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A proteína de SARS-CoV N induz a produção de IFN-β provocando o ubiquitination de RIG-I, achados estuda

Muitos membros da família de Coronaviridae tais como a síndrome respiratória de Médio Oriente (MERS), a Síndrome Respiratória Aguda Grave (SARS), e o coronavirus 2 da Síndrome Respiratória Aguda Grave (SARS-CoV-2) são conhecidos para ser ameaças à saúde pública. Contudo, entre todos os coronaviruses (CoVs), SARS-CoV-2, que é o agente causal da pandemia em curso da doença 2019 do coronavirus (COVID-19), foi reconhecido como o CoV o mais infeccioso. Global, SARS-CoV-2 tem reivindicado já mais de 3,8 milhão vidas.

A pesquisa precedente revelou que CoVs é transmissão inclinada das cruz-espécies. Conseqüentemente, a coleção de mais informação em relação a CoVs animal é vital prever as manifestações futuras de CoV e impedir eventos zoonotic da transmissão.

Estudo: Uma análise comparativa de Coronavirus Nucleocapsid (N) as proteínas revelam a proteína de SADS-CoV N contrariam a produção de IFN-β induzindo Ubiquitination de RIG-I.  Crédito de imagem: Design_Cells/Shutterstock.com

Que é SADS-CoV?

Os pesquisadores têm revelado recentemente a síndrome-CoV aguda da diarreia (SADS) dos suínos, que pertence ao género Alphacoronavirus, como um micróbio patogénico novo que causasse a diarreia em leitão recém-nascidos. SADS-CoV, que é sabido igualmente como o alphacoronavirus entérico dos suínos (SeACoV), tinha relatado taxas de mortalidade acima de 35% em China do sul durante uma manifestação 2017.

Independentemente de SADS-CoV, quatro um CoVs mais suíno foram identificados até agora; a saber, vírus transmissível da gastroenterite (TGEV), vírus hemagglutinating suíno da encefalomielite (PHEV), vírus epidémico suíno da diarreia (PEDV), e coronavirus suíno do delta (PDCoV). Porque SADS-CoV é estreitamente relacionado golpear tensões de CoV HKU2, os cientistas acreditam que esta tensão emergiu em conseqüência das ocorrências da tracção genética ou da recombinação entre CoVs decontaminação.

Os estudos Genomic mostraram que SADS-CoV compreende uma seqüência genética que consistisse em quatro proteínas estruturais, sete quadros de leitura abertos do independente (ORFs) que codificam dezesseis proteínas não-estruturais, e uma proteína acessória, que são similar àquela qual esta presente nos muitos CoVs. Fora das quatro proteínas estruturais, o nucleocapsid (N) a proteína contem uma seqüência genomic altamente conservada que seja expressada altamente. A proteína de N joga um papel na infecção viral e é envolvida igualmente na transcrição subgenomic do ácido ribonucléico (RNA), na réplica viral do genoma, e na sua interacção com outras proteínas para apoiar o conjunto do virion.

A resposta imune a SADS-CoV

Os estudos precedentes sugeriram que a proteína de SADS-CoV N estivesse envolvida na evasão do vírus da resposta imune inata do anfitrião, que é a primeira linha do corpo de defesa contra os micróbios patogénicos prejudiciais. Mais, o tipo eu caminho da sinalização da interferona (IFN) jogo um papel importante em proteger o anfitrião contra a infecção viral, que inclui a identificação preliminar de testes padrões moleculars micróbio-associados (PAMPs) pelos receptors do reconhecimento de padrões (PRRs).

Como os outros vírus do RNA, produto PAMPs de CoVs que inclui o RNA dobro-encalhado (dsRNA) e 5 ′ - intermediários do RNA do ppp no citoplasma durante a réplica. Este PAMPs é identificado então pelos receptors do reconhecimento de padrões do anfitrião (PRRs) tais como o gene ácido-inducible retinoic mim (RIG-I) - como os receptors (RLR). O reconhecimento do cargo e a activação de RIG-I e/ou do gene diferenciação-associado 5 da melanoma (MDA5) conduzem a sua interacção com domínios da activação e do recrutamento do caspase (cartões).

Subseqüentemente, prião-como polímeros são formados, que estimula o a jusante
Quinase obrigatória 1 do TANQUE (TBK1) e inibidor da quinase-ϵ do κB (IKKϵ). A activação de TBK1 conduz à fosforilação do factor regulador 3 da interferona (IRF3) que, por sua vez, promove a produção de tipo mim IFNs. Isto conduz finalmente à expressão das centenas de genes IFN-estimulados (ISGs).

Os ISG são expressados em uma maneira do autocrine e do paracrine em um esforço para proteger a pilha de anfitrião da invasão viral. Apesar destas defesas inatas, os vírus podem frequentemente evoluir para iludir as defesas da pilha de anfitrião. Por exemplo, diverso CoVs pode inibir respostas do anfitrião IFN durante a infecção.

Um estudo recente publicado nas fronteiras na imunologia centra-se sobre os papéis da proteína de SADS-CoV N na supressão de IFN durante a infecção. Neste estudo, os pesquisadores compararam as similaridades do ácido aminado entre proteínas de N de vário CoVs que pertence a quatro géneros diferentes. Os alvos de cada proteína de N associada com a sinalização de IFN são discutidos igualmente. O mecanismo da inibição de IFN foi determinado usando a proteína de SADS-CoV N através da análise comparativa.

Compreendendo o papel da proteína de N em SADS-CoV

Os pesquisadores deste estudo revelaram que para a supressão da sinalização de IFN, a etapa do reconhecimento de PAMP é um alvo crítico para a proteína de N. Com tal fim, a interacção entre a proteína de SADS-CoV N e o RIG-I provoca o ubiquitination, que promove a degradação proteasome-dependente. Isto conduz à supressão das respostas do IFN do anfitrião.

Este estudo igualmente avaliou diversas proteínas de N de SADS-CoV para avaliar sua capacidade para inibir a resposta de IFN. Finalmente, os pesquisadores encontraram que a inibição desta resposta não é dependente da similaridade da seqüência de ácido aminado. Por exemplo, há uma similaridade do ácido aminado 91,2% entre SARS-CoV-2 e SARS-CoV. Contudo, em termos dos mecanismos no jogo para SARS-CoV-2, a proteína de N poderia inibir a actividade do promotor de IFN, que é induzido de outra maneira por RIG-I, por MAVS, por TBK1, e por IKKϵ, visto que a proteína de SARS-CoV N não fez assim.

Tal resultado destaca a importância da estrutura terciária em definir a função da proteína. Permanece uma diferença na pesquisa actual em uma compreensão completa da estrutura terciária da proteína de CoV N. Quando isto puder ser verdadeiro, os dados em estruturas do domínio terminal de N (NTD) e do domínio terminal de C (CTD) de várias proteínas de CoV N estão actualmente disponíveis.

Takeaways do estudo

O resultado da pesquisa actual é na linha dos relatórios precedentes. Com tal fim, os estudos precedentes mostraram que a proteína de N em PEDV provoca respostas do anfitrião IFN interagindo com o TBK1 directamente. Adicionalmente, a proteína de N dos SARS-CoV interage directamente ou indirectamente com o TRIM25 e o activador da proteína da quinase de proteína R (PACTO) para activar RIG-I.

A pesquisa actual igualmente sugeriu que a proteína de N de alvos de SADS-CoV os passos iniciais da resposta de IFN e pode directamente interferir com a activação de RIG-I. Esta análise comparativa igualmente demonstrou que a interferência que usa RIG-I pôde ser o método principal para a proteína de N de SADS-CoV a suprimir Equipamento-EU-como a sinalização do receptor (RLR). Este estudo observou que a proteína de SADS-CoV N visa RIG-I para inibir a actividade do promotor de IFN-β.

Journal reference:
Dr. Priyom Bose

Written by

Dr. Priyom Bose

Priyom holds a Ph.D. in Plant Biology and Biotechnology from the University of Madras, India. She is an active researcher and an experienced science writer. Priyom has also co-authored several original research articles that have been published in reputed peer-reviewed journals. She is also an avid reader and an amateur photographer.

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