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Os cientistas identificam um ponto de verificação crítico no alongamento da transcrição

Licensing productive transcription through RNA polymerase II stability

Crédito video: Universidade Northwestern

Os cientistas do noroeste da medicina identificaram um ponto de verificação crítico no alongamento da transcrição, o processo de sintetizar o RNA de um molde do ADN, de acordo com os resultados publicados na pilha molecular.

De acordo com o estudo, a presença de uma proteína chamada SPT5 serve como um “passaporte,” determinando se um complexo da polimerase está permitido continuar abaixo do comprimento do ADN ou pelo contrário degradado e destruído.

Ali Shilatifard, PhD, professor de Robert Francis Furchgott e cadeira do departamento da bioquímica e da genética molecular, era autor superior do estudo publicado na pilha molecular.

“Somente a polimerase de RNA IIs com SPT5 é permitida sair da estação,” disse Ali Shilatifard, PhD, professor de Robert Francis Furchgott, cadeira da bioquímica e autor molecular do genética e o superior do estudo.

Muitas experiências da biologia molecular operam-se pela supressão de um gene, ou a proteína que o gene codifica para, e pela observação do impacto, que sugere a função desse gene. Contudo, estes métodos frequentemente produzem outras mutações ou exigem a espera enquanto 72 horas antes da observação, reservando por outros processos da transcrição ocorrer.

“Por esse ponto, você está relatando no efeito quaternário do knockdown,” disse Shilatifard, que é igualmente um professor da pediatria, director do instituto de Simpson Querrey para Epigenetics e um membro do centro do cancro de Robert H. Lurie Detalhado da Universidade Northwestern.

O método experimental novo, chamado degradação auxina-inducible, permite a observação imediata dos efeitos da prostração da proteína. No estudo, os investigador usaram este método para interrogar o papel da proteína SPT5 no alongamento da transcrição.

Durante o alongamento da transcrição, caminhadas complexas” da polimerase de RNA as “II ao longo de uma costa de ADN, elementos genéticos de copi a uma costa do RNA. O laboratório de Shilatifard tem descoberto previamente pausas neste processo ligado aos pontos de verificação reguladores. Agora, usando este método novo do supressão do gene, descobriram um ponto de verificação crucial antes que o alongamento comece mesmo.

Nas pilhas com o SPT5 esgotado, a polimerase nunca começa sua viagem abaixo da costa do ADN. Em lugar de, reconhece-se como defeituoso e é degradado. Como exactamente se reconhece permanece desconhecido, mas é claro que SPT5 serve como um emblema da aprovação, de acordo com Yuki Aoi, PhD, um companheiro pos-doctoral no laboratório de Shilatifard e autor principal do estudo.

Yuki Aoi, PhD, um companheiro pos-doctoral no laboratório de Shilatifard e autor principal do estudo publicado na pilha molecular.

Se há umas edições aqui, e a polimerase está permitida ir, poderia haver mais edições abaixo da linha. Está permitindo somente as polimerases que são certificadas para sair porque têm SPT5.”

Yuki Aoi, PhD, o autor principal do estudo

Os investigador igualmente descobriram que uma proteína chamada CUL3 é parte do caminho que destrói as polimerases que faltam SPT5. O gene que os códigos para esta proteína e seus genes associados são transformados em muitos cancros - possivelmente permitindo que as polimerases deformados comecem sua viagem da transcrição, tendo por resultado as pilhas aberrantes que poderiam contribuir ao cancro. Este é um caminho do grande interesse, de acordo com Aoi.

“Nós precisamos de examinar esta relação ao cancro,” Aoi disse.

Source:
Journal reference:

Aoi, Y., et al. (2021) SPT5 stabilization of promoter-proximal RNA polymerase II. Molecular Cell. doi.org/10.1016/j.molcel.2021.08.006.