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Análise do transmissibility variante do delta SARS-CoV-2 através de Nova Inglaterra, EUA

A variação do delta do coronavirus 2 da Síndrome Respiratória Aguda Grave (SARS-CoV-2) do interesse tornou-se global dominante logo seguindo sua emergência na Índia ao princípio de 2021, devido ao maior transmissibility comparado a outras variações.

Os relatórios numerosos demonstraram o transmissibility aumentado da variação do delta do aspecto de ambos os estudos epidemiológicos, com a fiscalização genomic que revela a propagação do delta através das comunidades, assim como in vitro pelos métodos analíticos, onde a proteína do ponto desta variação carrega a afinidade aumentada para o receptor deconversão humano da enzima 2 (ACE2).

Estudo: Transmissibility comparativo do delta e do alfa das variações SARS-CoV-2 em Nova Inglaterra, EUA. Crédito de imagem: Estúdio de RUKSUTAKARN/Shutterstock.com

Contudo, o transmissibility varia entre as populações baseadas na demografia inata e as taxas da adopção da vacina. Com tal fim, um estudo recente publicado no medRxiv* do server da pré-impressão compara o transmissibility das variações do alfa SARS-CoV-2 e do delta em seis estados através de Nova Inglaterra nos Estados Unidos, encontrando a variação na dinâmica epidemiológica baseada no comportamento da comunidade.

Sobre o estudo

No estudo actual, os pesquisadores partnered com programas da fiscalização da genómica da comunidade em Connecticut, em Maine, em Massachusetts, em New Hampshire, em Rhode - ilha, e em Vermont. Estes programas forneceram os dados qualitativos reversos-transcriptase da reacção em cadeia da polimerase (RT-qPCR) recolhidos no curso da pandemia, junto com a taxa de novos casos descobertos de cada variação em cada lugar.

Cada estado foi notado para experimentar ao longo do tempo uma mudança similar na freqüência variante, com a variação alfa que torna-se dominante em abril de 2021 e substituído ràpida pela variação do delta em junho de 2021. Quando um número outras de variações SARS-CoV-2 menores constituíram uma grande parcela das infecções SARS-CoV-2 totais durante o tempo que a variação alfa era dominante, a variação do delta representou entre 94-100% de todos os casos na semana final de 2021 e tinha-se tornado mais extensamente dominante geogràfica.

Transmissibility da variação do delta

Para comparar o transmissibility das variações do alfa e do delta, o grupo reduziu o tempo sob o exame no prazo de 90 dias que seguem a primeira emergência de cada variação. Interessante, a variação alfa no início parece tomar a dianteira à variação do delta durante as fases iniciais de manifestação, embora os autores sugerem que faltar dados da fiscalização neste tempo cause uma sobrestimação no transmissibility.

No total, a variação do delta foi calculada para ser 163% mais transmissível do que a variação alfa em Vermont, 151% em Connecticut, 98% em Rhode - ilha, 95% em Maine, 75% em New Hampshire, e 37% em Massachusetts. O Reino Unido relatou um transmissibility aumentado 40-80% calculado para a variação do delta baseada em dados epidemiológicos, e as diferenças na densidade populacional, na tomada vacinal, em intervenções não-farmacêuticas, e na presença de variações de competência conduzem a variação observada.   

Em média, a variação do delta tornou-se dominante em cada lugar no prazo de 71 dias, representando uma escala de 54-92 dias através de Nova Inglaterra. Nenhuma associação entre a velocidade da emergência e infecções relativas foi notada per capita.

Dado a similaridade genética da variação do delta através de Nova Inglaterra, a diferença observada no transmissibility é provavelmente devido às diferenças população-baseadas. Uma associação entre a velocidade variante das taxas da vacinação e da emergência do delta foi encontrada, com a variação que toma mais por muito tempo para tornar-se dominante onde a adopção vacinal era alta.

O sincronismo das manifestações variantes do alfa e do delta pode ter influenciado a taxa observada de domínio da variação do delta. Isto é porque, na altura da manifestação variante alfa, nenhuma da população foi vacinada ainda, quando entre 18-37% da população foi vacinado daqui até abril.

Porque as taxas da vacinação aumentaram através de Nova Inglaterra, as medidas não-farmacêuticas tais como lockdowns e limitações de curso eram relaxado antes da chegada da variação do delta. Assim, estes factores podem potencial ter causado a aparência de um transmissibility mais alto.

Cargas virais aumentadas

Os dados RT-qPCR com origem SARS-CoV-2 variante conhecida foram comparados. Como relatado previamente previamente, a variação do delta foi associada com uma carga viral mais alta do que o alfa ou outras variações.

Isto guardarou verdadeiro, mesmo quando esclarecendo a possibilidade de diminuir a carga viral nas amostras recolheu dos indivíduos sem infecções recentes e através dos métodos de teste diferentes. Assim, a grande carga viral da variação do delta pode ser a razão principal para seu transmissibility aumentado.

Conclusão

Quando o mecanismo completo atrás da diferença observada no transmissibility variante do delta entre lugar tiver ser explicado ainda, este estudo demonstrou que os factores tais como a aplicação e a aderência às medidas não-farmacêuticas e a tomada vacinal influenciam fortemente a dinâmica das infecções SARS-CoV-2 e das manifestações.

Os autores sugerem que, dado o domínio global da variação do delta, a tensão global dominante seguinte para a substituir seja provável emergir do clade B.1.617.2, a que a variação do delta ele pertence. Contudo, não se pode prever quando ou onde esta variação emergirá, assim destacando a importância da fiscalização genomic continuada.

observação *Important

o medRxiv publica os relatórios científicos preliminares que par-não são revistos e, não devem conseqüentemente ser considerados como conclusivos, guia a prática clínica/comportamento saúde-relacionado, ou tratado como a informação estabelecida.

Journal reference:
Michael Greenwood

Written by

Michael Greenwood

Michael graduated from Manchester Metropolitan University with a B.Sc. in Chemistry in 2014, where he majored in organic, inorganic, physical and analytical chemistry. He is currently completing a Ph.D. on the design and production of gold nanoparticles able to act as multimodal anticancer agents, being both drug delivery platforms and radiation dose enhancers.

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