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Variantes SARS-CoV-2 et leur capacité d'infecter des souris

La pandémie nouvelle actuelle de la maladie 2019 de coronavirus (COVID-19) a été provoquée par l'écart rapide de syndrome-2 respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2). Des êtres humains sont connus pour être le plus grand réservoir de ce virus. La tension originelle du virus a subi des mutations, et comme résultat, plusieurs variantes SARS-CoV-2 ont apparu. Les études précédentes ont indiqué les risques de ce virus d'acquérir les réservoirs complémentaires, par exemple, visons. Ceci pourrait élever le risque d'autres de mutations, qui pourraient avoir comme conséquence l'émergence des variantes plus infectieuses qui sont insensibles aux vaccins COVID-19 existants.

Infection SARS-CoV-2 chez les souris

Les scientifiques ont eu précédemment rapporté que la tension originelle de SARS-CoV-2 ainsi que ses variantes neuf apparues n'ont pas infecté des souris. C'est parce que les récepteurs de la conversion de l'angiotensine enzyme-2 (ACE2) des souris ne peuvent pas gripper avec la protéine virale de pointe. Ainsi, le virus ne peut pas présenter des cellules de souris.

Ceci a entraîné un certain obstacle dans la recherche COVID-19 parce que la souris (musculus de Mus) est un modèle animal utilisé généralement pour étudier l'infection. Par conséquent, le virus a dû être modifié par l'intermédiaire des techniques variées, par exemple, passage séquentiel en tissus de poumon de souris et modification du domaine récepteur-grippant (RBD).

Plusieurs autres stratégies sont employées pour infecter des souris avec le virus SARS-CoV-2, y compris sensibiliser les voies respiratoires par l'intermédiaire de la transduction avec l'adénovirus ou le virus adeno-associé exprimant hACE2.

Étonnant, beaucoup d'études récent publiées ont montré certaines des variantes SARS-CoV-2 de la préoccupation (VoC) provenant de l'Afrique du Sud, R-U, et le Brésil peut infecter des souris. Ceci a abouti la communauté scientifique à s'inquiéter parce que les réservoirs complémentaires du virus pourraient augmenter le risque de produire des variantes. En outre, car les réservoirs viraux, tels que des souris, pourraient être en contact étroit avec des êtres humains, et car ils ne peuvent pas être vaccinés, les possibilités d'arrêter davantage d'émergence des variantes pourraient être énormément réduites.

Une étude neuve

Une CSIRO neuve étudient publié sur le serveur de prétirage de bioRxiv* a conduit in silico des études avec in vitro, in vivo, et des observations in situ et a indiqué l'adaptation de souris de SARS-CoV-2. In silico les études ont indiqué que les résidus de surface adjacente du composé RBD/ACE2 dans des modèles d'être humain et de souris contiennent 30 résidus ACE2 en contact étroit, dont 19 sont économisés entre mACE2 et hACE2.

Basé sur ces positions, les chercheurs ont prévu que des mutations de RBD liées aux adaptations de souris pourraient être groupées desserré dans trois régions. Ceux-ci sont comme suit :

  • Région 1 (RBD positionne 498, 499, et 501) située autour de la tyrosine fortement économisée 41 (Y41) du résidu ACE2.
  • Région 2 (RBD positionne 417, 493) située autour ACE2 du résidu 34.
  • Région 3 (RBD positionne 484 et 486) près du boîtier ACE2 des résidus 78 82.

Les auteurs de la recherche actuelle ont indiqué que l'adaptation de souris du virus SARS-CoV-2 exige un remplacement aromatique électrophile, dans une des deux positions du domaine obligatoire du récepteur de la protéine de pointe, c.-à-d., en position 501 ou position 498. Dans la région 1, on a observé le remplacement de la proline 499 à la thréonine (P499T) dans deux clones infectieux. Les scientifiques promeuvent ont observé que l'affinité obligatoire a augmenté plus dû aux mutations en 417, 484, et 493 positions, par exemple, K417N, E484K, Q493K, et Q493R. Cependant, l'affinité obligatoire était rapportée pour être moins où les mutations se sont produites en positions 486 et 499, par exemple, F486L et P499T. Ainsi, cette recherche a prouvé que l'alpha SARS-CoV-2, les bêta, et les variantes gamma de la préoccupation peuvent effectivement infecter des souris, alors que la triangle et la « triangle plus » ne peuvent pas faire ainsi. De plus, les scientifiques ont déclaré que quelques mutations peuvent mener à d'autres mutations. Par exemple, N501Y, la mutation primaire couramment actuelle dans l'alpha, les bêta, et les variantes gamma de la préoccupation, introduisent la mutation F501 avec encore une autre modification de nucléotide. En outre, la mutation d'E484K peut mener à R484 ou à T484 avec une modification complémentaire de nucléotide.

La surface adjacente RBD/ACE2. Le domaine obligatoire de récepteur est montré dans bleu-vert, alors que l
La surface adjacente RBD/ACE2. Le domaine récepteur-grippant (RBD) est montré dans bleu-vert, alors que l'ACE2 est montré dans le jaune. Les sphères roses indiquent des positions relatives de souris adaptant des mutations sur le RBD, alors que les sphères bleues représentent les résidus de surface adjacente qui diffèrent entre l'être humain et les séquences de la souris ACE2, montrés dans vert et orange respectivement.

Conclusion

Il est impérieux de comprendre si le virus peut s'adapter à un hôte neuf. Une évaluation complète des caractéristiques obtenues à partir de différentes sources telles qu'in silico, in vivo, des études in vitro et et in situ est essentielle.

La recherche actuelle a indiqué que le virus SARS-CoV-2 peut s'adapter aux souris, et cette conclusion entraîné a été basée sur la meilleure preuve procurable procurable en ce point. La méthodologie de recherches, qui a compris l'utilisation de différentes approches comme des technologies de bio-informatique et d'artificial intelligence, pourrait effectivement faciliter la future recherche liée à recenser d'autres réservoirs animaux et prévoir les remarques de mutation de probable. Cette approche a pu également aider des chercheurs à prévoir et atténuer des adaptations de virus-hôte pour les pandémies actuelles et futures. De plus, la recherche actuelle a recensé plusieurs pays où le contrôle d'inducteur local des souris est encouragé parce que ces pays sont à souris contactées enclines portant des virus avec des mutations adaptatives.

Avis *Important

le bioRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
Dr. Priyom Bose

Written by

Dr. Priyom Bose

Priyom holds a Ph.D. in Plant Biology and Biotechnology from the University of Madras, India. She is an active researcher and an experienced science writer. Priyom has also co-authored several original research articles that have been published in reputed peer-reviewed journals. She is also an avid reader and an amateur photographer.

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