Attenzione: questa pagina è una traduzione automatica di questa pagina originariamente in lingua inglese. Si prega di notare in quanto le traduzioni sono generate da macchine, non tutte le traduzioni saranno perfetti. Questo sito web e le sue pagine web sono destinati ad essere letto in inglese. Ogni traduzione del sito e le sue pagine web possono essere imprecise e inesatte, in tutto o in parte. Questa traduzione è fornita per comodità.

Le differenze nella metilazione del DNA hanno potuto predire esattamente la progressione dell'affezione epatica

I risultati di uno studio nazionale piombo dall'istituto di ricerca di traduzione di genomica (TGen), una filiale della città di speranza, identificano i biomarcatori potenziali che potrebbero finalmente essere usati per diagnosticare le fasi progressive dell'affezione epatica.

I ricercatori hanno identificato le differenze nella metilazione del DNA (DNAm) che ha predetto esattamente le fasi differenti di fibrosi del fegato, sfregio del fegato nocivo, in altrettanto come 94% dei pazienti con l'affezione epatica grassa analcolica (NAFLD), secondo lo studio pubblicato nel giornale Epigenetics clinico.

NAFLD è l'affezione epatica cronica più comune fra le nazioni occidentali, caratterizzate dalle capitalizzazioni di grasso nel fegato. La metilazione è un trattamento biologico in cui i gruppi metilici si aggiungono alla molecola del DNA. Questo trattamento può cambiare l'attività di DNA senza cambiare la sua sequenza, o compitare, di miliardi di lettere che compongono il materiale genetico di una persona.

I reticoli di DNAm possono essere usati per identificare la cella distinta digita dentro il fegato e cambia in composizione cella tipa.„

Johanna DiStefano, Ph.D., il professor in programma metabolico e fibrotico di TGen di malattia e testa del diabete di TGen e dell'unità fibrotica di malattia

È uno degli autori senior dello studio.

Dati esaminati studio da 325 pazienti

Facendo uso dei campioni recuperati dalle biopsie, i ricercatori hanno esaminato i dati genomica da 325 pazienti con NAFLD: 206 senza fegato evidente che sfregia e 119 con i livelli di variazione di fibrosi, che nel suo modulo più severo possono diventare una circostanza hanno chiamato lo steatohepatitis analcolico (NASH) ed a loro volta piombo alla cirrosi, al cancro del fegato ed alla morte.

Facendo uso di DNAm per stimare la composizione cellulare di questi campioni, i ricercatori hanno trovato che i livelli più severi di fibrosi fossero associati con un aumento progressivo nella percentuale delle celle immuni nel fegato e una diminuzione corrispondente nella percentuale delle celle epiteliali, un tipo di cella che allinea le varie superfici dell'organismo, compreso gli organi quale il fegato.

Karen Conneely, Ph.D., professore associato nel dipartimento della genetica umana alla scuola di medicina di Emory University e un autore senior dello studio, ha spiegato che i ricercatori egualmente hanno trovato che anche dopo le differenze rappresentanti in composizione cellulare fra le persone, i livelli di DNAm ai siti specifici nel genoma sono stati diminuiti in pazienti con fibrosi severa. Le differenze direzione abbastanza che il Nicholas Johnson, Ph.D. e un autore principale di Emory dello studio, potesse sviluppare un modello basato su DNAm a 28 siti genomica che potrebbero determinare esattamente i livelli di fibrosi in 94% dei pazienti di NAFLD in un insieme della prova indipendente.

“Questi risultati sono coerenti con DNAm come sostegno del meccanismo, o le variazioni di tracciatura e in relazione con la fibrosi nella composizione nelle cellule e dimostrano il potenziale di DNAm come biomarcatore possibile di fibrosi di NAFLD,„ ha detto Xiumei Wu, Ph.D., uno scienziato del personale di TGen nel laboratorio di DiStefano ed uno degli autori dello studio.

Guardando avanti agli studi futuri

Per questo studio, i campioni sono stati ricavati direttamente dai fegati pazienti via l'uso relativamente dilagante delle biopsie. Approfittando della tecnologia pionieristica a da TGen, suggeriscono che i campioni futuri potrebbero essere ottenuti da sangue di circolazione.

“DNAm di circolazione è stato suggerito come biomarcatore non invadente potenziale della severità di malattia per NAFLD,„ lo studio ha detto. “Questi risultati indicano che il nostro modello potrebbe potenzialmente predire la fibrosi di NAFLD nel sangue DNAm.„

L'analisi futura anche potrebbe essere complementata usando l'ordinamento unicellulare del RNA, un metodo più impegnativo di analizzare le informazioni genomiche, che hanno il potenziale di misurare la composizione nelle cellule ad un più di alta risoluzione e di facilitazione della comprensione maggior della relazione fra fibrosi di NAFLD, la composizione cellulare e DNAm.

“In generale, la nostra ricerca indica che DNAm fornisce informazioni che sono non solo utili per la comprensione della biologia di fondo di NAFLD,„ il Dott. DiStefano ha detto, “ma può anche servire da strumento clinico capace indipendente di diagnostica della fibrosi.„

Source:
Journal reference:

Johnson, N.D., et al. (2021) Differential DNA methylation and changing cell-type proportions as fibrotic stage progresses in NAFLD. Clinical Epigenetics. doi.org/10.1186/s13148-021-01129-y.