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Les lockdowns exercent-ils la pression de choix sur l'overdispersion des variantes SARS-CoV-2 ?

Parmi les membres de la famille de coronavirus qui peut infecter des êtres humains, le syndrôme respiratoire aigu sévère coronavirus-2 (radar à ouverture synthétique CoV-2) a montré le taux de transmission le plus élevé. Ce virus ARN est l'agent causal de la pandémie actuelle de la maladie 2019 de coronavirus (COVID-19).

Une des caractéristiques principales de cette pandémie est overdispersion par transmission. En d'autres termes, événements superspreading qui ont rapidement transmis le virus à on avec un régime incroyablement escarpé de reproduction.

Les états précédents ont indiqué que 10% de personnes COVID-19 positives sont responsables de 80% de cas neufs. Cette preuve réfléchit le fait que quelques personnes ont des nombres reproducteurs élevés et peuvent infecter beaucoup de personnes en bonne santé, alors que la majorité de patients COVID-19 ne transmettent pas.

La mutation dans le génome viral peut avoir comme conséquence l'émergence des tensions neuves du virus. Ces développements peuvent modifier les configurations de boîte de vitesses du virus, menant à une possibilité plus élevée de superspreading si ces mutations augmentent la forme physique virale.

Par exemple, on pense que l'alpha variante (B.1.1.7) de SARS-CoV-2 est au moins 50% plus infectieux que la tension SARS-CoV-2 originelle qui avait apparu à Wuhan, Chine, en décembre 2019.

Les chercheurs ont trouvé ce dedans l'alpha variante, charge virale, en moyenne, est trois fois davantage si comparés à la tension héréditaire. Les différentes mutations ont comme conséquence une différence dans le degré de liberté, comme des expositions de mutation de N501Y une charge virale plus grande et abaissent le degré de liberté.

Les chercheurs ont estimé que la tension héréditaire de SARS-CoV-2 subit une mutation à un taux d'approximativement deux remplacements selon le génome par mois. Ceci traduit à environ une mutation selon trois boîtes de vitesses. Cependant, beaucoup de mutations peuvent être neutres, et seulement certains affecteront les caractéristiques du virus, comme la gravité de la maladie entraînée et du débit de transmission.

Une étude neuve examine des variantes de concurrence

La recherche neuve récent relâchée sur le serveur de prétirage de medRxiv* décrit un modèle mathématique qui a été développé pour évaluer des concours entre les variantes qui diffèrent dans leur niveau de l'overdispersion (k) et leur moyen infectiousness.

Plus particulièrement, les chercheurs ont employé un modèle de réseau basé sur agent de la transmission de la maladie. Le centre principal de l'étude était de l'explorer si l'overdispersion implique n'importe quels avantages (DIS) évolutionnaires et si les interventions non-pharmaceutiques changent l'horizontal de forme physique pour des variantes avec des divers niveaux d'overdispersion.

Afin de cette étude, il était essentiel de recenser la capacité d'un agent pathogène d'éviter l'extinction stochastique. Pour faire ceci, les chercheurs avaient l'habitude un procédé étant branché pour simuler une manifestation d'une variante avec un niveau prédéterminé d'overdispersion. Ils ont enregistré les possibilités de la variante survivant au delà des dix premiers rétablissements des infections. Ils ont constaté que les chances de survie se fondent fortement sur l'overdispersion. Des variantes plus homogènes ont une chance de survie plus grande au delà des dix premiers rétablissements, alors qu'il est peu susceptible faire des variantes fortement overdispersed ainsi.

Cette observation aligne bien avec la preuve précédente que pas beaucoup de gens deviennent hautement infectieux tandis que quelques personnes peuvent transmettre la maladie à beaucoup d'autres. Elle met en valeur davantage le fait que les maladies hétérogènes sont beaucoup plus faibles aux étapes initiales d'une épidémie, étant de ce fait plus susceptibles de l'extinction stochastique.

L'article explique que la réussite et le taux de survie de mutants d'une maladie superspreading, comme COVID-19, dépend du degré de restrictions imposées dans une population. Ces restrictions ont pu être les lockdowns, le social distançant des mesures, l'usage obligatoire des masques, etc. Le type de restriction imposé peut avoir des implications pour la prochaine variante dominante.

Par exemple, les lockdowns ajoutés aux interactions sociales limitées pourraient encourager l'évolution des variantes qui ont écarté plus homogènement. Alternativement, si on permet à des des écoles de rester ouvertes, puis les mutants qui écartent rapidement parmi des enfants peut être sélecté.

Les chercheurs ont mis en valeur le fait qui pour une maladie aiment COVID-19 qui écarte rapidement, il ne sont pas possibles pour la caractériser avec un numéro simple comme le numéro reproducteur fondamental (R0). Le procédé par lequel une maladie se répand est un phénomène complexe et dépend d'un choix de facteurs socioculturels, de restrictions gouvernement-imposées, et de changements que l'on s'impose à soi-même du comportement des citoyens. La maladie peut se répandre non seulement en augmentant son infectiousness mais également en modifiant son mode de transmission pour devenir plus homogène. Les Lockdowns peuvent, pour cette raison, potentiellement favoriser l'émergence des variantes qui écartent homogènement.

L'étude de l'équipe met l'accent sur l'importance de prendre en considération l'overdispersion tout en analysant la capacité de boîte de vitesses d'une variante apparaissante. Beaucoup de juridictions ont utilisé un modèle partiel de lockdown, et les chercheurs mettent en valeur que les caractéristiques de boîte de vitesses obtenues à partir de tels lockdowns partiels peuvent mener à une surestimation de la capacité de boîte de vitesses de variantes apparaissantes. Les évaluations précises du transmissibility sont absolument essentielles car elles peuvent aider à déterminer les seuils de vaccination pour atteindre l'immunité de troupeau.

avis *Important

le medRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
Dr. Priyom Bose

Written by

Dr. Priyom Bose

Priyom holds a Ph.D. in Plant Biology and Biotechnology from the University of Madras, India. She is an active researcher and an experienced science writer. Priyom has also co-authored several original research articles that have been published in reputed peer-reviewed journals. She is also an avid reader and an amateur photographer.

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