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A vacinação COVID-19 pode provir a evolução de umas variações SARS-CoV-2 “mais aptas”

Os pesquisadores nos Estados Unidos e a Índia apresentaram a primeira evidência conhecida que o desenrolamento da vacinação da doença 2019 do coronavirus (COVID-19) está restringindo os caminhos evolucionários e imunes do escape acessíveis ao coronavirus 2 da Síndrome Respiratória Aguda Grave (SARS-CoV-2).

Venky Soundararajan dos laboratórios do nference, em Cambridge, Massachusetts e colegas encontrou que a diversidade das linhagens SARS-CoV-2 está diminuindo no país-nível como taxas de aumento em massa da vacinação COVID-19.

Os pesquisadores igualmente encontraram aquele comparado com COVID-19 os pacientes unvaccinated, os indivíduos vacinados que desenvolveram vírus abrigados infecção da descoberta SARS-CoV-2 com diversidade significativamente mais baixa nos resumos da pilha de B que são leveraged depois da vacinação.

“Este estudo demonstra que a vacinação da massa pode servir como um impedimento antigénico à evolução do ajustador e as variações SARS-CoV-2 mais transmissivas, sublinhando a necessidade urgente de provir a hesitação vacinal como uma etapa chave abrandar a carga global de COVID-19,” escreve a equipe.

Uma versão da pré-impressão do artigo de investigação está disponível no server do medRxiv*, quando o artigo se submeter à revisão paritária.

A evolução SARS-CoV-2 compreensiva é imperativa a combater a pandemia

A resposta imune do anfitrião que segue a infecção SARS-CoV-2 é uma pressão selectiva chave que influencie a emergência de tensões virais novas.

“Compreender as tendências longitudinais da evolução SARS-CoV-2 e traçar a paisagem mutational do antígeno são imperativos combater detalhada o pandémico em curso e as manifestações futuras,” diz Soundararajan e colegas.

A revelação rápida das vacinas COVID-19 e do desenrolamento em massa da vacinação através de muitos países conduziu a mais de 800 milhão indivíduos que estão sendo imunizados agora inteiramente global.

Tal imunização acelerada de uma grande proporção da população na altura da pandemia em curso podia significativamente aumentar a pressão evolucionária no vírus SARS-CoV-2, adverte os pesquisadores.

“Contudo, até agora, não houve nenhum estudo detalhado no impacto dos esforços globais da vacinação na evolução SARS-CoV-2,” eles escreve.

A disponibilidade de dados global compartilhados fornece “uma oportunidade oportuna”

Desde que a manifestação COVID-19 começou primeiramente ao fim de dezembro de 2019, os esforços departilha globais conduziram a mais de 1,8 milhão genomas SARS-CoV-2 de 183 países e territórios que estão sendo depositados na iniciativa global em compartilhar a base de dados dos dados da gripe das aves (GISAID) daqui até maio de 2021.

“A disponibilidade de dados genomic e imunológicos fornece uma oportunidade oportuna de caracterizar sistematicamente a paisagem mutational antigénica de SARS-CoV-2,” diz Soundararajan e colegas.

Que os pesquisadores fizeram?

Os pesquisadores conduziram uma análise longitudinal dos genomas SARS-CoV-2 disponíveis na base de dados de GISAID para capturar testes padrões evolucionários virais vacinação-associados. Igualmente executaram o genoma viral que arranja em seqüência para 23 pacientes vacinados com a descoberta COVID-19 e 30 pacientes COVID-19 unvaccinated.

A análise dos 1,8 milhão genomas SARS-CoV-2 revelou um total de 1.296 linhagens virais diferentes.

Os genomas SARS-CoV-2 mostram uma diversidade global da diminuição em ordem que coincide com a vacinação em massa para COVID-19. (a) Vista geral esquemática de calcular a diversidade genomic (b-c) da diversidade SARS-CoV-2 nas linhagens SARS-CoV-2 dentro dos dados de GISAID, determinados usando a entropia da distribuição de probabilidade da linhagem dentro dos indicadores de 1 vez do mês. As linhas tracejadas verticais indicam o tempo em que os países alcançaram uma cobertura vacinal de 1% de sua população total. (d) Disperse o lote que mostra a correlação entre a porcentagem do país-nível de indivíduos inteiramente vacinados (de OWID21) e a entropia da linhagem SARS-CoV-2. (e) Distribuição do coeficiente de correlação de Pearson entre a porcentagem do país-nível de indivíduos inteiramente vacinados e entropia da linhagem SARS-CoV-2 para todos os 25 países com maior de 25% de sua população vacinada inteiramente (o 26 de junho de 2021) e pelo menos 4 meses com 100 ou mais seqüências depositadas a GISAID, após o começo da vacinação. O código alpha-3 do ISO 3166-1 de países incluídos e sua correlação de Pearson são alistados na figura legenda.
Os genomas SARS-CoV-2 mostram uma diversidade global da diminuição em ordem que coincide com a vacinação em massa para COVID-19. (a) Vista geral esquemática de calcular a diversidade genomic (b-c) da diversidade SARS-CoV-2 nas linhagens SARS-CoV-2 dentro dos dados de GISAID, determinados usando a entropia da distribuição de probabilidade da linhagem dentro dos indicadores de 1 vez do mês. As linhas tracejadas verticais indicam o tempo em que os países alcançaram uma cobertura vacinal de 1% de sua população total. (d) Disperse o lote que mostra a correlação entre a porcentagem do país-nível de indivíduos inteiramente vacinados (de OWID21) e a entropia da linhagem SARS-CoV-2. (e) Distribuição do coeficiente de correlação de Pearson entre a porcentagem do país-nível de indivíduos inteiramente vacinados e entropia da linhagem SARS-CoV-2 para todos os 25 países com maior de 25% de sua população vacinada inteiramente (o 26 de junho de 2021) e pelo menos 4 meses com 100 ou mais seqüências depositadas a GISAID, após o começo da vacinação. O código alpha-3 do ISO 3166-1 de países incluídos e sua correlação de Pearson são alistados na figura legenda.

Impressionante, a equipe encontrou que a diversidade destas linhagens diminuiu global, com esta diminuição que parece coincidir com o início do desenrolamento em massa da vacinação.

Quando os pesquisadores analisaram o relacionamento entre taxas da vacinação e entropia da linhagem em 25 países onde mais de 25% da população foi vacinado inteiramente, encontraram que a diminuição na diversidade da linhagem estêve correlacionada certamente com as taxas aumentadas de vacinação em massa.

Além disso, a diminuição na diversidade da linhagem foi acoplada com domínio aumentado (gama) das variações B.1.1.7 (alfa), B.1.1.617 (delta) e P.1 do interesse, sugerindo que estas variações pudessem ser umas linhagens SARS-CoV-2 “mais aptas”.

Os resumos da pilha de B tiveram uma carga mutational mais alta do que resumos de célula T

Dado que as vacinas COVID-19 leverage a B-pilha e os resumos do t-cell, a equipe analisou a predominância das mutações em cada resíduo conhecido do resumo.

Isto revelou uma carga mutational mais alta em neutralizar resumos da pilha de B do que em neutralizar resumos de célula T.

Além disso, as variações do interesse contiveram mais mutações em resumos da B-pilha do que não-variações do interesse.

A equipe diz que os resultados sugerem que a proteína do ponto SARS-CoV-2 se esteja submetendo presentemente à pressão pilha-conduzida B forte da selecção, com as variações do interesse que exibem os aumentos os mais significativos em mutações do resumo da B-pilha.

A proteína viral do ponto é a estrutura preliminar que SARS-CoV-2 se usa para contaminar pilhas de anfitrião e a site principal que abriga as mutações emergentes que confer o transmissibility aumentado e o escape imune que foi com certeza variações observadas.

Certamente, arranjar em seqüência genomic dos genomas SARS-CoV-2 dos pacientes COVID-19 revelou que os indivíduos unvaccinated compartilharam significativamente de mais similaridade mutational do resumo da B-pilha com as variações do interesse do que os pacientes vacinados que desenvolveram uma infecção da descoberta.

Que os autores concluíram?

“Este estudo apresenta a primeira evidência conhecida que as vacinas COVID-19 estão restringindo fundamental os caminhos evolucionários e antigénicos do escape acessíveis a SARS-CoV-2,” diz Soundararajan e colegas.

Os pesquisadores dizem que quando a análise não previu directamente neo-resumos variantes, destaca a importância dos resumos que são transformados periòdica durante a evolução viral em resposta à pressão imune.

“O benefício social da vacinação em massa pode conseqüentemente ir para além da mitigação extensamente relatada do risco da infecção SARS-CoV-2 e melhora da transmissão da comunidade, para incluir provir da evolução viral desenfreado,” conclui.

Observação *Important

o medRxiv publica os relatórios científicos preliminares que par-não são revistos e, não devem conseqüentemente ser considerados como conclusivos, guia a prática clínica/comportamento saúde-relacionado, ou tratado como a informação estabelecida.

Journal reference:
Sally Robertson

Written by

Sally Robertson

Sally first developed an interest in medical communications when she took on the role of Journal Development Editor for BioMed Central (BMC), after having graduated with a degree in biomedical science from Greenwich University.

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