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A análise nova revela diferenças distintas entre perfis moleculars de 3D e 2D pilhas cultivadas

Oncotarget publicou “o proteomics microsomal comparativo de um câncer pulmonar que modelo a linha celular NCI-H23 revela diferenças distintas entre perfis moleculars de 3D e as 2D pilhas cultivadas” que relataram aquela para verificar diferenças fenotípicas entre estas duas condições distintas da cultura, estes autores realizaram uma análise proteomic comparativa de uma fracção da membrana obtida da linha celular NCI-H23 de 3D- e de modelo de 2D-cultured NSCLC.

Esta análise revelou um mapa de 1.166 espécies da proteína reguladas na maneira dependente da cultura, incluindo o regulamento diferencial de um subconjunto de moléculas baseadas na superfície do CD da pilha. Confirmaram a expressão exclusiva de CD99, de CD146 e de CD239 na cultura 3D.

A carcinoma do pulmão é o cancro o mais mortal nos Estados Unidos e no mundo inteiro.

Dr. Josip Louro, laboratório nacional de Frederick para a investigação do cancro

Em 2019, a sociedade contra o cancro americana relatou 142.670 mortes do câncer pulmonar nos Estados Unidos. O câncer pulmonar afecta homens e mulheres ingualmente, com uma taxa de sobrevivência de cinco anos total de 19%. Histològica, 80-85% de todos os casos pertencem ao câncer pulmonar da não-pequeno-pilha. O formulário o mais comum de NSCLC é o adenocarcinoma do pulmão.

Apesar da pesquisa extensiva e dos investimentos econômicos, aproximadamente 95% de drogas novas contra a carcinoma do pulmão falham eventualmente nos ensaios clínicos. In vitro as culturas bidimensionais aderentes de linha celular humanas do cancro são o modelo pré-clínico do teste do essencial usado na revelação da droga do câncer pulmonar e descoberta. Em tumores contínuos, contudo, as células cancerosas crescem em um ambiente tridimensional. Isto faz as 2D pilhas cultivadas incapazes de reproduzir verdadeiramente a proliferação, a migração, e/ou a permeação naturais da droga que ocorre em seu ambiente 3D inato.

Para contornar este defeito, a cultura de célula cancerosa 3D foi propor como modelo pré-clínico mais exacto/mais relevante do teste, não somente biomecânica mas igualmente a genoma, proteome, e nível do metabolome. Esta aproximação igualmente cria um caminho para a revelação de um atlas pré-clínico que descreve os perfis moleculars das linha celular crescidas no 2D contra 3D, a informação que é gravemente necessário monitora exactamente a revelação da droga. O proteomics Senhora-baseado contemporâneo representa uma tecnologia poderoso capaz de revelar alterações na expressão/regulamento do nível da proteína e muda-a nas alterações cargo-translational associadas com a avaliação pré-clínica da droga.

Além disso, o fenótipo molecular diferencial de um proteome da membrana da linha celular de NSCLC crescido no 2D contra 3D-culture ainda está faltando.

A equipa de investigação mais loura concluiu em sua pesquisa de Oncotarget Output que as pilhas NCI-H23 abrigam o mutante homozygous de KRas4BG12C e poderiam ser usadas como um modelo pré-clínico de NSCLC testando os inibidores covalent alelo-específicos que ligam ao cysteine na posição 12 do mutante de G12C KRas4B. Importante, a aproximação actual permite proteoform- directo e a quantificação alelo-específica das mudanças regulamento no mutante de KRasWT e de KRasG12C, e pode facilmente ser empregada em respostas de determinação aos inibidores covalent alelo-específicos ou a todos os outros compostos terapêuticos que afetam a expressão de Ras.

O proteomics da espingarda é igualmente favorável à quantificação anticorpo-livre absoluta de isoforms de Ras usando padrões tryptic isoform-específicos pesados sintéticos para a monitoração paralela LC-MS-baseada da reacção, estes autores do peptide descritos previamente visando o receptor xenotropic e polytropic 1 do retrovirus em uma mistura complexa da proteína da membrana.

Source:
Journal reference:

Kaczmarczyk, J. A., et al. (2021) Comparative microsomal proteomics of a model lung cancer cell line NCI-H23 reveals distinct differences between molecular profiles of 3D and 2D cultured cells. Oncotarget. doi.org/10.18632/oncotarget.28072.