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El estudio explora los efectos de SARS-CoV-2 (y de otros betacoronaviruses) sobre el tramitación celular del mRNA

El coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de la neumonía asiática es el agente causal del pandémico en curso de la enfermedad 2019 del coronavirus (COVID-19) y se ha determinado como el tercer brote humano del coronavirus del siglo XXI. Aunque predominante un virus respiratorio, SARS-CoV-2 puede afectar a órganos múltiples, incluyendo los riñones, el corazón y el cerebro. El fragmento de la severidad de la enfermedad es también extremadamente diverso, colocando de enfermedad suave a la muerte.

Coronaviruses es de una sola fila, positivo-sentido, y los virus envueltos del ARN que pueden infectar seres humanos y mamíferos. Además de SARS-CoV-2, dos otros betacoronaviruses, que han causado epidemias en las dos décadas pasadas, son el coronavirus de la neumonía asiática (SARS-CoV) en 2003 y el coronavirus respiratorio del síndrome de Oriente Medio (MERS-CoV) en 2012.

Estudio: el empalmar Betacoronavirus-específico del alternado. Haber de imagen: ktsdesign/Shutterstock
Estudio: el empalmar Betacoronavirus-específico del alternado. Haber de imagen: ktsdesign/Shutterstock

Expresión génica de virus

Los virus dependen de la maquinaria celular del ordenador principal para su supervivencia. Pueden alterar los procesos celulares del ordenador principal e inhibir sus reacciones antivirus naturales. Varios virus se han denunciado para obrar recíprocamente con maquinaria que empalmaba celular y para alterar la configuración de empalmar del precursor mRNA (pre-mRNA). Estos splicings causan el retiro de intrones y ensamblar exacto de exones a las moléculas maduras del mRNA de la forma. Los investigadores han explicado que el empalmar normalmente alternativo ocurre en el 95% de genes humanos, y los juegos de este proceso un papel importante en el revelado, la enfermedad, y el envejecimiento. Típicamente, el empalmar de la opción es regulado por las señales de desarrollo o diferenciadas. También se regula vía la reacción a los estímulos externos.

¿Qué suceso cuando las configuraciones que empalman consiguen alteradas por un virus?

El resultado de empalmar de la opción se ha discutido en diversos estudios. Tomando el ejemplo del virus de dengue, la proteína NS5 de los attaches del virus con los componentes de la base del snRNP U5, incorpora sus spliceosomes activos y, de tal modo, inicia el tramitación pre-mRNA. Esto causa cambios en la abundancia de los factores antivirus IKBKE (el inhibidor de la cinasa del κB e) que podría ayudar a la réplica viral. En células huesped, interferon-α/β induce el gen MX1 que codifica una proteína antivirus, inhibiendo la réplica de muchos virus del ARN. En algunos virus, tales como el virus del herpes simple -1 (HSV1) y el virus de dengue, opción que empalma en MX1 ocurre, ayudando al proceso de la réplica del virus bastante que restringiéndolo. El virus de la gripe A produce una proteína que module empalmar del mRNA responsable de la degradación del mRNA que codifica RIG-I. Este gen codifica una proteína cuya función sea descubrir la presencia de RNAs viral.

Previamente, los investigadores han denunciado que SARS-CoV-2 posee por lo menos diez proteínas que puedan atar específicamente con más de un ARN humano. Estas proteínas incluyen seis no-codificaciones estructurales RNAs y 142 mRNAs. Por ejemplo, una acción recíproca altamente específica fue encontrada entre la proteína de SARS-CoV-2 NSP16 y los snRNAs humanos U1 y U2. El empalmar del mRNA del ordenador principal es suprimido por NSP16, una enzima de modificación del casquillo del ARN con actividad del methyltransferase. NSP1 encontrado en socorro de los SARS-CoV y de MERS-CoV en la réplica y juegos virales un papel vital en la traslación y el cambio de inhibición de la proteína del ordenador principal en la traslación. Sobre la infección, NSP8 y NSP9 interfieren con la proteína que trafica a la membrana celular e inhiben la reacción del interferón.

Nueva investigación

Un nuevo estudio se ha liberado en el servidor de la prueba preliminar del bioRxiv*, que se ocupa de un levantamiento topográfico completo en la opción que empalma referente a la infección SARS-CoV-2. Este estudio también ha incluido dos otros betacoronavirurses (los SARS-CoV y MERS), un equipo del mando de virus sin relación, y una bacteria, a saber, estreptococo pulmonía. Las conclusión del estudio sugieren que varios parámetros celulares sean afectados debido a una infección del betacoronavirus, que a su vez afecta a algunos genes e invariable diversas funciones biológicas.

Las personas caracterizaron genes y revelaron la opción que empalmaba en muestras clínicas de los pacientes seriamente infectados COVID-19. Han desarrollado un catálogo que consistía en configuraciones de empalmar alternativo de la importancia potencial. Esto podía ayudar a entender la biología de la infección COVID-19 más sin obstrucción y es la contribución principal del papel.

La investigación actual encontró que 12,6% de genes que experimentan la opción que empalma en tejidos pulmonares son infectados por el virus SARS-CoV-2. Uno de los genes diferenciado empalmados es EGFR, que ayuda en el asiento del virus en las células huesped. IFI16, que es un tipo del interferón (IFN), experimenta empalmar diferenciado. La función principal de la proteína IFI16 es accionar la inmunorespuesta natural. El empalmar alternativo de los isoforms IFI16 en SARS-CoV-2 infectó resultados del tejido pulmonar en un movimiento en isoforms a partir de una región del espaciador a los isoforms con tres copias.

ADAR (deaminases de la adenosina que actúa en el ARN) es una proteína que desempeña un papel importante en inmunorespuestas a las infecciones virales y al cáncer. Esta proteína también juega un papel activo en la supresión inmune y actividad inmune de los balances modificando los caminos antivirus inducidos por el dsRNA. ADAR puede también afectar a la actividad de una proteína CMPK2 (PKR) que desempeñe un papel vital en controlar la transmisión de señales inflammasome en mitocondrias. Además, ADAR regula la producción de IFN y, por lo tanto, tiene un papel protector contra enfermedad autoinflammatory. El estudio actual ha determinado varias asociaciones de los genes afectados por la opción que empalmaba con los complejos ribosomal.

advertencia *Important

el bioRxiv publica los partes científicos preliminares que par-no se revisan y, por lo tanto, no se deben mirar como concluyentes, conduce práctica clínica/comportamiento relativo a la salud, o tratado como información establecida.

Journal reference:
Dr. Priyom Bose

Written by

Dr. Priyom Bose

Priyom holds a Ph.D. in Plant Biology and Biotechnology from the University of Madras, India. She is an active researcher and an experienced science writer. Priyom has also co-authored several original research articles that have been published in reputed peer-reviewed journals. She is also an avid reader and an amateur photographer.

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