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SARS-CoV-2 synthétique contre SARS-CoV-2

La pandémie de la maladie de coronavirus (COVID-19), provoquée par le coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de syndrôme respiratoire aigu sévère, menace la santé publique globale par des cas totaux et les morts atteignant plus de 212 million et 4,44 millions, respectivement.

Bien que les efforts de vaccination soient en cours dans la plupart des pays, il restent des options limitées pour traiter COVID-19. Maintenant, les chercheurs à l'État de Penn ont conçu un traitement COVID-19 neuf qui emploie une version synthétique défectueuse du virus SARS-CoV-2 pour nuire la réplication du virus réel.

Publié pendant la durée et l'environnement de PeerJ de tourillon, l'étude met en valeur l'utilisation du virus défectueux qui reproduit trois fois plus rapidement dues à sa taille plus courte, nuisant la réplication du virus réel. La version synthétique défectueuse pourrait être employée comme traitement antiviral de auto-introduction, où la version synthétique reproduit plus rapidement, le virus aidera à sa propre cession.

Étude : Un SARS-CoV-2 de intervention défectueux synthétique. Crédit d

Réplication défectueuse de génome

Les versions d'un génome viral avec de grandes omissions apparaissent fréquemment de la plupart des virus d'acide ribonucléique (ARN). Les génomes défectueux manquant des séquences programmées essentielles peuvent encore reproduire et emballé dans des virions en présence des virus actifs.

Le plein génome viral produit les protéines essentielles pour la réplication, qui peut être exploitée par les génomes défectueux qui maintiennent la capacité de gripper à ces protéines. Par conséquent, ces génomes défectueux sont considérés des parasites du virus intégral puisqu'ils concurrencent pour la réplication. Puisqu'ils sont plus courts dans la longueur, ils peuvent reproduire plus rapidement que leur génome parental intégral en cellules.

Les coronaviruses courants peuvent contenir ces génomes, génomes de intervention défectueux (DI) appelés. Dans SARS-CoV-2, les longues omissions ont été rapportées, et DI genomes ont été montrés pour apparaître par la recombinaison provoquée par microhomology de séquence.

L'étude

Dans l'étude, les chercheurs ont produit DI RNAs synthétique court des parties du génome du type sauvage SARS-CoV-2 pour examiner s'ils pourraient reproduire en cellules coinfected et être empaquetés dans des virions. Ils ont mesuré les quantités relatives des génomes de DI et de GRAMMAGE dans les cellules au-dessus des périodes, montrant l'interférence du génome de DI avec le génome de type sauvage (GRAMMAGE).

Virus de intervention défectueux synthétiques. (a) Trois parties du génome sauvage du type SARS-CoV-2 ont été employées pour produire un génome de intervention défectueux synthétique (DI1) et une version plus courte (DI0) comportant seulement des pièces des deux parties terminales. Les numéros délimitant les parties se rapportent à des positions dans le génome SARS-CoV-2. La première position est subie une mutation (→C) d
Virus de intervention défectueux synthétiques. (a) Trois parties du génome sauvage (WT) du type SARS-CoV-2 ont été employées pour produire un génome de intervention défectueux synthétique (DI1) et une version plus courte (DI0) comportant seulement des pièces des deux parties terminales. Les numéros délimitant les parties se rapportent à des positions dans le génome SARS-CoV-2. La première position est subie une mutation (→C) d'A dans DI1 et DI0. Les rectangles ouverts montrent la position des sondes et des amorces utilisées. (b) Pour produire DI particles synthétique, des éléments d'ADN correspondant à la séquence d'ARN de DI1 ou de DI0 ont été transcrits en ARN in vitro utilisant la polymérase ARN T7 et la transfecté en cellules Vero-E6 qui étaient alors infectées avec SARS-CoV-2. Le surnageant de ces cultures cellulaires a été employé pour infecter les cellules neuves.

Les résultats d'étude ont prouvé que le génome synthétique défectueux reproduit trois fois plus rapidement que SARS-CoV-2 en cellules coinfected et nuisent lui, réduisant la charge virale par environ moitié en 24 heures. Aucune différence entre les rendements d'emballage des deux génomes n'a été trouvée, car les débits de transmission étaient identiques. Par conséquent, il peut conclure que la quantité réduite de génomes de GRAMMAGE était due à l'interférence en raison de la réplication plus rapide du génome de DI. De manière significative, des quantités de DI genome si petites ils sont indétectables par l'intermédiaire de qRT-ACP peuvent nuire le virus de GRAMMAGE.

DI1 réduit la quantité de SARS-CoV-2 par moitié ; il reproduit 3 fois plus rapidement ; et il est transmettent se fanent avec le même rendement. (a) Taux de croissance (quantité absolue relativement à la valeur à 4 h) de GRAMMAGE dans les contrôles (gris) et dans les co-infections avec DI1 (bleu) ou DI0 (vert) ; à remarque relative de contrôles d
DI1 réduit la quantité de SARS-CoV-2 par moitié ; il reproduit 3 fois plus rapidement ; et il est transmettent se fanent avec le même rendement. (a) Taux de croissance (quantité absolue relativement à la valeur à 4 h) de GRAMMAGE dans les contrôles (gris) et dans les co-infections avec DI1 (bleu) ou DI0 (vert) ; à remarque relative de contrôles d'accroissement en même temps ; et petit groupe à 24 rendements de boîte de vitesses de H. (b) du GRAMMAGE (bleu) et du DI1 (jaune) dans les co-infections : la valeur, mesurée par qRT-ACP, juste avant que le passage divisé par le montant éligible maximum moyen de valeur sured presque immédiatement (4 h) après le passage (utilisant le surnageant pour infecter cellules neuves 24 h après l'infection initiale). DI0 a été trouvé à l'intérieur des cellules mais pas dans le surnageant. (c) Taux de croissance (quantité absolue relativement à la valeur à 4 h) de GRAMMAGE dans les contrôles (gris) et dans les co-infections (bleues) ; à remarque relative de trols d'escroquerie d'accroissement en même temps ; et petit groupe à 24 taux de croissance de H. (quantité absolue relativement à la valeur à 4 h) de GRAMMAGE (bleu) et de DI1 (jaune) dans les co-infections ; l'accroissement relatif cela du GRAMMAGE dans les co-infections se dirigent en même temps ; et petit groupe à 24 H.

En effet, le DIS pourrait être employé comme antivirals puisqu'ils reproduisent plus rapidement en cellules et nuisent le virus réel. En attendant, l'équipe a expliqué qu'à mesure que les génomes de DI augmentent dans la fréquence parmi le gisement de particules de virus, le procédé entre en vigueur jusqu'au déclin dans la quantité du type sauvage SARS-CoV-2 mène à la cession du virus et des DI. Une approche assimilée peut être employée dans les infections bactériennes et le cancer.

« Nous avons déterminé une épreuve de principe qu'un SARS-CoV-2 de intervention défectueux synthétique peut reproduire en cellules infectées avec le virus et nuire sa réplication, » les chercheurs conclus dans l'étude.

L'équipe a ajouté que d'autres études et expériences sont nécessaires pour vérifier le potentiel de SARS-CoV-2 DIS comme traitement antiviral. Ces études doivent déterminer l'efficacité de la méthode dans les lignées cellulaires humaines de poumon et contre certaines des variantes SARS-CoV-2 plus neuves de la préoccupation (VOC).  Il serait également utile d'analyser l'évolution des co-infections à long terme pour vérifier comment SARS-CoV-2 et son coevolve de DIS et, d'une manière primordiale, vérifie si les mutants résistants peuvent surgir.

Source:
Journal reference:
Angela Betsaida B. Laguipo

Written by

Angela Betsaida B. Laguipo

Angela is a nurse by profession and a writer by heart. She graduated with honors (Cum Laude) for her Bachelor of Nursing degree at the University of Baguio, Philippines. She is currently completing her Master's Degree where she specialized in Maternal and Child Nursing and worked as a clinical instructor and educator in the School of Nursing at the University of Baguio.

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