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Les scientifiques recensent un point de reprise critique dans l'allongement de transcription

Licensing productive transcription through RNA polymerase II stability

Crédit visuel : Université Northwestern

Les scientifiques du nord-ouest de médicament ont recensé un point de reprise critique dans l'allongement de transcription, le procédé de synthétiser l'ARN d'une matrice d'ADN, selon des découvertes publiées en cellule moléculaire.

Selon l'étude, la présence d'une protéine SPT5 appelé sert de « passeport, » déterminant si un composé de polymérase est permis d'effectuer en bas de la longueur de l'ADN ou est au lieu dégradé et détruit.

Ali Shilatifard, PhD, professeur de Robert Francis Furchgott et présidence du Service de Biochimie et de la génétique moléculaire, était auteur supérieur de l'étude publiée en cellule moléculaire.

« Seulement la polymérase ARN IIs avec SPT5 sont permises de partir de la station, » a dit Ali Shilatifard, PhD, professeur de Robert Francis Furchgott, présidence des biochimies et de la génétique moléculaire et auteur supérieur de l'étude.

Beaucoup d'expériences de biologie moléculaire fonctionnent en effaçant un gène, ou la protéine pour laquelle le gène code, et en observant le choc, qui propose le fonctionnement de ce gène. Cependant, ces méthodes souvent produisent d'autres mutations ou exigent l'attente tant que 72 heures avant observation, laissant d'autres procédés de transcription se produire.

« Par cette remarque, vous rendez compte de l'effet quaternaire de la précipitation, » a dit Shilatifard, qui est également un professeur de la pédiatrie, directeur de l'institut de Simpson Querrey pour Epigenetics et un membre du centre de lutte contre le cancer de Robert H. Lurie Comprehensive de l'Université Northwestern.

La méthode expérimentale neuve, dégradation auxine-inductible appelée, permet l'observation immédiate des effets de l'épuisement de protéine. Dans l'étude, les chercheurs avaient l'habitude cette méthode pour interroger le rôle de la protéine SPT5 dans l'allongement de transcription.

Pendant l'allongement de transcription, les « promenades » complexes de la polymérase ARN II le long d'un brin d'ADN, éléments génétiques de copie à une boucle d'ARN. Le laboratoire de Shilatifard a précédemment découvert des pauses dans ce procédé lié aux points de reprise de réglementation. Maintenant, suivre cette méthode neuve de délétion du gène, ils ont découvert un point de reprise essentiel avant que l'allongement commence même.

En cellules avec SPT5 épuisé, la polymérase ne commencent jamais son voyage en bas du brin d'ADN. Au lieu de cela, on l'identifie en tant que défectueux et est dégradé. Comment exact on l'identifie reste inconnu, mais il est clair que SPT5 serve d'insigne de l'approbation, selon Yuki Aoi, PhD, un boursier post-doctoral dans le laboratoire de Shilatifard et auteur important de l'étude.

Yuki Aoi, PhD, un boursier post-doctoral dans le laboratoire de Shilatifard et auteur important de l'étude publiée en cellule moléculaire.

S'il y a des éditions ici, et la polymérase est permise de disparaître, il pourrait y avoir plus d'éditions en bas de la ligne. Elle permet seulement les polymérases qui sont certifiées pour partir parce qu'elles ont SPT5. »

Yuki Aoi, PhD, l'auteur important de l'étude

Les chercheurs ont également découvert qu'une protéine CUL3 appelé fait partie de la voie qui détruit des polymérases manquant de SPT5. Le gène que des indicatifs pour cette protéine et ses gènes associés sont subi une mutation dans beaucoup de cancers - probablement permettant aux polymérases mal formées de commencer leur voyage de transcription, ayant pour résultat les cellules anormales qui pourraient contribuer au cancer. C'est une voie d'intérêt grand, selon Aoi.

« Nous devons examiner cette tige au cancer, » Aoi a dit.

Source:
Journal reference:

Aoi, Y., et al. (2021) SPT5 stabilization of promoter-proximal RNA polymerase II. Molecular Cell. doi.org/10.1016/j.molcel.2021.08.006.