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Une évaluation quantitative de production du bioaerosol SARS-CoV-2

Le contact étroit entre les personnes a contribué énormément à l'écart sporadique du coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de syndrôme respiratoire aigu sévère en travers du monde.

Selon le centres pour le contrôle et la prévention des maladies des Etats-Unis (CDC), le contact étroit de `' est défini en tant que personne qui a passé au moins 15 mn, sur une période de 24 heures, chez 2 mètres d'une personne avec la maladie 2019 (COVID-19) de coronavirus. Cette définition de contact étroit est devenue très utilisée dans des études investigatrices sur le contact de `' et déterminer le risque moyen de COVID-19 dans des réglages et des communautés de santé.

Étude : Variation de production du bioaerosol SARS-CoV-2 en haleine exhalée. Crédit d'image : nurkovic/Shutterstock.com eldar

Chercheurs de l'École de Médecine d'Université de Stanford, cependant, feutre que la base empirique pour cet hublot heure précise est limitée. En fait, les chercheurs ont présumé que les différentes caractéristiques et actions telles que parler peuvent également affecter le risque général d'exposition de rejet et de choc du bioaerosol au-dessus de cet hublot de temps. Pour étudier davantage cette hypothèse, les chercheurs ont mesuré SARS-CoV-2 des échantillons exhalés d'haleine pour déterminer le choc de la parole et de différentes caractéristiques sur le rejet viral.

Amélioration de la sensibilité de l'échantillonnage de masque

La production des bioaerosols SARS-CoV-2 par une personne infectée varie entre les personnes. Comme résultat, la production de bioaerosol est généralement prévue en modélisant les estimations combinées des concentrations dans des écouvillons de voie aérienne avec des caractéristiques sur le volume total de production de gouttelette.

Cette approche a en grande partie été due utilisé au manque d'un outil flexible d'échantillonnage de bioaerosol qui peut directement mesurer la variation de l'abondance du bioaerosol SARS-CoV-2. Tandis que l'échantillonnage de masque a été exploré comme méthode d'échantillonnage de bioaerosol, les études préliminaires ont trouvé l'approche pour produire des sensibilités marginales.  

Dans un effort pour améliorer la sensibilité et la guérison d'échantillon de l'échantillonnage de masque, un groupe de chercheurs de Stanford développés récemment un outil nouvel d'échantillonnage de masque pour évaluer la variation de bioaerosol chez des personnes. Après mesure et ordonnancement \ SARS-CoV-2 des échantillons exhalés d'haleine, les chercheurs avaient l'habitude cette caractéristique pour vérifier le choc de la parole et de différentes caractéristiques sur le rejet viral.

Au sujet de l'étude

Pour cette enquête, les chercheurs ont développé un outil d'échantillonnage de masque qui a compris les masques N95 adaptés contenant une boîte de Pétri De 47 mm (millimètre) avec un filtre de membrane de gélatine. Un total d'échantillons de 141 masques ont été rassemblés de 97 patients COVID-19 positifs d'hôpital de Stanford entre septembre 2020 et mars 2021.

Les patients ont été divisés en deux groupes. Considérant que le groupe A a inclus les patients qui se sont usés un masque pendant 30 mn et ont été dits à l'entretien ou restent silencieux, les patients composés par B de groupe qui ont été chargés de s'user deux masques pendant 15 mn chacun. Tout en s'usant le premier masque, les participants du groupe B n'ont pas parlé du tout ; cependant, tout en s'usant le deuxième masque, ils ont parlé avec l'enquêteur ou un membre de la famille.

Découvertes d'étude

« Plus de 15 mn de ramassage, les copies virales totales saisies par des masques ont varié considérablement, s'échelonnant de 0 à 5,0 x à 106 copie tout en parlant à 0 à 8,4 x 104 copies tout en ne parlant pas. »

Une corrélation modérée était rapportée dans les personnes d'un âge plus grand qui étaient dans les 15 groupes parlants mn et les charges virales plus élevées dans les échantillons exhalés d'haleine. Cependant, d'autres facteurs comprenant la durée des sympt40mes, des jours du premier test SARS-CoV0-2, et du nombre de copies de RNAseP d'être humain ne se sont pas avérés pour affecter les copies virales rassemblées en masques. D'une manière primordiale, les malades hospitalisés ont eu des régimes sensiblement inférieurs de positivité de masque par rapport aux patients.

(a) Des nombres de copie viraux trouvés dans les masques et des écouvillons nasaux ont été modérément marqués dans le groupe A (30 mn échantillonnant sans directives ; bleu, n=33) et groupe B (échantillon de 15 mn ; rouge,) cohorte n=44 parlante. (b) Nombre total des copies virales trouvées selon l'échantillon de masque dans groupe parlant et aucun parlant. Les copies virales ont été trouvées utilisant SARS-CoV-2 le détail des sondes de N1 et de N2. Des copies virales ont été mesurées sur la courbure normale dérivée du N-gène contenant le plasmide de pET21b+.

En ordonnançant les échantillons exhalés d'haleine, les chercheurs ont évalué la qualité de l'ARN extrait des filtres de masque et déterminé si l'échantillonnage de masque peut être employé pour le contrôle génomique. À cet effet, les chercheurs ont constaté que 71% de tous les échantillons de masque a atteint leurs objectifs pour ordonnancer la couverture, expliquant de ce fait l'application possible de l'échantillonnage de bioaerosol pour le séquençage du génome entier des virus respiratoires. Cet outil d'échantillonnage de masque est pour cette raison une méthode prometteuse pour étudier le dépistage de boîte de vitesses et de variante.

(a) La majorité 71,4% (15/21) de tous les échantillons de masque, y compris 62,5% (5/8) le masque, 50,0% ne masquent aucun parler, et 88,9% (8/9) les échantillons parlants de masque, ont atteint nos objectifs pour ordonnancer la profondeur de couverture (100X) et la largeur (>90% du génome avec la couverture de >10X). (b) La profondeur médiane de couverture a été marquée avec la charge virale (r = 0,65, p < 0,001).

Conclusion

Dans l'étude actuelle, les chercheurs ont développé un outil nouvel d'échantillonnage de masque qui peut être utilisé pour mesurer et ordonnancer le matériel génétique SARS-CoV-2 des échantillons exhalés d'haleine. La caractéristique présentée ici fournit également la preuve sur le choc de la parole et de la variation interindividuelle sur SARS-CoV-2 jetant dans les bioaerosols.

L'étude concentrée sur un endroit sans direction de l'évaluation quantitative de la production du bioaerosol SARS-CoV-2 et de ses causes déterminantes. Il aide à aviser l'évaluation et la stratification du risque des expositions et de la boîte de vitesses d'infection de bioaerosol, ainsi que les directives de contact étroit. L'exposition varie considérablement entre les personnes mais pourrait être risque-stratifiée par la charge virale nasale d'écouvillon et si la conversation impliquée d'exposition.

avis *Important

le medRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
Dr. Ramya Dwivedi

Written by

Dr. Ramya Dwivedi

Ramya has a Ph.D. in Biotechnology from the National Chemical Laboratories (CSIR-NCL), in Pune. Her work consisted of functionalizing nanoparticles with different molecules of biological interest, studying the reaction system and establishing useful applications.

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