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Instabilité dans le microbiota d'intestin lié aux complications de COVID-19-related et à la mortalité, découvertes d'étude

La pandémie COVID-19 provoquée par le coronavirus nouveau 2 (SARS-CoV-2) de syndrôme respiratoire aigu sévère a exposé les limitations des systèmes de santé publics globaux. La maladie COVID-19 est caractérisée par la maladie respiratoire, et là augmente la preuve pour la participation (GI) de tractus gastro-intestinal. La nausée, la diarrhée, et en vomissant soyez également relativement courant, et un pourcentage des patients ont des sympt40mes de GI seulement.

Les études ont prouvé que la participation SARS-CoV-2 n'est pas limitée aux poumons, peut reproduire dans les entérocytes humains, et est détectable dans les échantillons fécaux des patients. Bien que des sympt40mes de GI dans les patients COVID-19 se soient avérés pour être associés à la plus grande gravité de la maladie et des complications, les causes sous-jacentes sont mal comprises. Quelques études proposent qu'une composition microbienne modifiée dans l'intestin marque avec la gravité COVID-19 et la réaction inflammatoire.

Analyser la salive et les échantillons fécaux des patients COVID-19 et des contrôles

Bien qu'il y ait une discussion croissante au sujet de participation de microbiome d'intestin dans COVID-19, il est peu clair si le microbiome influence COVID-19 ou vice versa. Il est compliqué car une analyse des caractéristiques d'amplicon dans les patients COVID-19 hospitalisés exige une cohorte et une intégration sophistiquées des paramètres cliniques.

Les chercheurs d'Allemagne ont récent analysé la salive et les échantillons fécaux provenant des patients SARS-CoV-2 infecté et post-COVID-19 et des contrôles tandis que vu le multiple influençant des facteurs pendant l'hospitalisation. Cette étude est procurable sur le serveur de prétirage de bioRxiv*.

Ils ont exécuté le gène de 16S ARNr ordonnançant sur le fécal et la salive échantillonne pris de 108 patients COVID-19 et de 22 patients post-COVID-19, ainsi que de 20 contrôles présentant la pneumonie et 26 contrôles asymptomatiques. Ces patients ont été recrutés pendant les ondes de la pandémie de l'Allemagne première et deuxième, et des paramètres cliniques détaillés ont été considérés pendant le recrutement. Des échantillons séquentiels ont été rassemblés selon la personne, qui a permis l'analyse intraindividuelle.

La composition microbienne de l
La composition microbienne de l'intestin a observé dans la cohorte une synthèse de modèle d'étude. Des échantillons de selles et de salive sont indiqués. Alpha-diversité de B de tous les groupes de tous les patients. L'histogramme gauche montre la richesse et le bon histogramme Shannon nombre efficace de substance. Arbre phylogénétique de C prévu par des distances généralisées d'Unifrac pour tous les groupes de tous les patients. Les barplots empilés montrent la distribution taxonomique sur des phylums à niveau. La marque intérieure montre que l'état SARS-CoV-2 et la marque extérieure indique la phase de temps d'échantillonnage. D est parti, alpha-diversité stratifiée selon l'état SARS-CoV-2 pour tous les groupes de tous les patients, montrant à Shannon des nombres efficaces et la richesse. Redressez, des plots de barre montrent des modificateurs d'effet contribuant de manière significative à la diversité microbienne dans tous les échantillons. L'axe des y montre la valeur R2 prévue basée sur la distance de Braillement-Curtis pour COVID-19, goujon COVID-19 et Sc

Les complications COVID-19 et la gravité marquent avec l'intestin et le microbiota oral

Les résultats ont prouvé que l'intestin et le microbiota oral ont été modifiés ont basé sur le numéro et le type des complications et de gravité de la maladie de COVID-19-related. Le cas de différentes complications a marqué avec la présence des bactéries à faible risque telles que des bactéries de prausznitzii et de haut risque de Faecalibacterium telles que Parabacteroides dans l'intestin. L'analyse a expliqué qu'une composition bactérienne d'intestin stable a marqué avec une progression de la maladie favorable et a recensé un modèle basé sur des profils microbiens d'intestin pour estimer la mortalité COVID-19.

« Nous présumons que les changements de la composition microbienne, particulièrement de l'intestin, peuvent piloter la maladie, probablement par l'intermédiaire d'une participation dans le développement des complications. »

Des signatures bactériennes d'intestin peuvent être employées dans des approches diagnostiques neuves pour estimer la mortalité COVID-19

De façon générale, les découvertes de l'étude expliquent que des corrélations de microbiota d'intestin avec le cas des complications de COVID-19-related et peuvent influencer la gravité de la maladie. Ainsi, les bactéries connues pour leurs propriétés protectrices et immunodépressrices ont semblé diminuer avec l'augmentation des complications de COVID-19, et les taxa relativement pathogènes sont devenus plus répandus. Le prausnitzii de F., par exemple, n'a pas été trouvé dans les patients présentant des complications et était relativement moins dans les patients avec AKI, l'événement cardiaque, ARDS, et négativement marqué avec la mortalité. Le prausnitzii de F. a été montré pour avoir les propriétés anti-inflammatoires et s'est avéré pour marquer avec la gravité COVID-19 inversement.

D'autre part, le genre Alistipes a relativement augmenté avec le nombre de complications de santé. Il y a de preuve contradictoire au sujet du potentiel pathogène ou protecteur d'Alistipes dans maladies variées.

En conclusion, un microbiome stable d'intestin peut contribuer à une étape progressive COVID-19 favorable, et des signatures bactériennes peuvent être employées pour estimer la mortalité COVID-19, qui pourrait aider des approches diagnostiques neuves. D'une manière primordiale, cette étude met en valeur les défis dans l'analyse des caractéristiques microbiennes pendant l'hospitalisation. Selon les auteurs, plus d'études sont nécessaires pour analyser des relations directes entre COVID-19 et pour étriper le dysbiosis bactérien et pour intégrer les configurations microbiennes pour des usages diagnostiques et thérapeutiques dans le sous-programme clinique.

« Pris ensemble, nos résultats proposent que l'intestin et le microbiota salivaire soient associés au cas de différentes complications dans COVID-19, influençant de ce fait la gravité de la maladie. »

Avis *Important

le bioRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
  • Gut Bacterial Dysbiosis and Instability is Associated with the Onset of Complications and Mortality in COVID-19 David Schult, Sandra Reitmeier, Plamena Koyumdzhieva, Tobias Lahmer, Moritz Middelhoff, Johanna Erber, Jochen Schneider, Juliane Kager, Marina Frolova, Julia Horstmann, Lisa Fricke, Katja Steiger, Moritz Jesinghaus, Klaus-Peter Janssen, Ulrike Protzer, Klaus Neuhaus, Roland M. Schmid, Dirk Haller, Michael Quante, bioRxiv, 2021.10.08.463613; doi: https://doi.org/10.1101/2021.10.08.463613, https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.10.08.463613v1
Susha Cheriyedath

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Susha Cheriyedath

Susha has a Bachelor of Science (B.Sc.) degree in Chemistry and Master of Science (M.Sc) degree in Biochemistry from the University of Calicut, India. She always had a keen interest in medical and health science. As part of her masters degree, she specialized in Biochemistry, with an emphasis on Microbiology, Physiology, Biotechnology, and Nutrition. In her spare time, she loves to cook up a storm in the kitchen with her super-messy baking experiments.

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