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As diferenças no methylation do ADN podiam exactamente prever a progressão da infecção hepática

Os resultados de um estudo nacional conduzido pelo instituto de investigação Translational da genómica (TGen), uma filial da cidade da esperança, identificam os biomarkers potenciais que puderam eventualmente ser usados para diagnosticar fases progressivas da infecção hepática.

Os pesquisadores identificaram diferenças no methylation do ADN (DNAm) que previu exactamente fases diferentes da fibrose do fígado, scarring do fígado danificado, no tanto como como 94% dos pacientes com infecção hepática gorda não alcoólica (NAFLD), de acordo com o estudo publicado no jornal Epigenetics clínico.

NAFLD é a infecção hepática crônica a mais comum entre os estados ocidentais, caracterizados por acumulações de gordura no fígado. O Methylation é um processo biológico em que os grupos metílicos são adicionados à molécula do ADN. Este processo pode mudar a actividade do ADN sem mudar sua seqüência, ou soletrá-la, de biliões de letras que compo o modelo genético de um indivíduo.

Os testes padrões de DNAm podem ser usados para identificar a pilha distinta dactilografam dentro o fígado, e mudam-no no pilha-tipo composição.”

Johanna DiStefano, Ph.D., professor no programa metabólico e Fibrotic de TGen da doença, e no chefe do diabetes de TGen e a unidade Fibrotic da doença

É um dos autores superiores do estudo.

Dados examinados estudo de 325 pacientes

Usando as amostras recuperadas por biópsias, os pesquisadores examinaram dados genomic de 325 pacientes com NAFLD: 206 sem o fígado aparente que scarring, e 119 com níveis de variação de fibrose, que em seu formulário mais severo podem progredir a uma circunstância chamaram o steatohepatitis não alcoólico (NASH), e conduzem-no por sua vez à cirrose, ao cancro do fígado, e à morte.

Usando DNAm para calcular a composição celular destas amostras, os pesquisadores encontraram que uns níveis mais severos da fibrose estiveram associados com um aumento progressivo na porcentagem de pilhas imunes no fígado, e uma diminuição correspondente na porcentagem de pilhas epiteliais, um tipo de pilha que as linhas vário corpo surgissem, incluindo órgãos tais como o fígado.

Karen Conneely, Ph.D., professor adjunto no departamento da genética humana na Faculdade de Medicina da universidade de Emory, e um autor superior do estudo, explicou que os pesquisadores igualmente encontraram que mesmo depois diferenças esclarecendo na composição celular entre indivíduos, os níveis de DNAm em locais específicos no genoma estiveram diminuídos nos pacientes com fibrose severa. As diferenças golpeavam bastante que o Nicholas Johnson, Ph.D., e um autor principal de Emory do estudo, podia desenvolver um modelo baseado em DNAm em 28 locais genomic que poderiam exactamente prever níveis da fibrose em 94% de pacientes de NAFLD em um grupo do teste independente.

“Estes resultados são consistentes com o DNAm como um sustentamento do mecanismo, ou as SHIFT marcando, fibrose-relacionadas na composição de pilha, e demonstram o potencial de DNAm como um biomarker possível da fibrose de NAFLD,” disse Xiumei Wu, Ph.D., um cientista do pessoal de TGen no laboratório de DiStefano, e um dos autores do estudo.

Anticipar aos estudos futuros

Para este estudo, as amostras foram seleccionadas directamente dos fígados pacientes através do uso relativamente invasor das biópsias. Aproveitando-se da tecnologia aberta caminho por TGen, sugerem que as amostras futuras possam ser obtidas do sangue de circulação.

“DNAm de circulação foi sugerido como um biomarker não invasor potencial da severidade da doença para NAFLD,” o estudo disse. “Estes resultados sugerem que nosso modelo poderia potencial prever a fibrose de NAFLD no sangue DNAm.”

A análise futura igualmente poderia ser complementada usando arranjar em seqüência do RNA da único-pilha, um método mais exigente de analisar a informação genomic, que tem o potencial medir a composição de pilha em um mais de alta resolução, e de facilitar uma compreensão maior do relacionamento entre a fibrose de NAFLD, a composição celular, e o DNAm.

“Total, nossa investigação mostra que DNAm fornece a informação que é não somente útil para compreender a biologia subjacente de NAFLD,” Dr. DiStefano disse, “mas pode igualmente servir como uma ferramenta clínica capaz independente de diagnosticar a fibrose.”

Source:
Journal reference:

Johnson, N.D., et al. (2021) Differential DNA methylation and changing cell-type proportions as fibrotic stage progresses in NAFLD. Clinical Epigenetics. doi.org/10.1186/s13148-021-01129-y.