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La vaccination COVID-19 peut refouler l'évolution des variantes SARS-CoV-2 « plus en bonne santé »

Les chercheurs les Etats-Unis et en Inde ont présenté la preuve d'abord connue que le transfert de la vaccination de la maladie 2019 de coronavirus (COVID-19) limite les voies évolutionnaires et immunisées d'évasion accessibles au coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de syndrôme respiratoire aigu sévère.

Venky Soundararajan des laboratoires de nference, à Cambridge, le Massachusetts et des collègues a constaté que la diversité des lignées SARS-CoV-2 se baisse au niveau du pays comme des régimes d'augmentation de masse de la vaccination COVID-19.

Les chercheurs ont également constaté qu'avec COVID-19 les patients non vaccinés, les personnes vaccinées qui ont développé les virus hébergés par infection de la découverte SARS-CoV-2 avec la diversité sensiblement inférieure dans les épitopes de cellules de B qui sont accrus après la vaccination.

« Cette étude explique que la vaccination de la masse peut servir d'entrave antigénique à l'évolution du monteur et des variantes plus transmissives SARS-CoV-2, mettant l'accent sur le besoin urgent de refouler l'hésitation vaccinique comme opération principale d'atténuer le fardeau global de COVID-19, » écrit l'équipe.

Une version de prétirage du rapport de recherche est procurable sur le serveur de medRxiv*, alors que l'article subit l'inspection professionnelle.

L'évolution SARS-CoV-2 de compréhension est impérieuse à combattre la pandémie

La réaction immunitaire d'hôte suivant l'infection SARS-CoV-2 est une pression sélectrice principale qui influence l'émergence des souches virales nouvelles.

La « compréhension des tendances longitudinales de l'évolution SARS-CoV-2 et la cartographie de l'horizontal mutationnel de l'antigène est impérieuse pour combattre largement l'universel actuel et de futures manifestations, » dit Soundararajan et collègues.

Le développement rapide des vaccins COVID-19 et du transfert de masse de la vaccination en travers de beaucoup de pays a mené à plus de 800 millions de personnes entièrement étant maintenant immunisées mondial.

Une telle immunisation accélérée d'une grande proportion de la population à la hauteur de la pandémie actuelle a pu de manière significative augmenter la pression évolutionnaire sur le virus SARS-CoV-2, avertissent les chercheurs.

« Cependant il n'y a eu, jusqu'à présent, aucune étude complète sur le choc des efforts globaux de vaccination sur l'évolution SARS-CoV-2, » ils écrivent.

La disponibilité des caractéristiques mondial partagées fournit « une opportunité opportune »

Depuis que la manifestation COVID-19 a commencé la première fois fin décembre 2019, les efforts globaux de partage des informations ont résulté en plus de 1,8 millions de génomes SARS-CoV-2 de 183 pays et territoires étant déposés dans l'initiative globale sur partager la base de données des caractéristiques de grippe aviaire (GISAID) avant mai 2021.

« La disponibilité des caractéristiques génomiques et immunologiques fournit une opportunité opportune de caractériser systématiquement l'horizontal mutationnel antigénique de SARS-CoV-2, » dit Soundararajan et collègues.

Que les chercheurs ont-ils fait ?

Les chercheurs ont réalisé une analyse longitudinale des génomes SARS-CoV-2 procurables dans la base de données de GISAID pour capter les configurations évolutionnaires virales vaccination-associées. Ils ont également exécuté le génome viral ordonnançant pour 23 patients vaccinés avec la découverte COVID-19 et 30 patients COVID-19 non vaccinés.

L'analyse de 1,8 millions de génomes SARS-CoV-2 a indiqué un total de 1.296 lignées virales différentes.

Les génomes SARS-CoV-2 montrent une diversité globale de déclin dans l
Les génomes SARS-CoV-2 montrent une diversité globale de déclin dans l'ordre coïncidant avec la vaccination de masse pour COVID-19. (a) Synthèse schématique d'estimer la diversité génomique (bc) de la diversité SARS-CoV-2 dans les lignées SARS-CoV-2 dans les caractéristiques de GISAID, mesurées utilisant l'entropie de la distribution de probabilité de lignée dans les hublots d'un mois de temps. Les lignes tirées verticales indiquent le temps à l'où les pays ont atteint une couverture vaccinique de 1% de leur population totale. (d) Dispersez le plot montrant la corrélation entre le pourcentage de niveau du pays des personnes entièrement vaccinées (d'OWID21) et l'entropie de la lignée SARS-CoV-2. (e) Distribution du coefficient de corrélation de Pearson entre le pourcentage de niveau du pays des personnes entièrement vaccinées et entropie de la lignée SARS-CoV-2 pour chacun des 25 pays avec plus grand que 25% de leur population entièrement vaccinée (à partir du 26 juin 2021) et au moins 4 mois avec 100 séquences ou plus déposées à GISAID, après début de la vaccination. L'indicatif alpha-3 d'OIN 3166-1 des pays inclus et leur corrélation de Pearson sont indiqués dans le chiffre légende.

De façon saisissante, l'équipe a constaté que la diversité de ces lignées s'est baissée mondial, avec ce déclin semblant coïncider avec le début du transfert de masse de vaccination.

Quand les chercheurs ont analysé la relation entre les régimes de vaccination et l'entropie de lignée dans 25 pays où plus de 25% de la population était entièrement vacciné, ils ont constaté que le déclin dans la diversité de lignée a été en effet marqué avec des plus grands régimes de la vaccination de masse.

En outre, le déclin dans la diversité de lignée a été ajouté à la plus grande dominance des variantes B.1.1.7 (alpha), B.1.1.617 (triangle) et P.1 (gamma) de la préoccupation, proposant que ces variantes puissent être des lignées SARS-CoV-2 « plus en bonne santé ».

Les épitopes de cellules de B ont eu un fardeau mutationnel plus élevé que des épitopes à cellule T

Vu que les vaccins COVID-19 influencent des épitopes de lymphocyte B et de lymphocyte T, l'équipe a analysé la prévalence des mutations dans chaque résidu connu d'épitope.

Ceci a indiqué un fardeau mutationnel plus élevé en neutralisant des épitopes de cellules de B qu'en neutralisant des épitopes à cellule T.

En outre, les variantes de la préoccupation ont contenu plus de mutations dans des épitopes de lymphocyte B que des non-variantes de préoccupation.

L'équipe dit que les résultats proposent que la protéine de la pointe SARS-CoV-2 subisse actuellement la pression motivée par la cellule intense de choix de B, avec des variantes de préoccupation montrant les la plupart des augmentations significatives dans des mutations d'épitope de lymphocyte B.

La protéine virale de pointe est la structure primaire que SARS-CoV-2 emploie pour infecter les cellules hôte et le site principal hébergeant les mutations émergentes qui s'entretiennent le transmissibility accru et l'évasion immunisée qui a été observée pour certaines variantes.

En effet, l'ordonnancement génomique des génomes SARS-CoV-2 des patients COVID-19 a indiqué que les personnes non vaccinées ont partagé sensiblement plus de similitude mutationnelle d'épitope de lymphocyte B avec des variantes de préoccupation que les patients vaccinés qui ont développé une infection de découverte.

Que les auteurs ont-ils conclu ?

« Cette étude présente la preuve d'abord connue que les vaccins COVID-19 limitent principalement les voies évolutionnaires et antigéniques d'évasion accessibles à SARS-CoV-2, » dit Soundararajan et collègues.

Les chercheurs disent qu'alors que l'analyse ne prévoyait pas directement des néo--épitopes variables, elle met en valeur l'importance des épitopes qui sont récurrent mutés pendant l'évolution virale en réponse à la pression immunisée.

« L'avantage social de la vaccination de masse peut par conséquent aller bien au-delà de l'atténuation largement rapportée du risque d'infection SARS-CoV-2 et amélioration de boîte de vitesses de communauté, pour inclure la provenance de l'évolution virale effrénée, » elles concluent.

Avis *Important

le medRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
Sally Robertson

Written by

Sally Robertson

Sally first developed an interest in medical communications when she took on the role of Journal Development Editor for BioMed Central (BMC), after having graduated with a degree in biomedical science from Greenwich University.

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