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Evolução SARS-CoV-2 promovida pelo paciente a longo prazo da infecção dentro - com prostração da pilha de B

Os cientistas desenvolveram diversas vacinas da doença 2019 do coronavirus (COVID-19), que receberam a autorização do uso da aprovação ou da emergência (EUA) dos corpos reguladores globais controlar a infecção da Síndrome Respiratória Aguda Grave coronavirus-2 (SARS-CoV-2).

SARS-CoV-2 é o agente causal da pandemia COVID-19 em curso que reivindicou mais de 4,8 milhão vidas no mundo inteiro. Interessante, os estudos precedentes indicaram que humoral (anticorpo-negociado) e a imunidade comunicada pelas células é essencial à infecção SARS-CoV-2 completamente clara.

Pilha de B que esgota terapias e infecção SARS-CoV-2

Os pacientes de Immunocompromised sujeitados à B-pilha que esgota terapias foram encontrados para experimentar a infecção SARS-CoV-2 prolongada e o derramamento viral. Embora o derramamento viral poderia ocorrer por meses após o início dos sintomas, os vírus viáveis não foram detectados após nove sintomas da cargo-doença dos dias. A réplica viral persistente pode causar defeitos profundos do linfócito devido ao b e t-cell que esgota terapias ou doença hematológica subjacente. Um aspecto importante da persistência viral em ajustes immunosuppressed é a revelação das variações, especialmente durante a terapia convalescente do plasma.

Diversos estudos recentemente publicados revelaram que SARS-CoV-2 em anfitriões immunocompromised tende a causar mutações do supressão na proteína do ponto, especialmente no domínio S1. Geralmente, a região S1 da proteína do ponto de SARS-CoV-2 é responsável para estabelecer a interacção do anfitrião-vírus para promover a invasão viral à pilha de anfitrião. Em anfitriões contaminados imuno-competentes e immunosuppressed, os supressões podem ocorrer através do genoma viral que pode alterar o mecanismo da interacção do vírus-anfitrião. Os pesquisadores encontraram que as proteínas acessórias tais como ORF7ab e ORF8, que são associados com a estimulação adiantada da produção de IFN-γ, estiveram suprimidas em um grande número indivíduos imuno-competentes.

Um estudo novo

Um estudo novo publicou no server da pré-impressão do medRxiv* focalizado em um paciente com uma infecção viral sintomático persistente por sobre um ano. Os pesquisadores amplificaram transcritos secundário-genomic para o gene de E (sgE) que usa amostras nasopharyngeal do paciente contaminado com o SARS-CoV-2 no curso de 335 dias. Este paciente igualmente teve uma história da terapia do t-cell do CARRO. O SARS-CoV-2 testa tinha sido realizado usando os cotonetes nasopharyngeal do paciente, e, interessante, permaneceram o positivo COVID-19 persistente. Termine arranjar em seqüência genomic foi conduzido em amostras nasopharyngeal do paciente.

O espaço temporal de testes de diagnóstico para SARS-CoV-2 e tratamento. (Os espécimes Nasopharyngeal ou orofaríngeos respiratório superior) foram recolhidos para a detecção do RNA SARS-CoV-2, a não ser que quando indicado pelo seguinte: # indica a amostra do BAL, * indica os dias em que os espécimes do escarro foram recolhidos e o † indica os dias em que a saliva estêve recolhida. Os espécimes com valores do Ct sobre 40 foram considerados negativos para o RNA SARS-CoV-2. O PCR para o RNA secundário-genomic foi executado somente nos espécimes que testaram o positivo para o RNA genomic. As amostras que foram usadas para arranjar em seqüência da próxima geração são indicadas com um círculo alaranjado. Os tratamentos administrados são indicados com uma seta preta e etiquetados.
O espaço temporal de testes de diagnóstico para SARS-CoV-2 e tratamento. (Os espécimes Nasopharyngeal ou orofaríngeos respiratório superior) foram recolhidos para a detecção do RNA SARS-CoV-2, a não ser que quando indicado pelo seguinte: # indica a amostra do BAL, * indica os dias em que os espécimes do escarro foram recolhidos e o † indica os dias em que a saliva estêve recolhida. Os espécimes com valores do Ct sobre 40 foram considerados negativos para o RNA SARS-CoV-2. O PCR para o RNA secundário-genomic foi executado somente nos espécimes que testaram o positivo para o RNA genomic. As amostras que foram usadas para arranjar em seqüência da próxima geração são indicadas com um círculo alaranjado. Os tratamentos administrados são indicados com uma seta preta e etiquetados.

Os resultados principais

A análise dos dados arranjando em seqüência revelou a persistência da infecção COVID-19 durante um período de 335 dias. Os autores indicaram aquele até agora, isto são talvez a infecção relatada a mais prolongada com SARS-CoV-2. Este estudo indicou uma trajectória evolucionária do vírus baseado na taxa da mutação da polimerase. Os pesquisadores encontraram que o paciente exibiu os sintomas SARS-CoV-2 para o período inteiro de infecção.

Os estudos da corrente mostraram que o vírus acumulou um supressão original do em-quadro no domínio do amino-terminal (NTD) da proteína do ponto, durante o período de um ano. Um tipo similar do supressão tinha sido observado na variação do Lambda (B.1.351), que conteve o supressão de NTD e uma mutação de R246I. A razão pela qual o supressão nessa região do NTD ocorre em um paciente immunocompromised não é ainda aparente. Contudo, este relatório é na linha dos estudos precedentes que mostram que a infecção SARS-CoV-2 crônica ocorre nos anfitriões severamente immunocompromised que se submeteram ao tratamento convalescente do plasma. Também, esta circunstância conduz à emergência das variações SARS-CoV-2 e à eficácia reduzida de anticorpos de neutralização. O paciente immunocompromised considerado neste estudo foi sujeitado igualmente a um tratamento convalescente do plasma durante sua primeira admissão de hospital.

Este estudo igualmente relatou o supressão 497nt nos genes ORF7b e ORF8, e é o supressão o mais longo relatado nesta região do genoma. Tal supressão tem sido observado pela primeira vez em um paciente immunocompromised. Um estudo precedente tinha relatado os supressões ORF7b/ORF8 neste período da região de 62nt a 382nt. Esta mutação foi identificada primeiramente em Singapura em janeiro de 2020.

Os estudos prévios indicaram que os mutantes do supressão podem ser menos eficazes em estabelecer a infecção em um anfitrião novo devido à perda de características imunes da evasão de ORF8. Uns estudos mais adiantados igualmente mostraram que ORF8 é um antagonista chave da imunidade inata. Conseqüentemente o supressão deste gene induz uma resposta imune robusta e altamente específica durante a infecção. Interessante, um grande supressão foi encontrado no paciente immunocompromised, que pôde ter ocorrido porque a natureza immunocompromised deste paciente eliminou uma necessidade para ORF8 durante a infecção.

Os autores relataram que quando o paciente foi tratado com o plasma convalescente do remdesivir e do alto-titer, após a aparência de mutações do supressão no genoma viral, afastamento da infecção foram observados.

Conclusões

Este estudo sugere que os pacientes severamente immunocompromised possam experimentar a infecção SARS-CoV-2 prolongada com sintomas insignificantes e réplica persistente do vírus. Os autores sublinharam a importância de analisar mutações virais neste grupo de pacientes porque há uma possibilidade alta da emergência das variações. Os cientistas indicaram que mais pesquisa está exigida determinar a evolução de SARS-CoV-2 em anfitriões immunocompromised, especialmente, a propósito do transmissibility e da virulência.

Observação *Important

o medRxiv publica os relatórios científicos preliminares que par-não são revistos e, não devem conseqüentemente ser considerados como conclusivos, guia a prática clínica/comportamento saúde-relacionado, ou tratado como a informação estabelecida.

Journal reference:
Dr. Priyom Bose

Written by

Dr. Priyom Bose

Priyom holds a Ph.D. in Plant Biology and Biotechnology from the University of Madras, India. She is an active researcher and an experienced science writer. Priyom has also co-authored several original research articles that have been published in reputed peer-reviewed journals. She is also an avid reader and an amateur photographer.

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