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La protéine de Radars à ouverture synthétique-CoV N obtient la production d'IFN-β en provoquant l'ubiquitination de RIG-I, découvertes étudient

Beaucoup de membres de la famille de Coronaviridae tels que le syndrome respiratoire de Moyen-Orient (MERS), le syndrôme respiratoire aigu sévère (SARS), et le coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de syndrôme respiratoire aigu sévère sont connus pour être des dangers à la santé publique. Cependant, parmi tous les coronaviruses (CoVs), SARS-CoV-2, qui est l'agent causal de la pandémie actuelle de la maladie 2019 de coronavirus (COVID-19), a été identifié comme CoV le plus infectieux. Mondial, SARS-CoV-2 a déjà prétendu plus de 3,8 millions de durées.

La recherche précédente a indiqué que CoVs sont à boîte de vitesses hétérospécifique encline. Par conséquent, la collecte de plus d'information concernant CoVs animal est indispensable de prévoir de futures manifestations de CoV et d'éviter des événements zoonotiques de boîte de vitesses.

Étude : Une analyse comparative des protéines de Nucleocapsid de coronavirus (n) indique la protéine de SADS-CoV N contrarie la production d'IFN-β en induisant Ubiquitination de RIG-I.  Crédit d'image : Design_Cells/Shutterstock.com

Quel est SADS-CoV ?

Les chercheurs ont récent indiqué le syndrome-CoV aigu de diarrhée (SADS) de porcs, qui appartient au genre Alphacoronavirus, comme agent pathogène nouvel qui entraîne la diarrhée en porcelets nouveau-nés. SADS-CoV, qui est également connu comme alphacoronavirus entérique de porcs (SeACoV), a eu des taux de mortalité rapportés au-dessus de 35% en Chine du sud pendant une manifestation 2017.

Indépendamment de SADS-CoV, quatre CoVs plus porcin ont été recensés jusqu'à présent ; à savoir, virus transmissible de gastro-entérite (TGEV), virus hemagglutinating porcin d'encéphalomyélite (PHEV), virus épidémique porcin de diarrhée (PEDV), et coronavirus porcin de triangle (PDCoV). Pendant que SADS-CoV est étroitement lié pour manier la batte des tensions de CoV HKU2, les scientifiques croient que cette tension a apparu en raison des cas de chassoir génétique ou de recombinaison entre CoVs de Co-infection.

Les études génomiques ont prouvé que SADS-CoV comporte une séquence génétique qui se compose de quatre protéines de structure, sept cadres de lecture ouverts d'indépendant (ORFs) qui codent seize protéines non-structurelles, et une protéine annexe, qui est assimilée à celle ce qui est présente dans les beaucoup CoVs. Hors des quatre protéines de structure, la protéine du nucleocapsid (n) contient une séquence génomique fortement économisée qui est hautement exprimée. La protéine de N joue un rôle dans le viral infection et est également impliquée dans la transcription subgenomic d'acide ribonucléique (ARN), la réplication de génome viral, et son interaction avec d'autres protéines pour supporter l'ensemble de virion.

La réaction immunitaire à SADS-CoV

Les études précédentes ont proposé que la protéine de SADS-CoV N soit impliquée dans l'évasion du virus de la réaction immunitaire innée de l'hôte, qui est la première ligne de défense du fuselage contre les agents pathogènes nuisibles. De plus, la voie de signalisation de l'interféron du type I (IFN) joue un rôle majeur en protégeant l'hôte contre le viral infection, qui comprend l'identification primaire des configurations moléculaires agent-associées (PAMPs) par des récepteurs de reconnaissance des formes (PRRs).

Comme l'autre produit PAMPs de virus ARN, de CoVs comprenant l'ARN bicaténaire (ARN à double brin) et 5 le ′ - clichés intermédiaires d'ARN de PPA dans le cytoplasme pendant la réplication. Ces PAMPs sont alors recensés par des récepteurs de reconnaissance des formes d'hôte (PRRs) tels que les récepteurs comme acide-inductibles rétinoïques du gène I (RIG-I) (RLR). La reconnaissance de goujon et l'activation de RIG-I et/ou de gène différenciation-associé 5 (MDA5) de mélanome mènent à leur interaction avec des domaines d'activation et de recrutement de caspase (cartes).

Par la suite, des polymères comme un prion sont formés, qui stimule l'en aval
Kinase obligatoire 1 (TBK1) de BIDON et inhibiteur de kinase-ϵ de κB (IKKϵ). L'activation de TBK1 mène à la phosphorylation du facteur de déclenchement 3 (IRF3) d'interféron qui, consécutivement, introduit la production du type I IFNs. Ceci mène éventuel à l'expression des centaines de gènes IFN-stimulés (ISGs).

Des ISG sont exprimés d'une façon d'autocrine et de paracrine dans un effort pour protéger la cellule hôte contre l'invasion virale. En dépit de ces défenses innées, les virus peuvent souvent évoluer pour éluder les défenses de cellule hôte. Par exemple, plusieurs CoVs peut empêcher des réactions de l'hôte IFN pendant l'infection.

Une étude récente publiée dans les frontières en immunologie se concentre sur les rôles de la protéine de SADS-CoV N dans l'élimination d'IFN pendant l'infection. Dans cette étude, chercheurs comparés les similitudes acides aminées entre les protéines de N de CoVs varié appartenant à quatre genres différents. Les objectifs de chaque protéine de N liée à la signalisation d'IFN sont également discutés. Le mécanisme de l'inhibition d'IFN a été déterminé utilisant la protéine de SADS-CoV N par l'intermédiaire de l'analyse comparative.

Compréhension du rôle de la protéine de N dans SADS-CoV

Les chercheurs de cette étude ont indiqué que pour l'élimination de la signalisation d'IFN, l'opération de reconnaissance de PAMP est un objectif critique pour la protéine de N. À cet effet, l'interaction entre la protéine de SADS-CoV N et le RIG-I déclenche l'ubiquitination, qui introduit la dégradation protéasome-dépendante. Ceci mène à l'élimination des réactions de l'IFN de l'hôte.

Cette étude a également évalué plusieurs protéines de N de SADS-CoV pour évaluer leur capacité d'empêcher la réaction d'IFN. Éventuel, les chercheurs ont constaté que l'inhibition de cette réaction ne dépend pas de la similitude de séquence des acides aminés. Par exemple, il y a une similitude de l'acide aminé 91,2% entre SARS-CoV-2 et Radars à ouverture synthétique-CoV. Cependant, en termes de mécanismes au jeu pour SARS-CoV-2, la protéine de N pourrait empêcher l'activité du promoteur d'IFN, qui est autrement induit par RIG-I, MAVS, TBK1, et IKKϵ, alors que la protéine de Radars à ouverture synthétique-CoV N n'a pas fait ainsi.

Un tel résultat met en valeur l'importance de la structure tertiaire en définissant le fonctionnement de protéine. Là reste un écartement dans la recherche actuelle dans une compréhension complète de la structure tertiaire de la protéine de CoV N. Tandis que ceci peut être vrai, les caractéristiques sur des structures du domaine terminal de N (NTD) et du domaine terminal de C (CTD) des protéines variées de CoV N sont actuellement disponibles.

Traiteurs d'étude

Le résultat de la recherche actuelle est en conformité avec des états précédents. À cet effet, les études précédentes ont prouvé que la protéine de N dans PEDV provoque des réactions de l'hôte IFN par l'interaction avec TBK1 directement. Supplémentaire, la protéine de N de Radars à ouverture synthétique-CoV agit l'un sur l'autre directement ou indirectement avec TRIM25 et l'activateur de protéine de la protéine kinase R (PACTE) pour activer RIG-I.

La recherche actuelle a également proposé que la protéine de N des objectifs de SADS-CoV les premières étapes de la réaction d'IFN et peut directement nuire l'activation de RIG-I. Cette analyse comparative a également expliqué que l'interférence utilisant RIG-I pourrait être la principale méthode pour la protéine de N de SADS-CoV pour supprimer la signalisation équipement Équipement Je du récepteur (RLR). Cette étude a observé que la protéine de SADS-CoV N vise RIG-I pour empêcher l'activité de promoteur d'IFN-β.

Journal reference:
Dr. Priyom Bose

Written by

Dr. Priyom Bose

Priyom holds a Ph.D. in Plant Biology and Biotechnology from the University of Madras, India. She is an active researcher and an experienced science writer. Priyom has also co-authored several original research articles that have been published in reputed peer-reviewed journals. She is also an avid reader and an amateur photographer.

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