Advertencia: Esta página es una traducción de esta página originalmente en inglés. Tenga en cuenta ya que las traducciones son generadas por máquinas, no que todos traducción será perfecto. Este sitio Web y sus páginas están destinadas a leerse en inglés. Cualquier traducción de este sitio Web y su páginas Web puede ser imprecisa e inexacta en su totalidad o en parte. Esta traducción se proporciona como una conveniencia.

El nuevo estudio correlaciona la evolución del delta SARS-CoV-2 y del delta más variantes

Varias variantes SARS-CoV-2 de la preocupación han emergido desde el comienzo del pandémico COVID-19. Las mutaciones de cada oso que pueden aumentar transmisibilidad, permiten que SARS-CoV-2 escape establecieron inmunidad o alteran de otra manera el virus suficientemente para generar características nuevas.

La variante del delta SARS-CoV-2 soporta la mutación de D164G, que se sabe para aumentar aptitud física viral. Sin embargo, varias mutaciones adicionales se saben para ser comunes al delta y al delta más los linajes, por lo menos 25 según lo determinado en un estudio publicado recientemente en el gorrón de la autoinmunidad, situado principal en la proteína del pico del virus.

El delta y el delta más variantes son distintos

Dentro de este parte, las mutaciones T95I y W258L fueron encontrados para estar presentes en el 40% del delta más los genomas, con último faltar del genoma del delta. Los autores proponen que éstos sean incluidos en la definición de las mutaciones características del delta y del delta más variantes.

En busca de otras mutaciones de definición, el grupo analizaba los datos de alta calidad del genoma compaginado en la base de datos de la iniciativa global de la ciencia y de la fuente primaria, encontrando 656 mutaciones únicas a la variante del delta comparada con el wildtype y 269 al delta más variante.

Las mutaciones de la alta incidencia estaban presentes en por lo menos el 20% de muestras. Sin embargo, eran mayores entre el delta más variante, con 40 tales mutaciones comparadas con 29. Dos mutaciones, particularmente, estaban pesado frecuentes entre el delta más variante y casi ausentes de la variante del delta: V70F y W258L.

Las mutaciones A222V y T95I a la proteína del pico estaban presentes entre el 58% y el 38% del delta más variantes, respectivamente, con las mismas mutaciones presentes en el solamente 9% y el 22% de variantes del delta. Las mutaciones a las regiones con excepción de la proteína del pico siguieron una tendencia similar, con la mutación A328T a la proteína no-estructural 3 que estaba presente en el 58% de delta más muestras y de ninguno de las variantes del delta. Otras mutaciones a las proteínas no-estructurales tales como A446V (nsp4) están más fuertemente presentes entre el delta más la variante, el 58% comparado hasta el 9%.

El delta más variante ha sido distinguido en gran parte de la variante del delta por la presencia de la mutación de K417N, aunque este análisis implica que varias mutaciones adicionales deben ser consideradas.

El grupo después realizó análisis relativo de la abundancia para correlacionar el acontecimiento de mutaciones con la abundancia más de 20% en cada deformación. Dentro de la variante del delta, todas las mutaciones excepto T95I y G142D co-ocurrieron en todos los casos, con estas mutaciones estando presentes en el solamente ~25% y el ~50% de casos que soportaban otras mutaciones, respectivamente.

Dentro del delta más variante, el 40% de series contuvieron la mutación de W258L, entre la cual había una correlación fuerte con el resto de las mutaciones, incluyendo las mutaciones ya mencionadas de G142D y de T95I a la proteína del pico. Entre el delta más las muestras variables que soportaban la mutación variable D950N del delta de la firma, la mutación A446V a nsp4 estaba presente en el 90% de casos.

Detalles de variaciones genéticas en delta y delta más variantes. Panel A. Un gráfico del resplandor solar muestra la distribución de mutaciones en series variables del delta (n = 676) y del delta más series variables (n = 520) con la incidencia mayor de 35%. Todo el alto abrigo disponible, series completas de la variante del delta cerco durante el 6-13 de julio de 2021, fue transferido directamente de GISAID [5] y tramitado con NextClade [15]. La incidencia era calculada usando un script del pitón y una biblioteca internos de las pandas. Artesone la abundancia relativa del B. de las mutaciones del pico con mayor la incidencia de 20% en variante del delta. La incidencia era calculada usando series variables del delta (n = 676) usando un script interno del pitón. Artesone la abundancia relativa de la C. de las mutaciones del pico con mayor la incidencia de 20% en delta más variante. La incidencia era calculada usando delta más series variables (n = 288) usando un script interno del pitón. Artesone la incidencia de la D. de cinco mutaciones dominantes (T95I, G142D, R158G, L452R, T478K, y K417N) en diversos puntos del tiempo en series variables del delta (n = 600) y del delta más (n = 200) series variables. La incidencia era calculada y trazada con un script de R y una biblioteca ggplot2. Artesone el análisis temporal del E. del delta más mutaciones del interés. Las series del delta más variante clasificación por la fecha (n = 520) y fueron agrupadas en grupos de 100 por cada uno excepto el grupo pasado que contuvo 118 series. Dos series eran excluido debido a la mal calidad. Los alcances de la fecha fueron marcados por la primera y pasada fecha de la colección de la serie. La incidencia era calculada como se describe anteriormente. Los datos fueron trazados usando la biblioteca ggplot2 de R. Panel F. Un diagrama de Sankey que muestra la dinámica del delta más la introducción en los Estados Unidos. Para generar el diagrama de Sankey, alineamos el delta primero cerco y anticuado más serie de la India, de Inglaterra, de Japón, y de diversos estados de los E.E.U.U. Entonces agrupamos las series basadas sobre la fecha cerco y atajos de la homología del por ciento según lo indicado en la cima del alcance del gráfico y de la fecha mostrado abajo el gráfico.
Detalles de variaciones genéticas en delta y delta más variantes. Panel A. Un gráfico del resplandor solar muestra la distribución de mutaciones en series variables del delta (n = 676) y del delta más series variables (n = 520) con la incidencia mayor de 35%. Todo el alto abrigo disponible, series completas de la variante del delta cerco durante el 6-13 de julio de 2021, fue transferido directamente de GISAID [5] y tramitado con NextClade [15]. La incidencia era calculada usando un script del pitón y una biblioteca internos de las pandas. Artesone la abundancia relativa del B. de las mutaciones del pico con mayor la incidencia de 20% en variante del delta. La incidencia era calculada usando series variables del delta (n = 676) usando un script interno del pitón. Artesone la abundancia relativa de la C. de las mutaciones del pico con mayor la incidencia de 20% en delta más variante. La incidencia era calculada usando delta más series variables (n = 288) usando un script interno del pitón. Artesone la incidencia de la D. de cinco mutaciones dominantes (T95I, G142D, R158G, L452R, T478K, y K417N) en diversos puntos del tiempo en series variables del delta (n = 600) y del delta más (n = 200) series variables. La incidencia era calculada y trazada con un script de R y una biblioteca ggplot2. Artesone el análisis temporal del E. del delta más mutaciones del interés. Las series del delta más variante clasificación por la fecha (n = 520) y fueron agrupadas en grupos de 100 por cada uno excepto el grupo pasado que contuvo 118 series. Dos series eran excluido debido a la mal calidad. Los alcances de la fecha fueron marcados por la primera y pasada fecha de la colección de la serie. La incidencia era calculada como se describe anteriormente. Los datos fueron trazados usando la biblioteca ggplot2 de R. Panel F. Un diagrama de Sankey que muestra la dinámica del delta más la introducción en los Estados Unidos. Para generar el diagrama de Sankey, alineamos el delta primero cerco y anticuado más serie de la India, de Inglaterra, de Japón, y de diversos estados de los E.E.U.U. Entonces agrupamos las series basadas sobre la fecha cerco y atajos de la homología del por ciento según lo indicado en la cima del alcance del gráfico y de la fecha mostrado abajo el gráfico.

La adquisición de mutaciones por el linaje del delta

Para estudiar la dinámica de las mutaciones dominantes (T95I, G142D, R158G, L452R, T478K, y K417N) en cada deformación, el grupo determinó su incidencia en varios puntos del tiempo. Encontraron que cada uno aumentó de presencia dentro de la deformación del delta a lo largo de un año, y que cada uno estaba notablemente más presente en el delta más la deformación desde su origen.

La mutación K478 del delta más variante se sabe para aumentar la evasión inmune hacia gracias de algunos anticuerpos a una cadena lateral extendida que impida el atascamiento, dando por resultado la mayor transmisibilidad de la deformación. La influencia del otro delta más mutaciones es haber explicado menos bien, y el grupo examinó así imágenes de la microscopia del cryo-electrón para determinar qué cambios estructurales pueden inducir las mutaciones.

La mutación de G142D, que co-ocurrió con frecuencia con otras mutaciones, fue encontrada para causar un choque estérico con la cadena lateral R158 y para romper la conformación de la proteína del pico. La mutación R158G elimina este obstáculo estérico, y esta mutación fue encontrada conjuntamente con G142D en todo el delta más casos. Otra mutación, K417N, fue observada para actuar semejantemente a las mutaciones a K478, obstaculizando el atascamiento de anticuerpos a la proteína del pico.

Al rastrear el camino de la variante del delta a través del globo, el estado que la deformación originó en la India y viajó probablemente a través del Reino Unido, del Japón, y eventual del Washington, los E.E.U.U. del grupo. Desde entonces, la deformación ha adoptado las mutaciones dominantes para generar el delta distinto más variante.

El grupo destaca el gran número de mutaciones distintas características de esta deformación que co-ocurran con frecuencia. A este punto, el delta y el delta más variantes han diversificado con los perfiles únicos de la mutación, aprovisionados de combustible algo por las cavidades de la infección local, donante cada una ocasión de divergir.

Journal reference:
Michael Greenwood

Written by

Michael Greenwood

Michael graduated from Manchester Metropolitan University with a B.Sc. in Chemistry in 2014, where he majored in organic, inorganic, physical and analytical chemistry. He is currently completing a Ph.D. on the design and production of gold nanoparticles able to act as multimodal anticancer agents, being both drug delivery platforms and radiation dose enhancers.

Citations

Please use one of the following formats to cite this article in your essay, paper or report:

  • APA

    Greenwood, Michael. (2021, August 30). El nuevo estudio correlaciona la evolución del delta SARS-CoV-2 y del delta más variantes. News-Medical. Retrieved on November 28, 2021 from https://www.news-medical.net/news/20210830/New-study-maps-the-evolution-of-the-SARS-CoV-2-delta-and-delta-plus-variants.aspx.

  • MLA

    Greenwood, Michael. "El nuevo estudio correlaciona la evolución del delta SARS-CoV-2 y del delta más variantes". News-Medical. 28 November 2021. <https://www.news-medical.net/news/20210830/New-study-maps-the-evolution-of-the-SARS-CoV-2-delta-and-delta-plus-variants.aspx>.

  • Chicago

    Greenwood, Michael. "El nuevo estudio correlaciona la evolución del delta SARS-CoV-2 y del delta más variantes". News-Medical. https://www.news-medical.net/news/20210830/New-study-maps-the-evolution-of-the-SARS-CoV-2-delta-and-delta-plus-variants.aspx. (accessed November 28, 2021).

  • Harvard

    Greenwood, Michael. 2021. El nuevo estudio correlaciona la evolución del delta SARS-CoV-2 y del delta más variantes. News-Medical, viewed 28 November 2021, https://www.news-medical.net/news/20210830/New-study-maps-the-evolution-of-the-SARS-CoV-2-delta-and-delta-plus-variants.aspx.