg (CZI) ha annunciato quasi $28 milioni nelle concessioni per supportare gli sviluppi tecnologici che permetteranno che i ricercatori vedano i funzionamenti interni delle celle a risoluzione quasi-atomica con microscopia elettronica di prossima generazione. CZI egualmente ha lanciato una nuova opportunità di finanziamento di supportare i progetti di sviluppo alimentabili per la piattaforma di analisi sulla base di immagini di napari, uno strumento comunità costruito, basato a pitone, di open source per la ricerca a scansione, l'annotazione ed analizzare di grandi immagini multidimensionali.

Le frontiere di iniziativa della rappresentazione, parte di più vasto programma della rappresentazione di CZI, supporta lo sviluppo delle tecnologie dell'immagine perturbarici che connettono i disgaggi biologici attraverso gli organi, celle e proteine, permettendo che i ricercatori direttamente prevedano i trattamenti biologici alla risoluzione ed al contesto necessari ottenere una comprensione meccanicistica della salubrità e della malattia.

I 14 beneficiari selezionati dalla richiesta visiva di Proteomics per le applicazioni (RFA) lavoreranno ai 2 progetti della tecnologia 1/2-year che permetteranno che i ricercatori ottengano le visualizzazioni senza precedenti della struttura, della quantità, della distribuzione e delle interazioni di proteine in celle. I progetti comprendono i miglioramenti al hardware della rappresentazione, allo sviluppo di software, all'indicatore luminoso correlativo ed alla microscopia elettronica e la rappresentazione sonda.

Ottenere le visualizzazioni ad alta definizione delle proteine nel loro ambiente cellulare è un punto chiave a guadagnare una migliore comprensione di come le celle funzionano negli stati normali e malati ed a creare le terapie più efficaci. Siamo emozionanti affinchè questi scienziati di talento sviluppiamo le nuove tecnologie dell'immagine per avanzare il proteomics visivo.„

Cori Bargmann, testa di scienza, iniziativa di Chan Zuckerberg

In un secondo progetto, CZI sta lanciando le concessioni alimentabili RFA dell'acceleratore di napari, che mira a generare un ecosistema alimentabile estendibile ed a consentire l'accesso facile all'analisi riproducibile e quantitativa di bioimage. L'aumento del pitone come piattaforma principale per la computazione e l'apprendimento automatico scientifici mostra la promessa per le applicazioni in biomedicina.

Eppure rimane difficile affinchè i biologi approfitti di ultimi sviluppi nell'analisi quantitativa in profondità imparare-permessa a a causa di una mancanza di strumenti di analisi e di visualizzazione che possono supportare la microscopia moderna ed i grandi gruppi di dati della rappresentazione. Per indirizzare questa sfida, i partner di CZI con il napari, uno strumento fondamentale di visualizzazione che consente l'accesso all'analisi specifica del dominio con i plugin del pitone si sono sviluppati, mantenuto e di supporto dalla comunità bioimaging.

“Vogliamo identificare e strumenti di supporto che sono buoni modelli delle pratiche dello sviluppo di software libero per una comunità crescente dei rivelatori alimentabili accademici,„ ha detto la scienza Product Manager Justin Kiggins di CZI. “In costruzione questo ecosistema degli strumenti di analisi sulla base di immagini, stiamo cercando i grandi esempi che i rivelatori possono guardare per ad inspirazione--da qualità di codice, alla compatibilità con altri strumenti nell'ecosistema scientifico del pitone, a potenziale per impatto nei campi gradisca il neurodegeneration e la biologia unicellulare.„

Per determinare lo sviluppo dell'ecosistema crescente dei napari dei plugin per analisi sulla base di immagini e per supportare la manutenzione dei plugin, CZI invita le domande di concessioni di $20.000 o di $50.000 che permetterebbero ai rivelatori di convertire uno strumento attuale di analisi sulla base di immagini in plugin di napari; sostenga e continui lo sviluppo di un plugin attuale di napari; o infrastruttura fondamentale di configurazione per altri rivelatori alimentabili. Impari circa il gruppo dell'alfa degli sviluppatori di software che creano i plugin per il napari.