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La relegazione drasticamente ha diminuito la trasmissione delle varianti COVID-19 in Spagna durante la prima onda

Gli studi più completi sulle varianti del coronavirus che ha dominato i primi ondeggia in Spagna appena sono stati pubblicati nella genetica della natura. Lo studio è stato effettuato dal consorzio di SeqCOVID, che comprende più di 50 istituzioni spagnole piombo dall'università di Valencia, dell'istituto della biomedicina di Valencia (IBV, CSIC) e delle fondamenta di Fisabio.

Un anno e mezzo dopo lo scoppio della pandemia COVID-19, lo studio scientifico più completo sulle varianti del coronavirus che ha circolato in Spagna durante “la prima onda„ è stato pubblicato. Lo studio identifica nove varianti del virus che ha dominato la pandemia fra i mesi di marzo e giugno 2020.

Fra loro, i due più comuni sono venuto da uno stirpe di SARS-CoV-2 abbondante in paesi asiatici a quel tempo, sebbene il virus arrivasse pricipalmente tramite i contatti dai paesi europei con più di 500 introduzioni, secondo di natura la genetica pubblicata studio. Il lavoro conclude che la relegazione imposta servito drasticamente per diminuire la trasmissione di queste varianti, anche più contagiose quelle, che siano state sostituite da altre a partire dall'estate di 2020 in cui le misure di controllo sono state facilitate.

Lo studio ha utilizzato 2.500 campioni dei pazienti diagnosticati in Spagna durante la prima onda della pandemia, raccolti da 40 ospedali ed ordinati dal consorzio di SeqCOVID, da un gruppo di ricerca composti di più di 50 istituzioni spagnole e dai centinaia di ricercatori che piombo l'università di Valencia, dell'istituto della biomedicina di Valencia (IBV, CSIC) e delle fondamenta per la promozione di salubrità e la ricerca biomedica della Comunità valenzana (Fisabio). I campioni analizzati rappresentano 1% di tutti i casi diagnosticati nella prima onda (14% prima del lockdown).

Il gruppo di ricerca ha identificato 9 varianti del virus (chiamato sec, Clades epidemico inglese-spagnolo), che erano quelle che dominassero questa prima onda in Spagna. Due di loro (SEC7 e SEC8) erano in primo luogo individuati nel paese ed in quei predominanti durante quel periodo e sono associati con almeno due eventi conosciuti della super-dispersione: la corrispondenza diAtalanta-Valencia della Champions League e un funerale in Vitoria, sebbene i fuochi in anticipo siano identificati in altre parti del paese.

C'erano una singola introduzione non del virus in Spagna, ma entrate indipendenti piuttosto multiple (almeno 500), dalle origini internazionali differenti. Questi si sono presentati pricipalmente durante febbraio e marzo 2020, prima dell'entrata in vigore delle misure di controllo.

Gli eventi e la mobilità di Superdispersion, digitano le onde differenti

“La maggior parte delle prime infezioni dell'onda prima del lockdown in Spagna sono state causate dagli sforzi dello stirpe di A del coronavirus. Questi erano abbondanti in paesi asiatici a quel tempo, ma hanno avute meno presenza nel resto dei paesi europei, in cui gli sforzi di stirpe B hanno dominato. Ciò non significa che le introduzioni di SARS-CoV-2 nel nostro paese erano pricipalmente asiatiche. In realtà, vediamo che la maggior parte delle introduzioni viene dai paesi europei, ma gli sforzi di stirpe di A sono stati stabiliti più presto e, grazie agli eventi di superdispersion, si sono espanti rapido nel nostro paese„, spiegano il álvaro Chiner, uno dei ricercatori di CSIC nel IBV di Valencia che ha partecipato allo studio.

I ricercatori hanno osservato un simile reticolo per la variante che ha dominato nella seconda onda (nominata 20E (EU1)), che hanno pubblicato appena in natura. Questa variante si è espanta rapido in Spagna ha aiutato dagli eventi della super-dispersione ed ha finito dominando la seconda onda in Spagna e molta di Europa, connesso con mobilità dell'estate.

Ciò è una lezione che non abbiamo imparato a partire dall'estate scorsa.„

Candela di Fernando González, il professor, università di Valencia

Efficace lockdown

Inoltre, la prima opera dell'onda pubblicata nella genetica della natura quantifica l'efficacia delle misure applicate per gestire il virus durante la prima onda. Tutte le varianti identificate hanno diminuito significativamente la loro prevalenza e trasmissione dallo stato dell'allarme. Praticamente sono scomparso all'estremità della prima onda e sono state sostituite dalle nuove varianti che sono emerso di estate, quando le misure del lockdown erano rilassate.

“Il Lockdown era altamente efficace nella fermata della trasmissione del virus. Non solo per le varianti dominanti SEC7 e SEC8, ma tutto quelli che circolano a quel tempo, compreso quelli che hanno contenuto la mutazione genetica di S ha richiesto D614G, che era il primo che è stato indicato per aumentare il transmissibility del virus„, osservazioni Mariana López, ad un ricercatore dal CSIC al IBV ed al co-author dello studio.

“Stiamo vedendo qualche cosa di simile attraverso le onde. Stiamo individuando le varianti più ereditarie, ma il loro impatto può essere gestito con le misure di controllo appropriate. Dovunque queste misure non siano esistito o siano più rilassate, le varianti hanno aggravato gli scoppi. È accaduto nel Regno Unito con l'alfa variante e sta accadendo in Spagna con il delta uno„, indica i comi di Iñaki, ricercatore di CSIC al coordinatore di IBV SeqCOVID.

Sorveglianza genomica durante le seguenti onde

Secondo il gruppo di ricerca del consorzio di SeqCOVID, i risultati di questo funzionano come pure quello della seconda onda pubblicata recentemente in natura, dimostra la necessità di comprendere l'epidemiologia genomica mentre uno nuovo strumento di salute pubblica per tenere la carreggiata il virus e per identificare le varianti di maggior impatto.

“La sorveglianza attiva per le mutazioni virali deve continuare per valutare la minaccia di nuove varianti con i rischi potenziali per gestire l'epidemia. Quello è uno degli obiettivi che abbiamo definito noi stessi all'interno della piattaforma tematica interdisciplinare di salubrità globale del CSIC„, delle osservazioni Mireia Coscollá, di un ricercatore all'università di Valencia all'istituto per biologia di sistemi integrante (I2SysBio, UV-CSIC) e di uno dei coordinatori di studio.

Il lavoro di SeqCOVID ha contribuito alla creazione di una rete genomica nazionale di sorveglianza diretta dal centro per il coordinamento degli avvisi di salubrità e delle emergenze (CCAES) e coordinata dall'istituto di salubrità di Carlos III (ISCIII). Questa rete completamente è integrata nel lavoro di cura degli ospedali.

Source:
Journal reference:

Hodcroft, E. B., et al. (2021) Spread of a SARS-CoV-2 variant through Europe in the summer of 2020. Nature. doi.org/10.1038/s41586-021-03677-y.