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Analisi di transmissibility variabile di delta SARS-CoV-2 attraverso la Nuova Inghilterra, U.S.A.

La variante di delta di coronavirus 2 di sindrome respiratorio acuto severo (SARS-CoV-2) di preoccupazione è diventato globalmente dominante presto seguendo la sua emergenza in India all'inizio del 2021, a causa di maggior transmissibility confrontato ad altre varianti.

I numerosi rapporti hanno dimostrato il transmissibility migliorato della variante di delta dall'aspetto di entrambi gli studi epidemiologici, con sorveglianza genomica che rivela la diffusione del delta attraverso le comunità come pure con i metodi analitici in vitro, dove la proteina della punta di questa variante sopporta l'affinità migliorata verso il ricevitore umano dell'enzima di conversione dell'angiotensina 2 (ACE2).

Studio: Transmissibility comparativo del delta e dell'alfa di varianti SARS-CoV-2 in Nuova Inghilterra, U.S.A. Credito di immagine: Studio/Shutterstock.com di RUKSUTAKARN

Tuttavia, il transmissibility varia fra le popolazioni basate su dati demografici innati e le tariffe di approvazione del vaccino. A questo scopo, uno studio recente pubblicato sul medRxiv* del " server " della pubblicazione preliminare confronta il transmissibility delle varianti dell'alfa SARS-CoV-2 e di delta in sei stati attraverso la Nuova Inghilterra negli Stati Uniti, trovante la variazione nella dinamica epidemiologica basata su comportamento della comunità.

Circa lo studio

Nello studio corrente, i ricercatori partnered con i programmi di sorveglianza di genomica della comunità Connecticut, Maine, Massachusetts, New Hampshire, nel Rhode Island e nel Vermont. Questi programmi hanno fornito i dati qualitativi inversi-transcriptase di reazione a catena della polimerasi (RT-qPCR) raccolti nel corso della pandemia, con la tariffa dei nuovi casi scoperti di ogni variante in ogni posizione.

Ogni stato è stato notato per avvertire col passare del tempo un simile cambiamento nella frequenza variabile, con l'alfa variante che diventa nell'aprile 2021 dominante e sostituito rapido dalla variante di delta nel giugno 2021. Mentre una serie di altre varianti secondarie SARS-CoV-2 hanno costituito una grande parte di infezioni totali SARS-CoV-2 durante il tempo che l'alfa variante era dominante, la variante di delta ha rappresentato fra 94-100% di tutti i casi entro la settimana definitiva di 2021 ed era diventato più ampiamente dominante geograficamente.

Transmissibility di variante di delta

Per confrontare il transmissibility delle varianti di delta e dell'alfa, il gruppo ha limitato il tempo in esame nei 90 giorni che seguono la prima emergenza di ogni variante. Interessante, l'alfa variante inizialmente sembra superare la variante di delta durante le fasi iniziali di scoppio, sebbene gli autori suggeriscano che mancare dei dati di sorveglianza attualmente abbia causato una sopravvalutazione nel transmissibility.

Nel totale, la variante di delta è stata valutata 163% più ereditario di alfa variante nel Vermont, 151% in Connecticut, 98% nel Rhode Island, 95% in Maine, 75% in New Hampshire e 37% in Massachusetts. Il Regno Unito ha riferito un transmissibility migliorato 40-80% stimato per la variante di delta basata sui dati epidemiologici e le differenze nella densità demografica, nella comprensione vaccino, negli interventi non farmaceutici e nella presenza di varianti in competizione determinano la variazione osservata.   

In media, la variante di delta è diventato dominante in ogni posizione nel 71 giorno, rappresentante un intervallo dei 54-92 giorni attraverso la Nuova Inghilterra. Nessun'associazione fra la velocità di emergenza e le infezioni relative per capita è stata notata.

Dato la similarità genetica della variante di delta attraverso la Nuova Inghilterra, la differenza osservata nel transmissibility è probabilmente dovuto le differenze basate sulla popolazione. Un'associazione fra la velocità variabile di tariffe della vaccinazione e di emergenza di delta è stata trovata, con la variante che cattura più lungamente per diventare dominante dove l'approvazione vaccino era alta.

La sincronizzazione degli scoppi variabili di delta e dell'alfa può influenzare la tariffa osservata di dominanza di variante di delta. Ciò è perché, ai tempi di alfa scoppio variabile, nessuno della popolazione ancora è stata vaccinata, mentre fra 18-37% della popolazione è stato vaccinato da ora ad aprile.

Poichè le tariffe della vaccinazione sono aumentato attraverso la Nuova Inghilterra, le misure non farmaceutiche quali i lockdowns e le restrizioni di viaggio erano rilassate prima dell'arrivo della variante di delta. Quindi, questi fattori possono potenzialmente causare l'aspetto di più alto transmissibility.

Caricamenti virali migliorati

I dati RT-qPCR con l'origine variabile conosciuta SARS-CoV-2 sono stati confrontati. Come precedentemente riferito precedentemente, la variante di delta è stata associata con un più alto caricamento virale che l'alfa o altre varianti.

Ciò ha sostenuto, anche quando rappresentando la possibilità di diminuzione del caricamento virale in campioni si è raccolto dalle persone senza infezioni recenti ed attraverso i metodi di collaudo differenti. Quindi, il grande caricamento virale della variante di delta può essere il motivo principale per il suo transmissibility migliorato.

Conclusione

Mentre il meccanismo completo dietro la differenza osservata nel transmissibility variabile di delta fra le posizioni ha ancora essere delucidato, questo studio ha dimostrato che i fattori quali l'entrata in vigore e l'aderenza alle misure non farmaceutiche e l'assorbimento vaccino influenzano forte la dinamica delle infezioni SARS-CoV-2 e degli scoppi.

Gli autori suggeriscono che, dato la dominanza globale della variante di delta, lo sforzo globalmente dominante seguente per sostituirlo sia probabile emergere dal clade B.1.617.2, a cui la variante di delta appartiene. Tuttavia, non può essere preveduto quando o dove questa variante emergerà, così evidenziando l'importanza di sorveglianza genomica continuata.

avviso *Important

il medRxiv pubblica i rapporti scientifici preliminari che pari-non sono esaminati e, pertanto, non dovrebbero essere considerati conclusivi, guida la pratica clinica/comportamento correlato con la salute, o trattato come informazioni stabilite.

Journal reference:
Michael Greenwood

Written by

Michael Greenwood

Michael graduated from Manchester Metropolitan University with a B.Sc. in Chemistry in 2014, where he majored in organic, inorganic, physical and analytical chemistry. He is currently completing a Ph.D. on the design and production of gold nanoparticles able to act as multimodal anticancer agents, being both drug delivery platforms and radiation dose enhancers.

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