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La lignée de lambda de SARS-CoV-2 a le potentiel de devenir variante de préoccupation

Les chercheurs ont décrit la première infection rapportée avec la lignée C.37 (lambda) du coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de syndrôme respiratoire aigu sévère au Brésil du sud.

Le virus SARS-CoV-2 est l'agent responsable de la pandémie actuelle de la maladie 2019 de coronavirus (COVID-19). La lignée de lambda a été classifiée comme variante d'intérêt (VOI) par l'Organisation Mondiale de la Santé le 15 juin 2021th.

La variante C.37, qui se trouve en dessous de la lignée B.1.1.1, a déjà été rapportée comme hautement répandu au Pérou et a été également recensée dans beaucoup de pays en travers des Amériques, de l'Europe et de l'Océanie, indique le clin d'oeil de Priscila de l'hôpital de Clínicas de Porto Alegre dans Rio Grande do Sul et collègues.

Cependant, C.37 a seulement été rapporté de temps en temps au Brésil en dépit de son écart global, ajoute l'équipe.

Maintenant, le clin d'oeil et les collègues ont décrit le premier cas de l'infection C.37 au Brésil du sud. Les chercheurs ont découvert huit mutations de définition dans la variante, en plus des 19 mutations qui ont été déjà décrites pour d'autres membres de cette lignée.

« Considérant que ce VOI a été associé aux hauts débits de transmissibility, l'étendre possible dans la communauté brésilienne du sud est une question préoccupante, » ils écrivent.

Une version de prétirage du rapport de recherche est procurable sur le serveur de medRxiv*, alors que l'article subit l'inspection professionnelle.

Les variantes apparaissantes menacent l'efficacité des stratégies du contrôle COVID-19

Depuis que SARS-CoV-2 a été la première fois recensé fin décembre 2019, VOIs neuf et variantes de préoccupation (VOCs) ont apparu avec le transmissibility potentiellement accru et la sensibilité réduite à la neutralisation d'anticorps après l'infection ou la vaccination.

L'émergence de ces lignées peut influencer l'efficacité des stratégies pour régler la pandémie COVID-19.

La variante du roman lambda a été trouvée au Pérou en août 2020 et a été recensée dans 26 autres pays, indique le clin d'oeil et les collègues.

« Cependant, en dépit de l'écart global de la variante de lambda, au Brésil cette lignée était rapportée seulement dans la condition de São Paulo en février 2021, » ils écrivent.

Que les chercheurs ont-ils fait ?

Maintenant, l'équipe a décrit le premier cas rapporté de la variante de SARS-CoV-2 lambda au Brésil du sud.

Un jeune mâle qui avait visité l'Argentine a développé des symptômes respiratoires tout en retournant à sa ville natale dans Rio Grande do Sul, la condition brésilienne la plus la plus au sud.

Il a été admis à un hôpital local deux jours plus tard mais a été puis transféré à l'unité de soins intensifs d'Hospital de Clínicas De Porto Alegre des deux jours plus encore plus tard dus à empirer des sympt40mes.

L'infection avec SARS-CoV-2 a été confirmée par le contrôle inverse en temps réel de réaction en chaîne de transcription-polymérase (RT-PCR) des écouvillons nasopharyngaux et un spécimen a été soumis pour l'ordonnancement d'entier-génome.

Qu'ont-ils trouvé ?

L'ordonnancement des bibliothèques génomiques donnantes droit a indiqué que la variante C.37 est définie par une omission (Δ3675- 3677) dans le cadre de lecture ouvert 1a (ORF1a) de SARS-CoV-2. Les indicatifs de gène d'ORF1a pour une protéine qui subit le clivage protéolytique avant qu'il continue pour préparer les protéines virales nonstructural.

L'omission a été également recensée dans l'alpha variante (B.1.1.7) qui a apparu au R-U, à la bêta variante (B.1.351) qui ont apparu dans le Sud africain, et à la variante (P.1) gamma qui a apparu au Brésil.

La variante de lambda a également contenu une omission nouvelle (Δ246-252) et les mutations nonsynonymous multiples (G75V, T76I, L452Q, F490S, D614G, et T859N) dans le gène qui code la protéine virale de pointe. La pointe est la structure extérieure principale que le virus emploie pour gripper à et pour infecter des cellules hôte.

Les mutations L452Q et F490S sont présentes dans le domaine récepteur-grippant de pointe (RBD), qui négocie le stade de l'infection initial en grippant à l'enzyme de conversion de l'angiotensine 2 (ACE2) de récepteur de cellule hôte.

La mutation de F490S a été précédemment associée à la susceptibilité réduite à la neutralisation d'anticorps, indique le clin d'oeil et les collègues.

Les chercheurs disent cela en plus de ces huit mutations de C.37-defining, 19 mutations étaient également présents qui ont été déjà décrites dans d'autres membres de la lignée.

L'équipe compte que C.37 deviendra une variante de préoccupation

L'équipe dit que la forte prévalence de ce VOI neuf a été déjà décrite au Chili, au Pérou, en Equateur, et en Argentine, où elle est associée aux régimes considérables de la boîte de vitesses de communauté.

« On le croit que la situation de système de santé critique et l'état récent des morts accrues dans ces pays est associée à la prévalence de montée de la variante de lambda, » écrit le clin d'oeil et les collègues.

Les chercheurs disent qu'on ne le connaît pas encore si cette variante est plus transmissible ou plus pathogène que d'autres variantes ou s'il peut échapper à l'immunité vaccin-induite.

« Le roman S : L'omission Δ246-252 et les mutations complémentaires dans la protéine de pointe devraient être tenues compte pour comprendre leurs effets sur la forme physique virale et héberger l'interaction, » ils disent.

« Considérant que ce VOI s'est rapidement étendu au Pérou, en Equateur, au Chili, et en Argentine, nous croyons qu'elle a le potentiel considérable de devenir une variante de préoccupation, » conclut l'équipe.

Avis *Important

le medRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
Sally Robertson

Written by

Sally Robertson

Sally first developed an interest in medical communications when she took on the role of Journal Development Editor for BioMed Central (BMC), after having graduated with a degree in biomedical science from Greenwich University.

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