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Análisis dinámico molecular de los inhibidores SARS-CoV-2

El 13 de julio de 2021, la enfermedad 2019 (COVID-19) del coronavirus, que es causado por el coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de la neumonía asiática, ha infectado sobre 187 millones de personas de y ha causado las muertes sobre 4 millones de personas de por todo el mundo. Sobre la infección por SARS-CoV-2, este virus ata con alta afinidad a la angiotensina humana que convierte el receptor (ACE2) enzyme-2 presente en la superficie de células humanas. Este mecanismo por lo tanto ha estado de interés a muchos investigadores que observaban para desarrollar los tratamientos que podrían cegar ACE2 e incapacitar la proteína del pico (s) de SARS-CoV-2.

Un nuevo estudio denuncia los resultados de las simulaciones dinámicas moleculares que fueron realizadas en un esfuerzo de determinar las nuevas drogas que podrían ser efectivas contra SARS-CoV-2.

Estudio: La dinámica molecular de los inhibidores posibles para SARS-CoV-2. Haber de imagen: PHOTOCREO Michal Bednarek/Shutterstock.com

Fondo

La proteína de S de SARS-CoV-2 se compone de las subunidades S1 y S2 que fusión mediata de la membrana del combate ACE2 y de la viral-célula a tener en cuenta final asiento viral en la célula huesped. La subunidad S1 lleva el dominio receptor-obligatorio (RBD) que soporta el adorno receptor-obligatorio (RBM), que es la situación de los residuos que atan al interfaz ACE2.

A pesar de los esfuerzos intensivos que han sido hechos por la comunidad científica global para desarrollar agentes antivirus contra SARS-CoV-2, se ha limitado su éxito. Como consecuencia, la mayoría de los médicos en lugar de otro han confiado en las drogas bien conocidas que son capaces de reducir la inflamación en pacientes con COVID-19 severo o crítico para prevenir daño y muerte del multi-órgano.

Muchos estudios de la investigación se han realizado para determinar las nuevos drogas y/o repurpose los que son fácilmente disponibles. Con este fin, in silico las técnicas han sido de gran uso en la identificación inicial de tales composiciones.

¿Qué el estudio mostró?

En el parte actual, que fue publicado en el gorrón de la estructura y de la dinámica biomoleculares, los autores describieron el uso de las simulaciones de la dinámica molecular de explorar las afinidades obligatorias de nueve composiciones. De estas nueve composiciones, tres fueron encontrados para mostrar el potencial terapéutico importante, que incluyó SN35563, arbidol, y hydroxychloroquine.

SN35563, que también se conoce como R5, es un análogo del éster del ketamine que desaparece rápidamente pero continúa poner los estímulos del dolor en contra por un período prolongado. En el estudio actual, los investigadores encontraron que mientras que SN35563 ata en la alta afinidad al receptor ACE2, no era capaz de atar a las proteínas de SARS-CoV-2 S o de RBD en los niveles comparables.

Arbidol es una composición antivirus del amplio-espectro del no-nucleósido que se piensa para inhibir la fusión de la membrana celular del virus-ordenador principal mientras que simultáneamente fortalece inmunidad. En los niveles moleculares, el arbidol fue encontrado para atar preferencial a los residuos aromáticos. Cuando está utilizado clínico, el arbidol ha perfeccionado diversos parámetros de la salud en los pacientes COVID-19 incluyendo niveles de la saturación del oxígeno, así como las admisiones de la Unidad de Cuidados Intensivos (ICU) y duración reducidas de la hospitalización, con licenciamiento anterior.

Hydroxychloroquine es una droga antimalarial e inmunomodulador que es ampliamente utilizada en el tratamiento de artritis autoinmunes como droga anti-reumática de enfermedad-modificación (DMARD). El abridol y el hydroxychloroquine fueron encontrados para cegar la proteína viral de S sin sujetar al receptor ACE2. De acuerdo con las simulaciones de la dinámica molecular, los investigadores creen que el bloqueo óptimo de la invasión SARS-CoV-2 se podría lograr con éxito por una combinación de arbidol o de hydroxychloroquine con SN35563, como SN35563 puede cegar el receptor ACE2 para compensar la incapacidad de los agentes anteriores para hacer tan.

Remdesivir, que es un antivirus que se ha utilizado extensivamente para tratar a los pacientes COVID-19, también fue estudiado en el estudio actual. Con este fin, los investigadores encontraron que este agente puede aumentar real el riesgo de infección de la célula huesped como resultado de su afinidad obligatoria igual a las proteínas de S y de RBD, así como el receptor ACE2. Atando a ambos simultáneamente, el remdesivir reduce la distancia entre las proteínas y el receptor virales de la célula huesped, de tal modo haciendo la infección viral más probable.

¿Cuáles son las implicaciones?

Otras pruebas serán requeridas determinar si las combinaciones de SN35563 con arbidol o hydroxychloroquine puedan tener un efecto sinérgico sobre asiento de la célula. Si es así este tratamiento de la combinación sea extremadamente útil en cegar el receptor ACE2 y reducir el atascamiento de SARS-CoV-2 a este receptor en las células huesped. Por otra parte, la dosis de cada droga se podía reducir en tales aproximaciones del tratamiento de la combinación.

Con el uso de las simulaciones de la dinámica molecular, el estudio actual demostró un mecanismo posible de la acción de tres composiciones del candidato, que podrían llevar al revelado de drogas antivirus potentes en un futuro próximo.

Journal reference:
Dr. Liji Thomas

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Dr. Liji Thomas

Dr. Liji Thomas is an OB-GYN, who graduated from the Government Medical College, University of Calicut, Kerala, in 2001. Liji practiced as a full-time consultant in obstetrics/gynecology in a private hospital for a few years following her graduation. She has counseled hundreds of patients facing issues from pregnancy-related problems and infertility, and has been in charge of over 2,000 deliveries, striving always to achieve a normal delivery rather than operative.

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