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Evoluzione SARS-CoV-2 promossa dal ricoverato a lungo termine di infezione con svuotamento del linfocita B

Gli scienziati hanno sviluppato parecchi vaccini di malattia 2019 di coronavirus (COVID-19), che hanno ricevuto l'autorizzazione di uso di emergenza o di approvazione (EUA) dagli enti competenti globali occuparsi dell'infezione di sindrome respiratorio acuto severo coronavirus-2 (SARS-CoV-2).

SARS-CoV-2 è l'agente causale della pandemia in corso COVID-19 che ha reclamato più di 4,8 milione vite universalmente. Interessante, gli studi precedenti hanno indicato che sia umorale (anticorpo-mediato) che l'immunità cellulare è essenziale all'infezione completamente chiara SARS-CoV-2.

Linfocita B che vuota le terapie ed infezione SARS-CoV-2

I pazienti di Immunocompromised sottoposti al linfocita B che vuota le terapie sono stati trovati per avvertire l'infezione prolungata SARS-CoV-2 e lo spargimento virale. Sebbene lo spargimento virale potrebbe accadere per i mesi dopo l'inizio dei sintomi, i virus possibili non sono stati individuati dopo nove sintomi di post-malattia dei giorni. La replicazione virale persistente può causare i difetti profondi del linfocita a causa della b e la cellula T che vuota le terapie o la malattia ematologica di fondo. Un aspetto importante della persistenza virale nelle impostazioni immunosuppressed è lo sviluppo delle varianti, particolarmente durante la terapia convalescente del plasma.

Parecchi studi recentemente pubblicati hanno rivelato che SARS-CoV-2 in host immunocompromised tende a causare le mutazioni di eliminazione nella proteina della punta, particolarmente nel dominio S1. Generalmente, la regione S1 della proteina della punta di SARS-CoV-2 è responsabile dell'instaurazione dell'interazione del host-virus per promuovere l'invasione virale alla cellula ospite. In sia host infettati immunocompetent che immunosuppressed, le eliminazioni possono accadere attraverso il genoma virale che può alterare il meccanismo dell'interazione del virus-host. I ricercatori hanno trovato che le proteine accessorie quali ORF7ab e ORF8, che sono associati con stimolo iniziale di produzione di IFN-γ, sono state cancellate in tantissime persone immunocompetent.

Un nuovo studio

Un nuovo studio ha pubblicato sul " server " della pubblicazione preliminare del medRxiv* messo a fuoco su un paziente con un'infezione virale sintomatica persistente per più un anno. I ricercatori hanno ampliato le trascrizioni sotto-genomiche per il gene di E (sgE) facendo uso dei campioni rinofaringei del paziente infettato con SARS-CoV-2 nel corso dei 335 giorni. Questo paziente egualmente ha avuto una cronologia della terapia della cellula T dell'AUTOMOBILE. Il SARS-CoV-2 prova era stato effettuato facendo uso dei tamponi rinofaringei del paziente e, interessante, sono rimanere con insistenza positivo COVID-19. Completi l'ordinamento genomica è stato condotto sui campioni rinofaringei dal paziente.

Cronologia dei test diagnostici per SARS-CoV-2 ed il trattamento. (Gli esemplari rinofaringei o orofaringei respiratorio superiore) sono stati raccolti per rilevazione di RNA SARS-CoV-2, a meno che una volta indicato da quanto segue: # indica il campione di BAL, * indica i giorni in cui gli esemplari dell
Cronologia dei test diagnostici per SARS-CoV-2 ed il trattamento. (Gli esemplari rinofaringei o orofaringei respiratorio superiore) sono stati raccolti per rilevazione di RNA SARS-CoV-2, a meno che una volta indicato da quanto segue: # indica il campione di BAL, * indica i giorni in cui gli esemplari dell'espettorato sono stati raccolti e il † indica i giorni in cui la saliva è stata raccolta. Gli esemplari con i valori di Ct oltre 40 sono stati considerati negativi per RNA SARS-CoV-2. La PCR per RNA sotto-genomica è stata eseguita soltanto sugli esemplari che hanno verificato il positivo a RNA genomica. I campioni che sono stati usati per l'ordinamento di prossima generazione sono indicati con un cerchio arancio. I trattamenti amministrati sono indicati con una freccia nera e sono contrassegnati.

I risultati principali

L'analisi dei dati d'ordinamento ha rivelato la persistenza dell'infezione COVID-19 su un periodo dei 335 giorni. Gli autori hanno specificato quello fin qui, questo è forse l'infezione riferita prolungata con SARS-CoV-2. Questo studio ha indicato una traiettoria evolutiva del virus basato sulla tariffa di mutazione della polimerasi. I ricercatori hanno trovato che il paziente ha esibito i sintomi SARS-CoV-2 per l'intero periodo di infezione.

Gli studi della corrente hanno indicato che il virus ha accumulato un'eliminazione unica del in-fotogramma nel dominio del amminico-terminale (NTD) della proteina della punta, durante il periodo di anno. Un simile genere di eliminazione era stato osservato nella variante di lambda (B.1.351), che ha contenuto l'eliminazione di NTD e una mutazione di R246I. La ragione per la quale l'eliminazione in quella regione del NTD si presenta in un paziente immunocompromised non è ancora evidente. Tuttavia, questo rapporto è in conformità con gli studi precedenti che mostrano che l'infezione cronica SARS-CoV-2 si presenta in host severamente immunocompromised che hanno subito il trattamento convalescente del plasma. Inoltre, questa circostanza piombo all'emergenza delle varianti SARS-CoV-2 ed all'efficacia diminuita degli anticorpi di neutralizzazione. Il paziente immunocompromised considerato in questo studio egualmente è stato sottoposto ad un trattamento convalescente del plasma durante il suo primo ricovero ospedaliero.

Questo studio egualmente ha riferito l'eliminazione 497nt nei geni ORF7b e ORF8 ed è l'eliminazione più lunga riferita in questa regione del genoma. Tale eliminazione è stata osservata per la prima volta in un paziente immunocompromised. Uno studio precedente aveva riferito le eliminazioni ORF7b/ORF8 in questa portata di regione da 62nt a 382nt. Questa mutazione in primo luogo è stata identificata a Singapore a gennaio di 2020.

Gli studi priori hanno indicato che i mutanti di eliminazione possono essere meno efficaci nell'instaurazione dell'infezione in un nuovo host a causa della perdita di funzionalità immuni dell'evasione di ORF8. Gli studi più iniziali egualmente hanno indicato che ORF8 è un antagonista chiave di immunità innata. Di conseguenza l'eliminazione di questo gene suscita una risposta immunitaria robusta ed altamente specifica durante l'infezione. Interessante, una grande eliminazione è stata trovata nel paziente immunocompromised, che potrebbe accadere perché la natura immunocompromised di questo paziente ha eliminato un'esigenza di ORF8 durante l'infezione.

Gli autori hanno riferito che quando il paziente è stato curato con il plasma convalescente di alto-titolo e del remdesivir, dopo l'aspetto delle mutazioni di eliminazione nel genoma virale, distanza dell'infezione sono stati osservati.

Conclusioni

Questo studio suggerisce che i pazienti severamente immunocompromised possano avvertire l'infezione prolungata SARS-CoV-2 con i sintomi irrilevanti e la replica persistente del virus. Gli autori hanno sottolineato l'importanza di analizzare le mutazioni virali in questo gruppo di pazienti poichè c'è un'alta possibilità dell'emergenza delle varianti. Gli scienziati hanno indicato che la più ricerca è richiesta di determinare l'evoluzione di SARS-CoV-2 in host immunocompromised, in particolare, per quanto riguarda transmissibility e virulenza.

Avviso *Important

il medRxiv pubblica i rapporti scientifici preliminari che pari-non sono esaminati e, pertanto, non dovrebbero essere considerati conclusivi, guida la pratica clinica/comportamento correlato con la salute, o trattato come informazioni stabilite.

Journal reference:
Dr. Priyom Bose

Written by

Dr. Priyom Bose

Priyom holds a Ph.D. in Plant Biology and Biotechnology from the University of Madras, India. She is an active researcher and an experienced science writer. Priyom has also co-authored several original research articles that have been published in reputed peer-reviewed journals. She is also an avid reader and an amateur photographer.

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