Avertissement : Cette page est une traduction automatique de cette page à l'origine en anglais. Veuillez noter puisque les traductions sont générées par des machines, pas tous les traduction sera parfaite. Ce site Web et ses pages Web sont destinés à être lus en anglais. Toute traduction de ce site et de ses pages Web peut être imprécis et inexacte, en tout ou en partie. Cette traduction est fournie dans une pratique.

Utilisant le microbiota nasopharyngal en tant que tôt biomarqueur dans les patients avec COVID-19

La maladie 2019 (COVID-19), qui de coronavirus est provoquée par le coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de syndrôme respiratoire aigu sévère a prétendu plus de 4,8 millions de durées mondiales et continue à être un danger global important.

Le dépistage des bornes pronostiques tôt de COVID-19 est primordial en raison de la mortalité élevée et de la gravité de la maladie. Les résultats faibles liés à COVID-19 sont non seulement dus au viral infection mais également en raison de la réaction immunitaire anormale d'hôte.

Étude : Microbiota nasopharyngal comme biomarqueur tôt de gravité dans les patients hospitalisés COVID-19 : une étude de cohorte rétrospective dans un endroit méditerranéen. Crédit d'image : qcontrol/Shutterstock.com

Microbiota et COVID-19

La gravité de COVID-19 a été liée à plusieurs facteurs pronostiques tels que l'âge, les comorbidités, le sexe, les facteurs génétiques, et les situations géographiques. Ces caractéristiques aident à introduire des réactions immunitaires, ainsi qu'évitent des réactions immunitaires antivirales excessives.

Le microbiota est connu pour influencer l'histoire naturelle de beaucoup de maladies infectieuses. L'évolution clinique des maladies respiratoires continuelles, ainsi que des infections respiratoires virales, a été également marquée avec le microbiota respiratoire. Par conséquent, plusieurs études concernant la pathologie COVID-19 et le microbiota ont été entreprises pour déterminer le rôle du microbiota dans la susceptibilité d'une personne à l'infection SARS-CoV-2.

Plusieurs de ces études ont confirmé la relation entre la composition d'une personne respiratoire et étripent le microbiota et la gravité de la maladie. En dépit de ces découvertes, les études longitudinales évaluant le microbiota comme facteur pronostique pour la gravité de la maladie manquent toujours.

Une étude neuve publiée sur le bioRxiv* de serveur de prétirage a visé à analyser le microbiota nasopharyngal des patients qui ont été hospitalisés avec COVID-19. Ici, les chercheurs également ont été également intéressés à déterminer la relation entre les résultats cliniques SARS-CoV-2 et le microbiota en recensant les genres ou les caractéristiques qui pourraient servir de bornes pronostiques.

Au sujet de l'étude

L'étude actuelle impliquée une cohorte rétrospective de 177 patients adultes qui ont été hospitalisés avec COVID-19 entre du 27 février 2020 au 22 janvier 2021. L'infection SARS-CoV-2 a été confirmée par le test d'amplification en chaîne par polymérase de transcriptase inverse (RT-PCR).

Sur l'admission à l'hôpital, des échantillons nasopharyngaux ont été rassemblés et enregistrés à -80 °C. Ces échantillons plus tard ont été employés pour l'isolement et la quantification de l'acide désoxyribonucléique (ADN).

La diversité microbienne mesurée par les index de diversité d'alpha et de bêta, ainsi que la composition taxonomique du microbiota, ont été déterminées par analyse bioinformatic et l'ordonnancement de la deuxième génération d'amplicon de microbiota (NGS).

Les caractéristiques cliniques, le laboratoire et les tests radiologiques, la présence des comorbidités, les traitements prescrits, et les résultats pendant la phase aiguë de l'infection SARS-CoV-2 des patients ont été rassemblés de leurs dossiers médicaux digitaux.

Découvertes d'étude

Hors des 177 patients compris dans l'étude actuelle, 57,6% étaient des mâles et il y avait un âge moyen de 68 ans. L'évaluation des patients après six jours de sympt40mes a prouvé que 89,2% ont eu la pneumonie. Le taux de mortalité s'est avéré 17. 5%, avec 11,3% des patients ayant besoin de la ventilation artificielle invasive (IMV).

Les index de diversité d'alpha et de bêta se sont avérés inférieurs dans les patients présentant des issues fatales, de ce fait en outre proposant que la diversité microbienne inférieure soit associée à une gravité COVID-19 plus élevée.


Analyse taxonomique : Venn diagrams pour IMV (a), et issue fatale (b), et abondances relatives de genres différentiels pour IMV (c), et sous-populations d'issue fatale (d). Des abondances relatives sont montrées dans l'écaille logarithmique. IMV : la ventilation artificielle invasive, FO : Issue fatale.

En outre, peu de genres des bactéries se sont avérés plus abondants dans les patients COVID-19, indépendamment des patients appartenant à l'IMV ou aux groupes d'issue fatale. Ces bactéries ont compris des espèces des espèces de streptocoques, du staphylocoque, et des espèces de corynebactérie.

Les chercheurs ont également constaté que les espèces de Selenomonas, les espèces de Filifactor, les espèces de Chroococcidiopsis, et les espèces d'actinobacillus étaient plus abondantes dans des patients de non-IMV. Comparativement, la présence des espèces de Selenomonas, des espèces de Filifactor, les espèces d'actinobacillus, ou les espèces de Chroococcidiopsis ont été associées à un risque réduit d'IMV.

Dans les patients qui ont succombé aux issues fatales, des espèces d'actinobacillus, les espèces de Craurococcus, les espèces de citrobactérie, et les espèces de Moheibacter se sont avérées plus abondantes dans des patients de non-exitus. Des espèces d'actinobacillus, les espèces de citrobactérie, les espèces de Craurococcus, ou les espèces de Moheibacter ont été associées à un risque réduit d'issues fatales. Cependant, cette relation n'a pas persisté après réglage pour les confounders principaux.

L'étude est cliniquement appropriée, car c'était coût bas et tenu compte du dépistage rapide de la diversité et des genres des microbes pendant l'admission des patients à l'hôpital. En outre, l'étude actuelle était efficace en déterminant qu'une diversité plus élevée a été trouvée dans les patients sans issues fatales ou IMV. L'étude actuelle a également prouvé que certains genres spécifiques des microbes étaient présents dans les patients hospitalisés avec COVID-19 qui pourrait servir de biomarqueurs tôt.

Cependant, la relation entre le microbiota et le COVID-19 est toujours un en activité et un domaine de la recherche en expansion. La future recherche doit être faite pour déterminer leurs rôles exacts dans le développement COVID-19 et l'évolution.

Limitations

L'étude actuelle était une d'observation, unique-centre, étude rétrospective où la collecte des données n'a pas été normalisée. La petite taille de l'échantillon, avec l'absence des différences dans les caractéristiques parmi les patients admis à l'hôpital, n'a pas tenu compte de l'évaluation globale.

L'amplicon de l'ARN ribosomique 16S ordonnançant l'approche a pu également introduire de biais. D'ailleurs, l'analyse de bio-informatique des microbes n'a pas été normalisée encore, qui pourraient entraver l'évaluation des résultats.

avis *Important

le bioRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
Suchandrima Bhowmik

Written by

Suchandrima Bhowmik

Suchandrima has a Bachelor of Science (B.Sc.) degree in Microbiology and a Master of Science (M.Sc.) degree in Microbiology from the University of Calcutta, India. The study of health and diseases was always very important to her. In addition to Microbiology, she also gained extensive knowledge in Biochemistry, Immunology, Medical Microbiology, Metabolism, and Biotechnology as part of her master's degree.

Citations

Please use one of the following formats to cite this article in your essay, paper or report:

  • APA

    Bhowmik, Suchandrima. (2021, October 04). Utilisant le microbiota nasopharyngal en tant que tôt biomarqueur dans les patients avec COVID-19. News-Medical. Retrieved on December 07, 2021 from https://www.news-medical.net/news/20211004/Using-nasopharyngeal-microbiota-as-early-biomarker-in-patients-with-COVID-19.aspx.

  • MLA

    Bhowmik, Suchandrima. "Utilisant le microbiota nasopharyngal en tant que tôt biomarqueur dans les patients avec COVID-19". News-Medical. 07 December 2021. <https://www.news-medical.net/news/20211004/Using-nasopharyngeal-microbiota-as-early-biomarker-in-patients-with-COVID-19.aspx>.

  • Chicago

    Bhowmik, Suchandrima. "Utilisant le microbiota nasopharyngal en tant que tôt biomarqueur dans les patients avec COVID-19". News-Medical. https://www.news-medical.net/news/20211004/Using-nasopharyngeal-microbiota-as-early-biomarker-in-patients-with-COVID-19.aspx. (accessed December 07, 2021).

  • Harvard

    Bhowmik, Suchandrima. 2021. Utilisant le microbiota nasopharyngal en tant que tôt biomarqueur dans les patients avec COVID-19. News-Medical, viewed 07 December 2021, https://www.news-medical.net/news/20211004/Using-nasopharyngeal-microbiota-as-early-biomarker-in-patients-with-COVID-19.aspx.