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Los científicos determinan un punto de verificación crítico en la elongación de la transcripción

Licensing productive transcription through RNA polymerase II stability

Haber video: Universidad Northwestern

Los científicos del noroeste del remedio han determinado un punto de verificación crítico en la elongación de la transcripción, el proceso de sintetizar el ARN de un patrón de la DNA, según las conclusión publicadas en célula molecular.

Según el estudio, la presencia de una proteína llamada SPT5 sirve como “pasaporte,” determinando si un complejo de la polimerasa está permitido proceder abajo del largo de la DNA o en lugar de otro degradado y destruido.

Ali Shilatifard, doctorado, el profesor de Roberto Francisco Furchgott y silla del departamento de la bioquímica y de la genética molecular, era autor mayor del estudio publicado en célula molecular.

“Solamente la polimerasa de ARN IIs con SPT5 se permite salir de la estación,” dijo a Ali Shilatifard, doctorado, el profesor de Roberto Francisco Furchgott, silla de la bioquímica y autor molecular del genética y mayor del estudio.

Muchos experimentos de la biología molecular operan suprimiendo un gen, o la proteína para la cual el gen cifra, y observando el impacto, que sugiere la función de ese gen. Sin embargo, estos métodos producen otras mutaciones o requieren a menudo esperar mientras 72 horas antes de la observación, permitiendo otros procesos de la transcripción ocurrir.

“Por ese punto, usted está denunciando sobre el efecto cuaternario de la precipitación,” dijo a Shilatifard, que es también profesor de la pediatría, director del instituto de Simpson Querrey para Epigenetics y una pieza del centro del cáncer de Roberto H. Lurie Comprehensive de la Universidad Northwestern.

El nuevo método experimental, llamado degradación auxina-inducible, permite la observación inmediata de los efectos del agotamiento de la proteína. En el estudio, los investigadores utilizaron este método para interrogar al papel de la proteína SPT5 en la elongación de la transcripción.

Durante la elongación de la transcripción, paseos complejos” de la polimerasa de ARN los “II a lo largo de un cabo de la DNA, elementos genéticos de copiado a un cabo del ARN. El laboratorio de Shilatifard ha descubierto previamente pausas en este proceso conectado a los puntos de verificación reguladores. Ahora, usando este nuevo método de supresión del gen, han descubierto un punto de verificación crucial antes de que la elongación incluso comience.

En células con SPT5 agotado, la polimerasa nunca comienza su viaje abajo del cabo de la DNA. En lugar, se reconoce como defectuoso y se degrada. Cómo se reconoce exactamente sigue siendo desconocido, pero está sin obstrucción que SPT5 sirve como emblema de la aprobación, según Yuki Aoi, doctorado, becario postdoctoral en el laboratorio de Shilatifard y autor importante del estudio.

Yuki Aoi, doctorado, becario postdoctoral en el laboratorio de Shilatifard y autor importante del estudio publicado en célula molecular.

Si hay entregas aquí, y la polimerasa se permite ir, podría haber más entregas abajo de la línea. Está permitiendo solamente las polimerasas que se certifican para irse porque tienen SPT5.”

Yuki Aoi, doctorado, el autor importante del estudio

Los investigadores también descubrieron que una proteína llamada CUL3 es parte del camino que destruye las polimerasas que faltan SPT5. El gen que las claves para esta proteína y sus genes asociados se transforman en muchos cánceres - posiblemente permitiendo que las polimerasas malformadas comiencen su viaje de la transcripción, dando por resultado las células aberrantes que podrían contribuir al cáncer. Éste es un camino del gran interés, según Aoi.

“Necesitamos examinar este eslabón al cáncer,” Aoi dijo.

Source:
Journal reference:

Aoi, Y., et al. (2021) SPT5 stabilization of promoter-proximal RNA polymerase II. Molecular Cell. doi.org/10.1016/j.molcel.2021.08.006.