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Las diferencias en la metilación de la DNA podían predecir exacto la progresión de la enfermedad del higado

Las conclusión de un estudio nacional llevado por el instituto de investigación de translación de la genómica (TGen), afiliado de la ciudad de la esperanza, determinan los biomarkers potenciales que se pudieron utilizar eventual para diagnosticar escenarios progresivos de la enfermedad del higado.

Los investigadores determinaron diferencias en la metilación de la DNA (DNAm) que predijo exacto diversos escenarios de la fibrosis del hígado, el marcar con una cicatriz del hígado dañado, en tanto como 94% de pacientes con enfermedad del higado grasa sin alcohol (NAFLD), según el estudio publicado en el gorrón Epigenetics clínico.

NAFLD es la enfermedad del higado crónica más común entre los estados occidentales, caracterizados por acumulaciones de grasa en el hígado. La metilación es un proceso biológico en el cual agregan a los grupos metílicos a la molécula de la DNA. Este proceso puede cambiar la actividad de la DNA sin el cambio de su serie, o el deletreo, de los mil millones de las cartas que componen la heliografía genética de un individuo.

Las configuraciones de DNAm se pueden utilizar para determinar la célula distinta pulsan hacia adentro el hígado, y cambian en el célula-tipo composición.”

Juana DiStefano, Ph.D., profesor en el programa metabólico y fibrótico de TGen de la enfermedad, y el jefe de la diabetes de TGen y de la unidad fibrótica de la enfermedad

Ella es uno de los autores mayores del estudio.

Datos examinados estudio a partir de 325 pacientes

Usando las muestras extraídas por biopsias, los investigadores examinaron datos genomic a partir de 325 pacientes con NAFLD: 206 sin el hígado evidente que marcaba con una cicatriz, y 119 con los niveles de variación de fibrosis, que en su forma más severa pueden progresar a una condición llamaron steatohepatitis sin alcohol (NASH), y a su vez llevan a la cirrosis, al cáncer del hígado, y a la muerte.

Usando DNAm para estimar la composición celular de estas muestras, los investigadores encontraron que niveles más severos de la fibrosis fueron asociados a un aumento progresivo en el porcentaje de células inmunes en el hígado, y una disminución correspondiente del porcentaje de células epiteliales, un tipo de célula que forra diversas superficies de la carrocería, incluyendo órganos tales como el hígado.

Karen Conneely, Ph.D., profesor adjunto en el departamento de la genética humana en la Facultad de Medicina de la universidad de Emory, y autor mayor del estudio, explicó que los investigadores también encontraron que incluso después diferencias que explicaban en la composición celular entre los individuos, los niveles de DNAm en los sitios específicos en el genoma fueron disminuidos en pacientes con fibrosis severa. Las diferencias golpeaban suficientes que Nicholas Johnson, Ph.D., y autor importante de Emory del estudio, podía desarrollar un modelo basado en DNAm en 28 sitios genomic que podrían predecir exacto niveles de la fibrosis en el 94% de pacientes de NAFLD en un equipo de la prueba independiente.

“Estas conclusión son constantes con DNAm como apuntalamiento del mecanismo, o los movimientos de marcado, fibrosis-relacionados en la composición de célula, y demuestran el potencial de DNAm como biomarker posible de la fibrosis de NAFLD,” dijo a Xiumei Wu, Ph.D., científico del estado mayor de TGen en el laboratorio de DiStefano, y uno de los autores del estudio.

El anticipar a los estudios futuros

Para este estudio, las muestras fueron extraídas directamente de los hígados pacientes vía el uso relativamente invasor de biopsias. Aprovechándose de la tecnología promovida por TGen, sugieren que las muestras futuras se pudieron obtener de sangre de circulación.

De “DNAm circulación se ha sugerido como biomarker no invasor potencial de la severidad de la enfermedad para NAFLD,” el estudio dijo. “Estos resultados sugieren que nuestro modelo podría potencialmente predecir fibrosis de NAFLD en la sangre DNAm.”

El análisis futuro también se podría complementar usando la secuencia unicelular del ARN, un método más exigente de analizar la información genomic, que tiene el potencial de medir la composición de célula en un más de alta resolución, y de facilitar una mayor comprensión del lazo entre la fibrosis de NAFLD, la composición celular, y DNAm.

“Total, nuestra investigación muestra que DNAm ofrece la información que es no sólo útil para entender la biología subyacente de NAFLD,” el Dr. DiStefano dijo, “pero puede también servir como herramienta clínica capaz independientemente de diagnosticar fibrosis.”

Source:
Journal reference:

Johnson, N.D., et al. (2021) Differential DNA methylation and changing cell-type proportions as fibrotic stage progresses in NAFLD. Clinical Epigenetics. doi.org/10.1186/s13148-021-01129-y.