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Instabilità in microbiota dell'intestino connesso con le complicazioni di COVID-19-related e la mortalità, ritrovamenti di studio

La pandemia COVID-19 causata dal coronavirus novello 2 (SARS-CoV-2) di sindrome respiratorio acuto severo ha esposto le limitazioni dei sistemi globali di salute pubblica. La malattia COVID-19 è caratterizzata dalla malattia respiratoria e sta aumentando la prova per la partecipazione (GI) del tratto gastrointestinale. La nausea, la diarrea e vomitando sia egualmente relativamente comune ed una percentuale di pazienti hanno sintomi di GI soltanto.

Gli studi hanno indicato che la partecipazione SARS-CoV-2 non è limitata ai polmoni, può ripiegare nei enterocytes umani ed è rilevabile nei campioni fecali dei pazienti. Sebbene i sintomi di GI in pazienti COVID-19 siano stati trovati per essere associati con la severità aumentata della malattia e delle complicazioni, le cause fondamentali sono capite male. Alcuni studi suggeriscono che una composizione microbica alterata nell'intestino correli con la severità COVID-19 e la risposta infiammatoria.

Analizzare saliva ed i campioni fecali dei pazienti COVID-19 e dei comandi

Sebbene ci sia un dibattito crescente circa la partecipazione del microbiome dell'intestino a COVID-19, è poco chiaro se il microbiome urta COVID-19 o vice versa. È complicato come analisi dei dati del amplicon in pazienti ospedalizzati COVID-19 richiede un gruppo e un'integrazione specializzati dei parametri clinici.

I ricercatori dalla Germania recentemente hanno analizzato la saliva ed i campioni fecali dai pazienti SARS-CoV-2 infettati e post-COVID-19 e dai comandi mentre tenendo conto del multiplo che influenza i fattori durante l'ospedalizzazione. Questo studio è disponibile sul " server " della pubblicazione preliminare del bioRxiv*.

Hanno eseguito il gene del rRNA 16S che ordina sul fecale e la saliva campiona catturato da 108 pazienti COVID-19 e da 22 pazienti post-COVID-19 come pure da 20 comandi con polmonite e 26 comandi asintomatici. Questi pazienti sono stati reclutati durante le onde della pandemia della Germania prima e seconda ed i parametri clinici dettagliati sono stati considerati durante l'assunzione. I campioni seriali sono stati raccolti per persona, che ha permesso l'analisi intraindividuale.

La composizione microbica dell
La composizione microbica dell'intestino ha osservato nel gruppo una generalità di progettazione di studio. I campioni della saliva e delle feci sono indicati. Alfa-diversità di B di tutti i campioni di tutti i pazienti. L'istogramma sinistro mostra l'istogramma Shannon Town di destra e di ricchezza efficace numero delle specie. Albero filogenetico di C calcolato dalle distanze generalizzate di Unifrac per tutti i campioni di tutti i pazienti. I barplots impilati mostrano la distribuzione tassonomica sui fili a livello. Il contrassegno interno mostra che stato SARS-CoV-2 ed il contrassegno esterno indica la fase di tempo di campionatura. La D ha andato, alfa-diversità stratificata secondo stato SARS-CoV-2 per tutti i campioni di tutti i pazienti, mostrando a Shannon Town gli efficaci numeri e ricchezza. Radrizzi, modificatori di effetto di manifestazione dei tracciati della barra che contribuiscono significativamente alla diversità microbica in tutti i campioni. L'asse y mostra il valore R2 calcolato in base alla distanza diRaglio-Curtis per COVID-19, il paletto COVID-19 e lo Sc

Le complicazioni COVID-19 e la severità correlano con l'intestino e il microbiota orale

I risultati hanno indicato che l'intestino e il microbiota orale sono stati alterati hanno basato sul numero e sul tipo di complicazioni di COVID-19-related e di severità di malattia. L'avvenimento di diverse complicazioni ha correlato con la presenza di batteri a basso rischio quale il prausznitzii di Faecalibacterium e di batteri ad alto rischio quale Parabacteroides nell'intestino. L'analisi ha dimostrato che una composizione batterica nell'intestino stabile ha correlato con una progressione favorevole di malattia ed ha identificato un modello basato sui profili microbici dell'intestino per stimare la mortalità COVID-19.

“Supponiamo che i cambiamenti nella composizione microbica, particolarmente dell'intestino, possano determinare la malattia, possibilmente via una partecipazione allo sviluppo delle complicazioni.„

Le impronte batteriche dell'intestino possono essere utilizzate nei nuovi approcci diagnostici per stimare la mortalità COVID-19

In generale, i risultati dello studio dimostrano che componenti di microbiota dell'intestino con l'avvenimento delle complicazioni di COVID-19-related e possono influenzare la severità della malattia. Quindi, i batteri conosciuti per i loro beni protettivi ed immunosopressivi sono sembrato diminuire con l'aumento delle complicazioni da COVID-19 ed i tassi relativamente patogeni sono diventato più prevalenti. Il prausnitzii del F., per esempio, non è stato individuato in pazienti con le complicazioni ed era relativamente di meno in pazienti con AKI, l'evento cardiaco, ARDS e correlato negativamente con la mortalità. Il prausnitzii del F. è stato indicato per avere beni antinfiammatori ed è stato trovato per correlare inversamente con la severità COVID-19.

D'altra parte, il genere Alistipes è aumentato relativamente con il numero delle complicazioni di salubrità. C'è prova contraddittoria circa il potenziale patogeno o protettivo di Alistipes in varie malattie.

In conclusione, un microbiome stabile dell'intestino può contribuire ad una progressione favorevole COVID-19 e le impronte batteriche possono essere usate per stimare la mortalità COVID-19, in grado di aiutare i nuovi approcci diagnostici. Più d'importanza, questo studio evidenzia le sfide nell'analisi dei dati microbici durante l'ospedalizzazione. Secondo gli autori, più studi sono necessari analizzare le relazioni dirette fra COVID-19 e sventrare il dysbiosis batterico ed integrare i reticoli microbici per gli usi diagnostici e terapeutici nella routine clinica.

“Catturato insieme, i nostri risultati indicano che l'intestino e il microbiota salivario sono associati con l'avvenimento di diverse complicazioni in COVID-19, quindi influenzante la severità di malattia.„

Avviso *Important

il bioRxiv pubblica i rapporti scientifici preliminari che pari-non sono esaminati e, pertanto, non dovrebbero essere considerati conclusivi, guida la pratica clinica/comportamento correlato con la salute, o trattato come informazioni stabilite.

Journal reference:
  • Gut Bacterial Dysbiosis and Instability is Associated with the Onset of Complications and Mortality in COVID-19 David Schult, Sandra Reitmeier, Plamena Koyumdzhieva, Tobias Lahmer, Moritz Middelhoff, Johanna Erber, Jochen Schneider, Juliane Kager, Marina Frolova, Julia Horstmann, Lisa Fricke, Katja Steiger, Moritz Jesinghaus, Klaus-Peter Janssen, Ulrike Protzer, Klaus Neuhaus, Roland M. Schmid, Dirk Haller, Michael Quante, bioRxiv, 2021.10.08.463613; doi: https://doi.org/10.1101/2021.10.08.463613, https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.10.08.463613v1
Susha Cheriyedath

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Susha Cheriyedath

Susha has a Bachelor of Science (B.Sc.) degree in Chemistry and Master of Science (M.Sc) degree in Biochemistry from the University of Calicut, India. She always had a keen interest in medical and health science. As part of her masters degree, she specialized in Biochemistry, with an emphasis on Microbiology, Physiology, Biotechnology, and Nutrition. In her spare time, she loves to cook up a storm in the kitchen with her super-messy baking experiments.

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