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Évolution SARS-CoV-2 introduite par l'hospitalisé à long terme d'infection avec l'épuisement de cellules de B

Les scientifiques ont développé plusieurs vaccins de la maladie 2019 de coronavirus (COVID-19), qui ont reçu l'autorisation d'utilisation d'approbation ou de secours (EUA) des organismes de normalisation globaux de manager l'infection du syndrôme respiratoire aigu sévère coronavirus-2 (SARS-CoV-2).

SARS-CoV-2 est l'agent causal de la pandémie COVID-19 actuelle qui a prétendu plus de 4,8 millions de durées mondiales. Intéressant, les études précédentes ont indiqué qu'humoral (anticorps-assisté) et l'immunité à médiation cellulaire est essentielle à l'infection complet claire SARS-CoV-2.

Cellule de B épuisant des traitements et l'infection SARS-CoV-2

Des patients immunodéprimés soumis au lymphocyte B épuisant des traitements se sont avérés pour remarquer l'infection SARS-CoV-2 prolongée et le rejet viral. Bien que le rejet viral pourrait se produire pendant des mois après le début des sympt40mes, des virus viables n'ont pas été trouvés après neuf sympt40mes de goujon-maladie de jours. La réplication virale persistante peut entraîner les défectuosités profondes de lymphocyte dû au b et le lymphocyte T épuisant les traitements ou la maladie hématologique fondamentale. Un aspect important de la persistance du virus dans les réglages immunodéprimés est le développement des variantes, particulièrement pendant le traitement convalescent de plasma.

Plusieurs études récent publiées ont indiqué que SARS-CoV-2 dans des hôtes d'immunodéprimé tend à entraîner des mutations d'omission dans la protéine de pointe, particulièrement dans le domaine S1. Généralement, la région S1 de la protéine de pointe de SARS-CoV-2 est responsable de déterminer l'interaction d'hôte-virus pour introduire l'invasion virale à la cellule hôte. Dans l'immunocompétent et des hôtes infectés immunodéprimés, les omissions peuvent se produire en travers du génome viral qui peut modifier le mécanisme de l'interaction de virus-hôte. Les chercheurs ont constaté que des protéines annexes telles qu'ORF7ab et ORF8, qui sont associés à la stimulation tôt de la production d'IFN-γ, ont été effacées dans un grand nombre de personnes d'immunocompétent.

Une étude neuve

Une étude neuve publiée sur le serveur de prétirage de medRxiv* s'est concentrée sur un patient présentant un viral infection symptomatique persistant pendant plus d'une année. Les chercheurs ont amplifié les transcriptions sous-génomiques pour le gène d'E (sgE) utilisant les groupes nasopharyngaux du patient infecté avec SARS-CoV-2 au cours de 335 jours. Ce patient a également eu une histoire du traitement de lymphocyte T de VÉHICULE. Le SARS-CoV-2 vérifie avait été effectué utilisant les écouvillons nasopharyngaux du patient, et, intéressant, ils sont restés le positif COVID-19 constamment. Complétez l'ordonnancement génomique a été conduit sur les échantillons nasopharyngaux provenant du patient.

Chronologie des tests diagnostique pour SARS-CoV-2 et demande de règlement. Des spécimens nasopharyngaux ou oro-pharyngés (respiratoire supérieur) ont été rassemblés pour le dépistage de l
Chronologie des tests diagnostique pour SARS-CoV-2 et demande de règlement. Des spécimens nasopharyngaux ou oro-pharyngés (respiratoire supérieur) ont été rassemblés pour le dépistage de l'ARN SARS-CoV-2, à moins qu'une fois indiqué par ce qui suit : # indique l'échantillon de BAL, * indique des jours où des spécimens d'expectoration ont été rassemblés et le † indique des jours où la salive a été rassemblée. Des spécimens avec des valeurs de Ct plus de 40 ont été considérés négatifs pour l'ARN SARS-CoV-2. L'ACP pour l'ARN sous-génomique a été effectué seulement sur les spécimens qui ont vérifié le positif pour l'ARN génomique. Des échantillons qui ont été employés pour l'ordonnancement de la deuxième génération sont indiqués avec un cercle orange. Des demandes de règlement administrées sont indiquées avec une flèche noire et marquées.

Les découvertes principales

L'analyse des caractéristiques de ordonnancement a indiqué la persistance de l'infection COVID-19 sur une période de 335 jours. Les auteurs ont déclaré jusqu'à présent cela, ceci est peut-être l'infection rapportée la plus prolongée avec SARS-CoV-2. Cette étude a indiqué une trajectoire évolutionnaire du virus basé sur le taux de mutation de la polymérase. Les chercheurs ont constaté que le patient a montré les sympt40mes SARS-CoV-2 pour la période entière de l'infection.

Les études de courant ont montré ce le virus accumulé une seule omission de dans-bâti dans le domaine d'aminé-borne (NTD) de la protéine de pointe, au cours de la période d'une année. On avait observé un genre assimilé d'omission dans la variante de lambda (B.1.351), qui a contenu l'omission de NTD et une mutation de R246I. La raison pour laquelle l'omission dans cette région du NTD se produit dans un patient immunodéprimé n'est pas encore apparente. Cependant, cet état est en conformité avec des études précédentes montrant que l'infection SARS-CoV-2 continuelle se produit dans sévèrement des hôtes d'immunodéprimé qui ont suivi la demande de règlement convalescente de plasma. En outre, cette condition mène à l'émergence des variantes SARS-CoV-2 et à l'efficacité réduite des anticorps de neutralisation. Le patient immunodéprimé considéré dans cette étude a été également soumis à une demande de règlement convalescente de plasma pendant sa première admission au hôpital.

Cette d'étude omission 497nt rapportée également dans les gènes ORF7b et ORF8, et c'est la plus longue omission rapportée dans cette région du génome. On a observé pour la première fois une telle omission dans un patient immunodéprimé. Une étude précédente a eu les omissions ORF7b/ORF8 rapportées dans cette envergure de région de 62nt à 382nt. Cette mutation a été recensée la première fois à Singapour en janvier de 2020.

Les études antérieures ont indiqué que les mutants d'omission peuvent être moins efficaces en déterminant l'infection dans un hôte neuf dû à la perte de caractéristiques immunisées d'évasion d'ORF8. Des études plus tôt ont également prouvé qu'ORF8 est un antagoniste principal d'immunité innée. Par conséquent l'omission de ce gène obtient un robuste et hautement une réponse immunitaire spécifique pendant l'infection. Intéressant, une grande omission a été trouvée dans le patient immunodéprimé, qui pourrait s'être produit parce que la nature d'immunodéprimé de ce patient a éliminé un besoin d'ORF8 pendant l'infection.

On a observé les auteurs rapportés qui quand le patient a été soigné avec le plasma convalescent de remdesivir et de haut-titre, après l'apparence des mutations d'omission dans le génome viral, jeu de l'infection.

Conclusions

Cette étude propose que sévèrement les patients immunodéprimés puissent remarquer l'infection SARS-CoV-2 prolongée avec les sympt40mes non significatifs et la réplication virale persistante. Les auteurs ont mis l'accent sur l'importance d'analyser des mutations virales dans ce groupe de patients car il y a une possibilité élevée de l'émergence des variantes. Les scientifiques ont indiqué que plus de recherche est exigée pour déterminer l'évolution de SARS-CoV-2 dans des hôtes d'immunodéprimé, en particulier, quant au transmissibility et à la virulence.

Avis *Important

le medRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
Dr. Priyom Bose

Written by

Dr. Priyom Bose

Priyom holds a Ph.D. in Plant Biology and Biotechnology from the University of Madras, India. She is an active researcher and an experienced science writer. Priyom has also co-authored several original research articles that have been published in reputed peer-reviewed journals. She is also an avid reader and an amateur photographer.

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    Bose, Priyom. (2021, October 06). Évolution SARS-CoV-2 introduite par l'hospitalisé à long terme d'infection avec l'épuisement de cellules de B. News-Medical. Retrieved on November 29, 2021 from https://www.news-medical.net/news/20211006/SARS-CoV-2-evolution-promoted-by-long-term-infection-in-patient-with-B-cell-depletion.aspx.

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