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Analyse de transmissibility variable de la triangle SARS-CoV-2 en travers de la Nouvelle Angleterre, Etats-Unis

La variante de triangle du coronavirus 2 de syndrôme respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2) de la préoccupation est devenue mondial dominante sous peu suivant son émergence en Inde début 2021, dû à un transmissibility plus grand comparé à d'autres variantes.

Les états nombreux ont expliqué le transmissibility amélioré de la variante de triangle de l'aspect des deux études épidémiologiques, avec le contrôle génomique indiquant l'écart de la triangle par des communautés, ainsi que par des méthodes analytiques in vitro, où la protéine de pointe de cette variante porte l'affinité améliorée vers le récepteur humain de l'enzyme de conversion de l'angiotensine 2 (ACE2).

Étude : Transmissibility comparatif de triangle et d'alpha des variantes SARS-CoV-2 en Nouvelle Angleterre, Etats-Unis. Crédit d'image : Studio de RUKSUTAKARN/Shutterstock.com

Cependant, le transmissibility varie entre les populations basées sur la démographie innée et les taux d'adoption vacciniques. À cet effet, une étude récente publiée sur le medRxiv* de serveur de prétirage compare le transmissibility des variantes de l'alpha SARS-CoV-2 et de la triangle dans six conditions en travers de la Nouvelle Angleterre aux Etats-Unis, trouvant la variation de la dynamique épidémiologique basée sur le comportement de communauté.

Au sujet de l'étude

Dans l'étude actuelle, les chercheurs partnered avec des programmes génomiques de contrôle de communauté le Connecticut, Maine, le Massachusetts, New Hampshire, Île de Rhode, et au Vermont. Ces programmes ont fourni des caractéristiques qualitatives de l'amplification en chaîne par polymérase de transcriptase inverse (Droite-qPCR) rassemblées au cours de la pandémie, avec le régime des cas neufs découverts de chaque variante dans chaque emplacement.

Chaque condition a été notée pour remarquer un changement assimilé de la fréquence variable au fil du temps, avec l'alpha variante devenant dominante en avril 2021 et rapidement remonté par la variante de triangle en juin 2021. Tandis qu'un certain nombre d'autres variantes SARS-CoV-2 moins importantes constituaient une grande partie d'infections SARS-CoV-2 totales pendant le temps que l'alpha variante était dominante, la variante de triangle a représenté entre 94-100% de tous les cas par la semaine finale de 2021 et était devenue plus largement dominante géographiquement.

Transmissibility de variante de triangle

Pour comparer le transmissibility des variantes d'alpha et de triangle, le groupe a rétréci le temps à l'inspection à dans les 90 jours suivant la première émergence de chaque variante. Intéressant, l'alpha variante d'abord semble dépasser la variante de triangle pendant les stades précoces de la manifestation, bien que les auteurs proposent que manquer des caractéristiques de contrôle à ce moment ait entraîné une surestimation dans le transmissibility.

Au total, on a estimé à que la variante de triangle 163% plus transmissible que l'alpha variante au Vermont, 151% dans le Connecticut, 98% dans Île de Rhode, 95% dans Maine, 75% dans New Hampshire, et 37% dans le Massachusetts. Le R-U a rapporté un transmissibility 40-80% amélioré environ pour la variante de triangle basée sur des caractéristiques épidémiologiques, et les différences dans la densité de population, la prise vaccinique, les interventions non-pharmaceutiques, et la présence des variantes de concurrence pilotent la variation observée.   

En moyenne, la variante de triangle est devenue dominante dans chaque emplacement dans les 71 jours, représentant une gamme de 54-92 jours en travers de la Nouvelle Angleterre. Aucune association entre la vitesse d'émergence et les infections relatives par habitant n'a été notée.

Vu la similitude génétique de la variante de triangle en travers de la Nouvelle Angleterre, la différence observée dans le transmissibility est vraisemblablement due aux différences basées sur la population. Une association entre la vitesse variable de régimes de vaccination et d'émergence de triangle a été trouvée, avec la variante prenant plus longtemps pour devenir dominante où l'adoption vaccinique était élevée.

Le calage des manifestations variables d'alpha et de triangle a pu avoir influencé le régime observé de la dominance de variante de triangle. C'est parce que, au moment de l'alpha manifestation variable, rien la population était pourtant vacciné, tandis qu'entre 18-37% de la population était vacciné avant avril.

À mesure que les régimes de vaccination augmentaient en travers de la Nouvelle Angleterre, les mesures non-pharmaceutiques telles que des lockdowns et des restrictions de course étaient décontractées avant l'arrivée de la variante de triangle. Ainsi, ces facteurs ont pu avoir potentiellement entraîné l'apparence d'un transmissibility plus élevé.

Charges virales améliorées

Les caractéristiques Droite-qPCR avec l'origine SARS-CoV-2 variable connue étaient comparées. Comme précédemment rapporté précédemment, la variante de triangle a été associée à une charge virale plus élevée que l'alpha ou d'autres variantes.

Ceci a jugé vrai, même lorsque représentant la possibilité de baisser la charge virale dans les échantillons s'est rassemblé des personnes sans infections récentes et en travers de différentes méthodes d'essai. Ainsi, la grande charge virale de la variante de triangle peut être la raison principale pour son transmissibility amélioré.

Conclusion

Tandis que le mécanisme complet derrière la différence observée dans le transmissibility variable de triangle entre l'emplacement a pour être élucidé encore, cette étude a expliqué que les facteurs tels que la mise en place et l'adhérence aux mesures non-pharmaceutiques et la prise vaccinique influencent fortement la dynamique des infections SARS-CoV-2 et des manifestations.

Les auteurs proposent que, vu la dominance globale de la variante de triangle, la prochaine tension mondial dominante pour la remonter soit susceptible d'apparaître du clade B.1.617.2, auquel la variante de triangle il appartient. Cependant, il ne peut pas prévoir quand ou où cette variante apparaîtra, de ce fait mettant en valeur l'importance du contrôle génomique prolongé.

avis *Important

le medRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
Michael Greenwood

Written by

Michael Greenwood

Michael graduated from Manchester Metropolitan University with a B.Sc. in Chemistry in 2014, where he majored in organic, inorganic, physical and analytical chemistry. He is currently completing a Ph.D. on the design and production of gold nanoparticles able to act as multimodal anticancer agents, being both drug delivery platforms and radiation dose enhancers.

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