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El nuevo análisis revela diferencias distintas entre los perfiles moleculares de 3D y las 2.as células cultivadas

Oncotarget publicó “proteomics microsomal comparativo de una variedad de células modelo NCI-H23 del cáncer de pulmón revela diferencias distintas entre los perfiles moleculares de 3D y las 2.as células cultivadas” que denunciaron eso para comprobar diferencias fenotípicas entre estas dos condiciones distintas de la cultura, estos autores realizaron un análisis proteomic comparativo de una fracción de la membrana obtenida de la variedad de células NCI-H23 de 3D- y del modelo de 2D-cultured NSCLC.

Este análisis reveló un mapa de 1.166 especies de la proteína reguladas de manera relacionada de la cultura, incluyendo la regla diferenciada de un subconjunto de moléculas superficie-basadas célula del CD. Confirmaron la expresión exclusiva de CD99, de CD146 y de CD239 en la cultura 3D.

El carcinoma del pulmón es el cáncer más mortal de los Estados Unidos y por todo el mundo.

El Dr. Josip Blonder, laboratorio nacional de Frederick para la investigación de cáncer

En 2019, la Sociedad del Cáncer americana denunció 142.670 muertes del cáncer de pulmón en los Estados Unidos. El cáncer de pulmón afecta a hombres y a mujeres igualmente, con una tasa de supervivencia de cinco años total del 19%. Histológico, 80-85% de todos los casos pertenece al cáncer de pulmón de la no-pequeño-célula. La forma más común de NSCLC es la adenocarcinoma del pulmón.

A pesar de la investigación extensa e inversiones económicas, los cerca de 95% de nuevas drogas contra carcinoma del pulmón fallan eventual en juicios clínicas. Las culturas ines vitro bidimensionales adherentes de las variedades de células humanas del cáncer son el modelo preclínico de la prueba del apoyo principal usado en el revelado del medicamento para el cáncer del pulmón y descubrimiento. En tumores sólidos, sin embargo, las células cancerosas crecen en un ambiente tridimensional. Esto hace las 2.as células cultivadas incapaces de reproducir verdad la proliferación, la migración, y/o la penetración a través de los poros naturales de la droga que ocurre en su ambiente natural 3D.

Para evitar este defecto, el cultivo celular de célula cancerosa 3D se ha propuesto como modelo preclínico más exacto/más relevante de la prueba, no sólo biomecánico pero también en el genoma, el proteome, y el nivel del metabolome. Esta aproximación también crea un camino hacia el revelado de un atlas preclínico que representa los perfiles moleculares de las variedades de células crecidas en 2.os comparado con 3D, la información que es dolorido necesaria vigila exacto el revelado de la droga. El proteomics Ms-basado contemporáneo representa una tecnología potente capaz de revelar cambios en la expresión/la regla del nivel de la proteína y cambia en las modificaciones poste-de translación asociadas a la evaluación preclínica de la droga.

Además, el fenotipo molecular diferenciado de un proteome de la membrana de la variedad de células de NSCLC crecido en 2.o comparado con 3D-culture todavía está faltando.

El equipo de investigación más rubio concluyó en su investigación de Oncotarget hecha salir que las células NCI-H23 abrigan el mutante homocigótico de KRas4BG12C y se podrían utilizar como modelo preclínico de NSCLC para probar los inhibidores covalentes alelo-específicos que atan a la cisteína en la posición 12 del mutante de G12C KRas4B. Importantemente, la actual aproximación permite proteoform- directo y la cuantificación alelo-específica de cambios en regla del mutante de KRasWT y de KRasG12C, y se puede emplear fácilmente en reacciones de cuantificación a los inhibidores covalentes alelo-específicos o a cualquier otra composición terapéutica que afectan a la expresión de Ras.

El proteomics de la escopeta es también favorable a la cuantificación anticuerpo-libre absoluta de los isoforms de Ras usando los patrones trípticos isoform-específicos pesados sintetizados para la supervisión paralela LC-MS-basada de la reacción, estos autores del péptido descritos previamente apuntando el receptor xenotropic y politrópico 1 del retrovirus en una mezcla compleja de la proteína de la membrana.

Source:
Journal reference:

Kaczmarczyk, J. A., et al. (2021) Comparative microsomal proteomics of a model lung cancer cell line NCI-H23 reveals distinct differences between molecular profiles of 3D and 2D cultured cells. Oncotarget. doi.org/10.18632/oncotarget.28072.