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La recherche met en valeur des défis en utilisant des caractéristiques de Ct pour guider la planification COVID-19 clinique

Le coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de syndrôme respiratoire aigu sévère est associé à un risque global élevé de morbidité et de mortalité parmi les patients qui ont des comorbidités. Dans les patients COVID-19, l'hypertension, l'obésité, et les diabetes mellitus se sont avérées les comorbidités les plus répandues

La majorité de patients qui ont été infectés avec le négatif du test SARS-CoV-2 pendant 14 jours suivant l'infection initiale, alors que quelques patients peuvent rester ARN positif pendant des mois. L'émergence récente des réinfections, les cas de vaccin-découverte, et les variantes du COV de préoccupation, telles que la variante de triangle, qui a été observée pour monter à des titres plus élevés de virus, soulignent l'impératif clinique pour interpréter les résultats SARS-CoV-2 positifs de la même personne.

Le test actuel d'étalon-or pour SARS-CoV-2 est les tests diagnostique cliniques de RT-PCR, cependant, ce test n'est pas quantitatif. Les valeurs de Ct gagnées du test de RT-PCR sont inversement marquées avec la valeur d'ARN actuelle dans un échantillon, mais elles sont influencées par des caractéristiques de spécimen, de patient et de tests diagnostique.

Dans une étude neuve, une collaboration des chercheurs des instituts variés a décrit l'histoire naturelle du contrôle SARS-CoV-2, qui comprend des valeurs de Ct parmi les patients qui avaient vérifié des périodes multiples positives, avant l'émergence de VOCs dans la sortie de virage vaccinique. De plus, les auteurs analysent le calendrier de la positivité et les caractéristiques cliniques de la population des patients présentant la positivité SARS-CoV-2 prolongée.

Une version de prétirage de cette étude, qui est de subir encore l'inspection professionnelle, est procurable sur le serveur de prétirage de medRxiv*.

Caractéristiques de test diagnostique des patients présentant les tests multiples du positif SARS-CoV-2

Des 207 patients qui ont eu multiple les tests positifs dans cette étude qui n'a pas manifesté ont prolongé la positivité, 17 configurations montrées de positivité intermittente dues à avoir au moins un test négatif entre leur premier et dernier test positif. Cette positivité intermittente a été vue plus de trois fois davantage parmi les 57 patients qui ont manifesté la positivité prolongée dans cette étude.

Les valeurs de Ct des tests de RT-PCR se baissent couramment au fil du temps, mais des régimes variables du déclin ont été observés des patients dans cette étude. Des patients qui avaient manifesté la positivité prolongée, 123 d'entre eux ont eu des valeurs de Ct procurables, obtenu à partir de leurs premiers et derniers tests positifs.

Parmi ces patients, les tests positifs finaux étaient les 9,8 cycles médians plus haut si comparés la première fois à eux ont vérifié le positif, qui indique que des quantités inférieures d'ARN ont été trouvées. Cependant, 11 de ces patients ont manifesté plus de quantités élevées d'ARN dans leur dernier test positif si comparés à leur premier.

Les tests positifs généraux et finaux se sont échelonnés 22,5 cycles de plus bas 31,8 cycles à plus de haut, avec les positifs finaux déterminant près de la limite de détection (>35) 21 patients. La première et dernière caractéristique de Ct de test était procurable pour 36 des patients qui avaient prolongé les tests positifs. Les tests positifs finaux étaient une médiane 14 cycles de plus de haut que les premiers tests positifs.

Par opposition aux patients sans positivité prolongée, il n'y avait aucun patient présentant la positivité prolongée qui a eu des valeurs terminales de Ct de test inférieures que leur premier test positif.

Des patients positifs prolongés, 33 ont eu les tests positifs près de la limite du dépistage (>35Ct), qui est compatible avec le déclin de l'ADN viral au fil du temps. Cependant, après que le premier test positif, par le jour 40, 5 patients manifestât toujours des valeurs de Ct de <35, et un patient a vérifié le positif, montrant une valeur de Ct de <35 109 jours après le test positif initial.

Résumé d
Résumé d'heure entre d'abord et pour la dernière fois test positif pour des patients présentant les tests positifs multiples. L'axe des y indique des jours entre d'abord et pour la dernière fois test positif, différents points indiquent différents patients. Le bleu indique le patient positif prolongé défini au point de rupture naturel de > la 3ème durée de quartile, gris indique le patient positif à court terme. Le plot de violon et de cadre indiquent la distribution générale des jours entre d'abord et pour la dernière fois test positif.

Implications

Les résultats de 8% des patients montrant la positivité intermittente avec les tests multiples du positif SARS-CoV-2 avant que la boîte de vitesses supportée de COV proposent que la qualité des échantillons joue un rôle important dans le Ct donne droit.

Intéressant, il était trois fois pour qu'un patient positif prolongé manifeste la positivité intermittente. Ainsi, les résultats intermittents de négatif de quelques patients peuvent être dus à l'intervention thérapeutique, dynamique de rejet variable, entre d'autres variables, qui devraient être explorées dans de futures études.

Pendant que la pandémie continue à progresser et VOCs capable des titres plus élevés et des découvertes vacciniques telles que la variante de triangle deviennent plus répandu, l'information longitudinale de contrôle avec la variabilité en valeurs de CT sera plus accessible à plus de nombre important de patients.

En raison de l'ajout des variantes nouvelles dans la circulation, il deviendra indispensable d'être conscient de la possibilité de rejet variable à n'importe quel stade de l'infection et d'être prudent quand interprétant des valeurs de Ct comme proxy mesure la gravité et le pouvoir infectant.

C'est d'urgence grande que des tests diagnostique sont développés et déployés qui peuvent distinguer entre la réinfection et le rejet prolongé, qui fourniront l'analyse dans l'infectiousness et aideront avec les futures étapes de la pandémie.

Avis *Important

le medRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Références

Journal reference:
Colin Lightfoot

Written by

Colin Lightfoot

Colin graduated from the University of Chester with a B.Sc. in Biomedical Science in 2020. Since completing his undergraduate degree, he worked for NHS England as an Associate Practitioner, responsible for testing inpatients for COVID-19 on admission.

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