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Lo studio suggerisce che analisi di armonia COVID-19 sia superiore alle prove basate a laboratorio

Un nuovo studio suggerisce che una nuova prova di coronavirus sviluppata dagli scienziati dall'università di Washington e dall'istituto di Brotman Baty per la medicina di precisione fornisca i risultati più veloci e più sensibili che le prove convenzionali di PCR al RNA virale di coronavirus 2 (SARS-CoV-2) di sindrome respiratorio acuto severo della misura.

Il kit della prova di RT-LAMP conosciuto come “l'armonia COVID-19„ è una prova di punto-de-cura destinata per essere economico e diretto usare con la capacità di esaminare fino a quattro campioni immediatamente. L'unità è intesa per migliorare i lavoratori di sanità di guida nell'identificazione del SARS-CoV-2 in pazienti.

I ricercatori egualmente sperano di estendere l'armonia COVID-19 per la prova rapida di altre infezioni respiratorie, compreso SARS-CoV-2 stagionale, influenza e RSV.

Il gruppo scrive:

“Le prove quale armonia si trasformeranno in in una pratica comune affinchè la conferma della presenza di infezioni virali che possono essere trattate con le terapie antivirali o che richiedono il controllo di infezione come pure contribuire diminuiscano l'uso inadeguato degli antibiotici. Più ulteriormente, le piattaforme della prova sviluppate per questa pandemia hanno potuto adattarsi più prontamente per diagnosticare le nuove malattie per aumentare la prontezza per le pandemie future.„

Armonia COVID-19 dello studio “: un kit pronto per l'uso, un rivelatore a basso costo e uno smartphone app per rilevazione del RNA di punto-de-cura SARS-CoV-2„ è pubblicato sul " server " del medRxiv* della pubblicazione preliminare.

Come lo ha fatto

Il kit della prova di armonia COVID-19 è stato valutato nello studio corrente avendo misura dei lavoratori di sanità il RNA degli esemplari inventati dalla matrice della saliva e nasale. Inoltre, i lavoratori di sanità egualmente hanno misurato il RNA dai campioni clinici memorizzati.

I campioni clinici freschi non potrebbero essere ottenuti in tempo per lo studio, che gli autori riconoscono è una limitazione dello studio.

I lavoratori di sanità hanno imparato come utilizzare la prova con alcune istruzioni "write" e un video che dettaglia la procedura.

Flusso di lavoro di armonia COVID-19, prestazione analitica ed interpretazione. (A) Flusso di lavoro dell
Flusso di lavoro di armonia COVID-19, prestazione analitica ed interpretazione. (A) Flusso di lavoro dell'utente. Un tampone nasale è raccolto ed eluito nel buffer della reidratazione facendo uso di un tastatore-erogatore unificato (indicato) o di un metodo della metropolitana-e-lampadina (fig. 8). L'eluito del tampone poi è trasferito nel tubo della reazione per reidratare reagenti liofilizzati e pre caricati di RT-LAMP. Gli utenti seguono le istruzioni sul telefono cellulare app registrare l'identità del campione, inseriscono il tubo nello slot della prova e vicino l'unità. Quattro campioni possono essere analizzati parallelamente. (Crediti di foto: (A) 1 (A) 4, pietra del segno all'università di Washington e (A) 5, Christopher Snyder all'istituto universitario del nord di Seattle). (B) esempi di analisi dell'su unità. I reagenti liofilizzati sono stati reidratati con l'eluito dai tamponi chiodati con 0, 200, 2000, o 20.000 copie di RNA SARS-CoV-2, esecuzione sull'unità ed analizzati in tempo reale. I campioni con RNA SARS-CoV-2 a 2000, 200 e 20 copie/reazione (rxn) sono stati riferiti come positivo da software minuto 27 al minuto, 30 e minuto 41, rispettivamente; dopo il minuto 60 la reazione di NTC è stata classificata come quantità negativa. (C) Del tempo risultato. Diversi punti di periodo di individuazione (N = 3) è tracciato. La variazione nel periodo di individuazione aumenta mentre i campioni si avvicinano al limite di segnalazione. (D) algoritmo di sistema diagnostico. Il software di armonia COVID-19 chiama i campioni come positivi, negativi, o indeterminato basato su rilevazione delle tre regioni nel gene del nucleocapsid (armonia NC1 che si sovrappongono con la regione di CDC N1, armonia NC2 (sovrapponendosi con la regione di CDC N3 esclusa dal kit corrente) ed armonia NC3 che si sovrappone con la regione del N2 di CDC) e nella sequenza costruita di IAC.

I risultati indicano l'alta precisione e la sensibilità nell'analisi di prova

La prova dell'armonia COVID-19 ha prodotto una prova rapida economica e diretta con le funzionalità simili alle prove basate a laboratorio convenzionali. I lavoratori di sanità hanno avuti un'accuratezza di 95% mentre usando l'analisi.

I risultati egualmente hanno mostrato che il kit difficile di armonia COVID-19 ha avuto alta sensibilità.

I reagenti pronti per l'uso nel kit difficile hanno aiutato con la specificità e l'accuratezza. L'analisi ha individuato circa 15 copie/reazione di RNA sintetico SARS-CoV-2 e dei campioni reali del RNA raccolti a più di 20 copie/reazione senza i falsi positivi. La prova poteva egualmente fornire risultati per gli alti campioni virali del caricamento in 17 minuti.

La prova egualmente ha individuato con successo i campioni con più di 20 particelle virali nella matrice nasale umana. Inoltre, la prova ha avuta sensibilità moderata per la saliva alle simili concentrazioni.

Specificamente, circa 97% dei campioni inventati nella matrice nasale è stato individuato e 83% dei campioni sono stati individuati in saliva.

“Il nostro livello attuale di sensibilità di analisi sarebbe sufficiente per individuare SARS-CoV-2 nella maggior parte delle copie nasali/tampone3 degli esemplari (9 ~10 - ~10) o le persone infettate copies/mL4 della saliva (8 ~10 - ~10) durante la prima settimana dopo l'inizio,„ hanno spiegato il gruppo di ricerca.

I ricercatori hanno attribuito l'alta sensibilità e la specificità della prova a usando una progettazione novella della sonda e della polimerasi per specificare fra SARS-CoV-2 dall'amplificazione di IAC.

Miglioramenti all'analisi

I ricercatori precisano che l'analisi di prova potrebbe essere modificata per aumentare la rilevazione di SARS-CoV-2. Spiegano quello che effettua la prova ad un dispositivo di raffreddamento e la temperatura più ottimale per l'enzima inverso di transcriptase seguito da un'più alta temperatura per l'amplificazione del DNA potrebbe potenzialmente aumentare la velocità o la sensibilità di rilevazione SARS-CoV-2.

Facendo uso di un controllo interno di amplificazione del RNA che riflette più esattamente il virus SARS-CoV-2 e che può essere imballato in una busta virale potrebbe anche migliorare i risultati. Lo studio corrente ha avuto l'uso di analisi di armonia COVID-19 un controllo interno di amplificazione del DNA, che non riesce ad afferrare i processi di conversione del cDNA e di lisi.

“Gli avanzamenti nella consapevolezza e nell'accettazione della prova per le infezioni al disgaggio e le piattaforme della tecnologia sviluppate avranno un vantaggio in corso per controllo COVID-19, diminuente il danno da altre malattie endemiche e le pandemie future combattenti,„ hanno concluso il gruppo di ricerca.

Avviso *Important

il medRxiv pubblica i rapporti scientifici preliminari che pari-non sono esaminati e, pertanto, non dovrebbero essere considerati conclusivi, guida la pratica clinica/comportamento correlato con la salute, o trattato come informazioni stabilite.

Journal reference:
Jocelyn Solis-Moreira

Written by

Jocelyn Solis-Moreira

Jocelyn Solis-Moreira graduated with a Bachelor's in Integrative Neuroscience, where she then pursued graduate research looking at the long-term effects of adolescent binge drinking on the brain's neurochemistry in adulthood.

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