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O confinamento reduziu dràstica a transmissão das variações COVID-19 na Espanha durante a primeira onda

Os estudos os mais completos nas variações do coronavirus que dominou os primeiros acenam na Espanha foram publicados apenas na genética da natureza. O estudo foi realizado pelo consórcio de SeqCOVID, que inclui as mais de 50 instituições espanholas conduzidas pela universidade de Valência, do instituto da biomedicina de Valência (IBV, CSIC), e da fundação de Fisabio.

Um ano e meio após a manifestação da pandemia COVID-19, o estudo científico o mais completo nas variações do coronavirus que circulou na Espanha durante a “primeira onda” foi publicado. O estudo identifica nove variações do vírus que dominou a pandemia entre os meses de março e junho de 2020.

Entre eles, os dois os mais comuns vieram de uma linhagem de SARS-CoV-2 abundante em países asiáticos naquele tempo, embora o vírus chegasse principalmente por contactos dos países europeus com mais de 500 introduções, de acordo com por natureza a genética publicada estudo. O trabalho conclui que o confinamento impor servido para reduzir dràstica a transmissão destas variações, mesmo as mais contagiosos, que foram substituídas por outro até à data do verão de 2020 em que as medidas de controle foram facilitadas.

O estudo usou 2.500 amostras de pacientes diagnosticados na Espanha durante a primeira onda da pandemia, recolhidos por 40 hospitais e arranjados em seqüência pelo consórcio de SeqCOVID, por uma equipa de investigação compo das mais de 50 instituições espanholas e por centenas de pesquisadores que conduzem a universidade de Valência, do instituto da biomedicina de Valência (IBV, CSIC) e da fundação para a promoção da saúde e a pesquisa biomedicável da comunidade Valencian (Fisabio). As amostras analisadas representam 1% de todos os casos diagnosticados na primeira onda (14% antes do lockdown).

A equipa de investigação identificou 9 variações do vírus (chamado segundo, Clades epidémico inglês-espanhol), que eram essas que dominaram esta primeira onda na Espanha. Dois delas (SEC7 e SEC8) eram detectados primeiramente no país e nos predominantes durante esse período, e são associados com pelo menos os dois eventos conhecidos da super-dispersão: o fósforo de Atalanta-Valência da Champions League e um funeral em Victoria, embora os focos adiantados sejam identificados em outras partes do país.

Havia uma não única introdução do vírus na Espanha, mas as entradas independentes um pouco múltiplas (pelo menos 500), das origens internacionais diferentes. Estes ocorreram principalmente durante fevereiro e março de 2020, antes da aplicação das medidas de controle.

Eventos de Superdispersion e mobilidade, chave nas ondas diferentes

“A maioria das primeiras infecções da onda antes do lockdown na Espanha foram causadas por tensões da linhagem de A do coronavirus. Estes eram abundantes em países asiáticos naquele tempo, mas tiveram menos presença no resto dos países europeus, onde as tensões da linhagem B dominaram. Isto não significa que as introduções de SARS-CoV-2 em nosso país eram principalmente asiáticas. Na realidade, nós vemos que a maioria das introduções vem dos países europeus, mas as tensões da linhagem de A foram estabelecidas mais cedo e, agradecimentos aos eventos do superdispersion, expandiram ràpida em nosso país”, explicam o álvaro Chiner, um dos pesquisadores de CSIC no IBV de Valência que participou no estudo.

Os pesquisadores observaram um teste padrão similar para a variação que dominou na segunda onda (nomeada 20E (EU1)), que apenas publicou na natureza. Esta variação expandiu ràpida na Espanha ajudada por eventos da super-dispersão e terminada acima de dominar a segunda onda na Espanha e em muita de Europa, associado com a mobilidade do verão.

Esta é uma lição que nós não aprendamos do verão passado.”

Candelas de Fernando González, professor, universidade de Valência

Lockdown eficaz

Além, o primeiro trabalho da onda publicado na genética da natureza determina a eficácia das medidas executadas para controlar o vírus durante a primeira onda. Todas as variações identificadas reduziram suas predominância e transmissão significativamente do estado de alarme. Desapareceram praticamente na extremidade da primeira onda e foram substituídos pelas variações novas que emergiram no verão, quando as medidas do lockdown eram relaxado.

O “Lockdown era altamente eficaz em parar a transmissão do vírus. Não somente para as variações dominantes SEC7 e SEC8, mas para todo o aqueles que circulam naquele tempo, incluindo aqueles que contiveram a mutação genética de S chamou D614G, que eram o primeiro que foi mostrado para aumentar o transmissibility do vírus”, observações Mariana López, um pesquisador do CSIC no IBV e o co-autor do estudo.

“Nós estamos vendo algo similar através das ondas. Nós estamos detectando umas variações mais transmissíveis, mas seu impacto pode ser controlado com as medidas de controle apropriadas. Onde quer que estas medidas não existiram nem são mais relaxado, as variações agravaram as manifestações. Aconteceu no Reino Unido com a variação alfa e está acontecendo na Espanha com o delta um”, indica os comas de Iñaki, pesquisador de CSIC no coordenador de IBV SeqCOVID.

Fiscalização Genomic durante as seguintes ondas

De acordo com a equipa de investigação do consórcio de SeqCOVID, os resultados deste trabalham, assim como aquele da segunda onda publicada recentemente na natureza, demonstra a necessidade de incorporar a epidemiologia genomic como uma ferramenta de uma saúde mais pública para seguir o vírus e para identificar as variações do maior impacto.

“A fiscalização activa para mutações virais deve continuar a fim avaliar a ameaça de variações novas com riscos potenciais para controlar a epidemia. Aquele é um dos objetivos que nós ajustamos nós dentro da plataforma temático interdisciplinar da saúde global do CSIC”, comenta Mireia Coscollá, um pesquisador na universidade de Valência no instituto para a biologia de sistemas Integrative (I2SysBio, UV-CSIC) e um dos coordenadores do estudo.

O trabalho de SeqCOVID contribuiu à criação de uma rede Genomic nacional da fiscalização dirigida pelo centro para a coordenação dos alertas da saúde e das emergências (CCAES) e coordenada pelo instituto da saúde de Carlos III (ISCIII). Esta rede é integrada inteiramente no trabalho do cuidado dos hospitais.

Source:
Journal reference:

Hodcroft, E. B., et al. (2021) Spread of a SARS-CoV-2 variant through Europe in the summer of 2020. Nature. doi.org/10.1038/s41586-021-03677-y.