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Inestabilidad en el microbiota de la tripa asociado a las complicaciones y a la mortalidad, hallazgos de COVID-19-related del estudio

El pandémico COVID-19 causado por el coronavirus nuevo 2 (SARS-CoV-2) de la neumonía asiática ha expuesto las limitaciones de los sistemas globales de la salud pública. La enfermedad COVID-19 es caracterizada por enfermedad respiratoria, y está aumentando el prueba para la implicación (GI) del aparato gastrointestinal. La náusea, la diarrea, y vomitando sea también relativamente común, y un porcentaje de pacientes tienen síntomas del SOLDADO ENROLLADO EN EL EJÉRCITO solamente.

Los estudios han mostrado que la implicación SARS-CoV-2 no está limitada a los pulmones, puede replegar en enterocytes humanos, y es perceptible en las muestras fecales de los pacientes. Aunque los síntomas del SOLDADO ENROLLADO EN EL EJÉRCITO en los pacientes COVID-19 se hayan encontrado para ser asociados a la severidad creciente de la enfermedad y de complicaciones, las causas subyacentes son mal entendidas. Algunos estudios sugieren que una composición microbiana alterada en la tripa correlacione con la severidad COVID-19 y la reacción inflamatoria.

Analizar la saliva y muestras fecales de los pacientes COVID-19 y de los mandos

Aunque haya un discusión cada vez mayor sobre la implicación del microbiome de la tripa en COVID-19, es no entendible si el microbiome afecta COVID-19 o vice versa. Se complica como análisis de los datos del amplicon en los pacientes hospitalizados COVID-19 requiere una cohorte y una integración sofisticadas de parámetros clínicos.

Los investigadores de Alemania analizaban recientemente la saliva y las muestras fecales de los pacientes SARS-CoV-2 infectadas y post-COVID-19 y de los mandos mientras que en vista del múltiplo que influenciaba factores durante la hospitalización. Este estudio está disponible en el servidor de la prueba preliminar del bioRxiv*.

Realizaron el gen del rRNA 16S que ordenaba en el fecal y la saliva muestrea tomado a partir de 108 pacientes COVID-19 y de 22 pacientes post-COVID-19, así como de 20 mandos con pulmonía y 26 mandos asintomáticos. Reclutaron a estos pacientes durante las ondas del pandémico de Alemania primera y segunda, y los parámetros clínicos detallados eran considerados durante el reclutamiento. Las muestras seriales cerco por el individuo, que permitió análisis intraindividual.

La composición microbiana de la tripa observó en la cohorte una reseña del diseño del estudio. Se indican las muestras del taburete y de la saliva. Alfa-diversidad de B de todas las muestras de todos los pacientes. El histograma izquierdo muestra la riqueza y el histograma correcto Shannon número efectivo de especie. Árbol filogenético de C calculado por las distancias generalizadas de Unifrac para todas las muestras de todos los pacientes. Los barplots empilados muestran la distribución taxonómica en los fílums llano. La escritura de la etiqueta interna muestra que el estado SARS-CoV-2 y escritura de la etiqueta exterior indica la fase del tiempo del muestreo. D dejada, alfa-diversidad estratificada según el estado SARS-CoV-2 para todas las muestras de todos los pacientes, mostrando a Shannon números y riqueza efectivos. Enderece, los modificantes del efecto de la demostración de los barplots que contribuyen importante a la diversidad microbiana en todas las muestras. Y-AXIS muestra el valor R2 calculado sobre la base de la distancia de Rebuzno-Curtis para COVID-19, el poste COVID-19 y el SC.
La composición microbiana de la tripa observó en la cohorte una reseña del diseño del estudio. Se indican las muestras del taburete y de la saliva. Alfa-diversidad de B de todas las muestras de todos los pacientes. El histograma izquierdo muestra la riqueza y el histograma correcto Shannon número efectivo de especie. Árbol filogenético de C calculado por las distancias generalizadas de Unifrac para todas las muestras de todos los pacientes. Los barplots empilados muestran la distribución taxonómica en los fílums llano. La escritura de la etiqueta interna muestra que el estado SARS-CoV-2 y la escritura de la etiqueta exterior indica la fase del tiempo del muestreo. D dejada, alfa-diversidad estratificada según el estado SARS-CoV-2 para todas las muestras de todos los pacientes, mostrando a Shannon números y riqueza efectivos. Enderece, los modificantes del efecto de la demostración de los gráficos de la barra que contribuyen importante a la diversidad microbiana en todas las muestras. Y-AXIS muestra el valor R2 calculado sobre la base de la distancia de Rebuzno-Curtis para COVID-19, el poste COVID-19 y el SC.

Las complicaciones COVID-19 y la severidad correlacionan con la tripa y el microbiota oral

Los resultados mostraron que la tripa y el microbiota oral fueron alterados basaron en el número y el tipo de complicaciones de COVID-19-related y de severidad de la enfermedad. El acontecimiento de complicaciones individuales correlacionó con la presencia de bacterias poco arriesgadas tales como prausznitzii de Faecalibacterium y de bacterias de alto riesgo tales como Parabacteroides en la tripa. El análisis demostró que una composición bacteriana de la tripa estable correlacionó con una progresión favorable de la enfermedad y determinó un modelo basado en perfiles microbianos de la tripa para estimar la mortalidad COVID-19.

“Presumimos que los cambios en la composición microbiana, especialmente de la tripa, pueden impulsar enfermedad, posiblemente vía una implicación en el revelado de complicaciones.”

Las firmas bacterianas de la tripa se pueden utilizar en nuevas aproximaciones diagnósticas para estimar la mortalidad COVID-19

Totales, las conclusión del estudio demuestran que los correlativos del microbiota de la tripa con el acontecimiento de las complicaciones de COVID-19-related y pueden influenciar la severidad de la enfermedad. Así, las bacterias sabidas para sus propiedades protectoras e inmunosupresivas aparecían disminuir con el aumento de complicaciones de COVID-19, y las taxus relativamente patógenas llegaron a ser más frecuentes. El prausnitzii del F., por ejemplo, no fue descubierto en pacientes con complicaciones y estaba relativamente menos en pacientes con AKI, acción cardiaca, ARDS, y correlacionado negativo con mortalidad. El prausnitzii del F. se ha mostrado para tener propiedades antiinflamatorias y fue encontrado para correlacionar con la severidad COVID-19 inverso.

Por otra parte, el género Alistipes aumentó relativamente con el número de complicaciones de la salud. Hay testimonio contradictorio sobre el potencial patógeno o protector de Alistipes en diversas enfermedades.

En conclusión, un microbiome estable de la tripa puede contribuir a una progresión favorable COVID-19, y las firmas bacterianas se pueden utilizar para estimar la mortalidad COVID-19, que podría ayudar a nuevas aproximaciones diagnósticas. Más importantemente, este estudio destaca los retos en el análisis de datos microbianos durante la hospitalización. Según los autores, más estudios son necesarios analizar lazos directos entre COVID-19 y destripar dysbiosis bacteriano e integrar las configuraciones microbianas para las aplicaciones diagnósticas y terapéuticas en rutina clínica.

“Tomado juntos, nuestros resultados sugieren que la tripa y el microbiota salival están asociados al acontecimiento de complicaciones individuales en COVID-19, de tal modo influenciando severidad de la enfermedad.”

Advertencia *Important

el bioRxiv publica los partes científicos preliminares que par-no se revisan y, por lo tanto, no se deben mirar como concluyentes, conduce práctica clínica/comportamiento relativo a la salud, o tratado como información establecida.

Journal reference:
  • Gut Bacterial Dysbiosis and Instability is Associated with the Onset of Complications and Mortality in COVID-19 David Schult, Sandra Reitmeier, Plamena Koyumdzhieva, Tobias Lahmer, Moritz Middelhoff, Johanna Erber, Jochen Schneider, Juliane Kager, Marina Frolova, Julia Horstmann, Lisa Fricke, Katja Steiger, Moritz Jesinghaus, Klaus-Peter Janssen, Ulrike Protzer, Klaus Neuhaus, Roland M. Schmid, Dirk Haller, Michael Quante, bioRxiv, 2021.10.08.463613; doi: https://doi.org/10.1101/2021.10.08.463613, https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.10.08.463613v1
Susha Cheriyedath

Written by

Susha Cheriyedath

Susha has a Bachelor of Science (B.Sc.) degree in Chemistry and Master of Science (M.Sc) degree in Biochemistry from the University of Calicut, India. She always had a keen interest in medical and health science. As part of her masters degree, she specialized in Biochemistry, with an emphasis on Microbiology, Physiology, Biotechnology, and Nutrition. In her spare time, she loves to cook up a storm in the kitchen with her super-messy baking experiments.

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