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La variante de SARS-CoV-2 iota augmente le risque de mortalité parmi des adultes plus âgés

Une étude entreprise au ministère de la santé de New York City et l'hygiène mentale, les Etats-Unis, et l'école de facteur de la santé publique, l'Université de Columbia, Etats-Unis, a déterminé le débit de transmission, la capacité immunisée d'évasion, et le régime de fatalité d'infection de la variante B.1.526 du coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de syndrôme respiratoire aigu sévère.

Les découvertes indiquent que la variante a un transmissibility considérablement plus élevé et un potentiel immunisé d'évasion que des variantes précédemment de diffusion et qu'elle peut augmenter le régime de fatalité d'infection de 62% - 82% parmi des adultes plus âgés. L'étude est actuellement disponible sur le serveur de prétirage de medRxiv*.

Mouvement propre

Avec l'étape progressive de la pandémie de la maladie 2019 de coronavirus (COVID-19), plusieurs variantes neuves de SARS-CoV-2 ont été recensées. À cause du pouvoir infectant et de la pathogénicité accrus, certaines de ces variantes ont été montrées comme variantes de préoccupation (VOC) ou variantes d'intérêt (VOI) par l'Organisation Mondiale de la Santé (WHO).

La variante B.1.526 de SARS-CoV-2, également connue sous le nom de variante de lota, a été recensée la première fois à New York City en novembre 2020. Plus tard, la variante a été trouvée dans chacune des 52 conditions et d'autres juridictions aux Etats-Unis, ainsi que dans 27 pays en travers du monde.

Comme observé dans une étude basée sur laboratoire, cette variante est modestement résistante à la neutralisation par les anticorps monoclonaux thérapeutiques et anticorps vacciniques/infection-induits. En revanche, la preuve indique que la variante n'augmente pas le risque d'infections de découverte dans vacciné ou précédemment des personnes infectées.

Dans l'étude actuelle, les scientifiques ont analysé des ensembles de données multiples épidémiologiques et de population rassemblés à New York City et ont exécuté la modélisation mathématique pour déterminer le débit de transmission, la capacité immunisée d'évasion, et le risque de fatalité d'infection de la variante B.1.526.

Modèle d'étude

Les scientifiques ont utilisé un système de modèle-inférence de réseau pour estimer la dynamique de boîte de vitesses de SARS-CoV-2 et variables et paramètres niveau de la population à New York City. Basé sur l'information collectée, ils ont réalisé une analyse multivariante et âge-structurée niveau de la ville de modélisation pour estimer l'infection et les modifications immunisées de capacité d'évasion pour la variante B.1.526. L'analyse finale a utilisé les caractéristiques obtenues à partir de deux modèles pour estimer le taux de mortalité de variante-détail parmi des personnes infectées avec SARS-CoV-2 (risque de fatalité d'infection).      

Pour le système de modèle-inférence de réseau, elles ont utilisé des ensembles de données épidémiologiques multiples ainsi que des ensembles de données de vaccination. De même, l'analyse modèle multivariante a utilisé de quatre semaines des ensembles de données, y compris les cas confirmés COVID-19 et soupçonnés, les hospitalisations, la mortalité, et le pourcentage des différentes variantes SARS-CoV-2 diffusant à New York City.

Observations importantes

À New York City, on a estimé à que la prévalence niveau de la population de l'infection SARS-CoV-2 16,6% à l'extrémité de la première onde universelle. De même, à l'extrémité de la deuxième onde, la prévalence estimée était 41,7%. Tandis que la plupart des infections se produisaient dans la population plus âgée pendant la première onde, la deuxième onde a entraîné des infections à toutes les tranches d'âge.

Comparaison de différentes combinaisons des changements du transmissibility et de la propriété immunisée d
Comparaison de différentes combinaisons des changements du transmissibility et de la propriété immunisée d'évasion pour B.1.526. La Commission gauche montre l'exactitude générale (a), le parent RMSE (b), et la corrélation (c) des estimations modèles sous le transmissibility différent et les réglages immunisés d'évasion. Les croix de zone blanche (x) indiquent la combinaison de paramètre la plus performante. La Commission droite montre les estimations modèles utilisant la combinaison générale de paramètre la plus performante (c.-à-d., un transmissibility 1.5-3.5% prévalence initiale, 15-25% plus élevé, et une évasion 0-10% immunisée). Les lignes et les zones environnantes montrent les estimations et la gamme interquartile médianes modèle-simulées ; les points montrent des observations correspondantes ; les couleurs indiquent différentes variantes comme spécifiques dans la légende. Notez que ces simulations modèles ont employé le même régime d'infection-dépistage, le hospitalisation-rate et l'IFR (c.-à-d., moyen pendant novembre 2020-avril 2021) ; c'est-à-dire, ils n'ont pas représenté des modifications au cas où évaluation ou gravité de la maladie par semaine au cours de cette période, due à, par exemple, des augmentations de gravité de la maladie par les variantes neuves. En soi, il y avait de plus grands écarts des observations pendant plus vers la fin de mois de la simulation avec plus d'infections par les variantes neuves.

Transmissibility et pouvoir immunisé d'évasion de la variante B.1.526

On a observé une augmentation rapide des cas de B.1.526-infected pendant la deuxième onde universelle. Avant l'identification de la variante dans un voisinage spécifique pour la première fois début novembre 2020, on a observé une augmentation graduelle du débit de transmission SARS-CoV-2 général du même voisinage. Le débit de transmission est demeuré élevé entre novembre 2020 et février 2021, suivi d'une réduction à la ligne zéro quand la variante B.1.526 est devenue dominante en travers de la ville. En revanche, le débit de transmission est demeuré continuel dans d'autres voisinages. De façon générale, ces observations indiquent que l'augmentation dans le débit de transmission dans ce voisinage particulier est probablement due à l'écart tôt de rapid de la variante B.1.526.

L'évaluation effectuée à partir des caractéristiques rassemblées a indiqué que le débit de transmission de la variante B.1.526 est 15 - 25% plus élevés que celui des variantes précédemment de diffusion. D'ailleurs, les caractéristiques ont indiqué que la variante peut induire des infections de découverte dans 0 - 10% de la population. Avec cette augmentation modérée de transmissibility et de capacité immunisée d'évasion, la variante B.1.526 est devenue dominante à New York City de novembre 2020 à mars 2021. Après, avec le saut de pression d'une variante plus infectieuse B.1.1.7, la prévalence de la variante B.1.526 a diminué graduellement.

Risque de fatalité d'infection

En dépit d'une réduction de taux de mortalité après la vaccination de masse, une admission dans le régime de fatalité d'infection a été estimée à New York City pendant la deuxième onde universelle. Les évaluations effectuées par les scientifiques au sujet de l'infection et des taux de mortalité de variante-détail ont indiqué que la variante B.1.526 augmente les régimes de fatalité d'infection de 46%, de 82%, et de 62% dans les personnes âgées 45 - 64 ans, 65 - 74 ans, et au-dessus de 75 ans, respectivement. Comparé aux variantes précédemment de diffusion, la variante B.1.526, globalement, a entraîné une admission de 60% dans le régime de fatalité d'infection. Cette admission était comparable à celle prévue pour la variante B.1.1.7.

Signification d'étude

L'étude met en valeur l'importance de surveiller les caractéristiques épidémiologiques des variantes SARS-CoV-2 nouvelles pour manager mieux la pandémie COVID-19.

Avis *Important

le bioRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
Dr. Sanchari Sinha Dutta

Written by

Dr. Sanchari Sinha Dutta

Dr. Sanchari Sinha Dutta is a science communicator who believes in spreading the power of science in every corner of the world. She has a Bachelor of Science (B.Sc.) degree and a Master's of Science (M.Sc.) in biology and human physiology. Following her Master's degree, Sanchari went on to study a Ph.D. in human physiology. She has authored more than 10 original research articles, all of which have been published in world renowned international journals.

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