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Les lymphocytes T de beaucoup de gens identifient les mêmes composantes de SARS-CoV-2

Comme avances actuelles de pandémie du coronavirus disease-2019 (COVID-19), le coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de syndrôme respiratoire aigu sévère subit une mutation.  En plus de poser un risque important de l'infection sévère, les variantes SARS-CoV-2 peuvent échapper aux anticorps de neutralisation induits par les vaccins actuellement disponibles.

Les scientifiques ont proposé que les vaccins complémentaires qui peuvent induire des réactions à cellule T cytotoxiques vers les protéines virales multiples peuvent être plus efficaces dans des variantes de combat de SARS-CoV-2, et peuvent également s'avérer utile en évitant des symptômes sévères dans les patients immunodéficitaires sans ou les réactions nuies de lymphocyte B.

L'étude

Une étude neuve publiée sur le prétirage de bioRxiv* a visé à recenser les épitopes à cellule T hautement immunoprevalent CD8 spécifiques à SARS-CoV-2 qui sont confirmés pour être de manière endogène traités et présentés sur les allèles fréquemment exprimés de HLA.

Afin d'administrer la dose plus élevée possible des antigènes les plus immunogènes, il est nécessaire de limiter le nombre d'épitopes à ceux qui induisent les réactions immunitaires les plus efficaces dans la majorité de personnes d'une population.

Cette étude a recensé neuf épitopes SARS-CoV-2 CD8 à cellule T spécifiques économisés, limités par quatre des allèles les plus répandus de la classe I de HLA dans les Caucasiens.

La présente étude a nécessité la cartographie des réactions CD8 à cellule T à cinq protéines SARS-CoV-2 dans une grande cohorte de COVID-19 HLA-tapé convalescents-avec la maladie doux-à-sévère, et des contrôles sains en Norvège.

Parmi les 93 personnes wherefrom le sérum a été extrait, 73 réactions des anticorps montrées au domaine et (RBD) à la protéine récepteur-grippants de Nucleocapsid de SARS-CoV-2. L'étude a compris 14 la pandémie - réaction-négatif de polymérase (PCR) et anticorps-négatif à chaînes, et 30 échantillons témoins pré-universels. La condition posante des cellules de T en travers des cohortes a été confirmée.

La spectrométrie de masse a été employée pour déterminer les épitopes exacts qui ont obtenu la réaction de cellules de T CD8 pour analyser le ligandome de HLA de 25 lignées cellulaires B721.221 mono-alléliques overexpressing les protéines de structure SARS-CoV-2 et cinq des allèles les plus répandus de la classe I de HLA dans la population (caucasienne) norvégienne. Supplémentaire, deux lignées cellulaires exprimant les protéines non-structurelles se sont analysées.

Les réactions CD4 et CD8 à cellule T fonctionnelles contre le peptide SARS-CoV-2 met (a) le CD4 fonctionnel et les réactions CD8 à cellule T contre les protéines SARS-CoV-2 structurelles clouent (s), enveloppe (e), membrane (m) et Nucleocapsid (n) et la protéine non-structurelle ORF3a (O3a) dans COVID-19 convalescent (n=96 ; Position SARS-CoV-2) et échantillons témoins sains (n=33, y compris 14 universels (négatif SARS-CoV-2) et 19 pré-universels) évalués après que stimulation de PBMC avec des gisements de peptide (superposant 15 mers) mesurés par l
Les réactions CD4 et CD8 à cellule T fonctionnelles contre le peptide SARS-CoV-2 met (a) le CD4 fonctionnel et les réactions CD8 à cellule T contre les protéines SARS-CoV-2 structurelles clouent (s), enveloppe (e), membrane (m) et Nucleocapsid (n) et la protéine non-structurelle ORF3a (O3a) dans COVID-19 convalescent (n=96 ; Position SARS-CoV-2) et échantillons témoins sains (n=33, y compris 14 universels (négatif SARS-CoV-2) et 19 pré-universels) évalués après que stimulation de PBMC avec des gisements de peptide (superposant 15 mers) mesurés par l'expression des marqueurs d'activation CD134+CD137+ et CD69+CD137+ sur des cellules de T CD4 et CD8 sous tension, respectivement (contour schématique d'installation d'analyse et de stratégie de déclenchement dans fig. de supplément 2A+B). Le test de Wilcoxon a été employé pour comparer des niveaux de réaction entre les groupes et une différence important a été observé pour la plupart des gisements (p < 0,001), comme indiqué. (b) Heatmap des différentes réactions CD4 et CD8 à cellule T pour chaque COVID-19 convalescent (n=96). Convalescents sont triés de le plus bas à la réaction générale la plus élevée (fléaux : montant de réaction à tous les antigènes). Des antigènes sont triés ont basé sur des réactions générales dans les patients (rangées). (c) Par paires associations entre les réactions des anticorps et la réaction CD4 et CD8 à cellule T fonctionnelle aux gisements de peptide (corrélation d'homme armé d'une lance). Les tuiles étaient colorées par l'importance de la réaction où la corrélation était statistiquement significative (FDR<0.01) ; pour des tuiles avec le mouvement propre blanc la corrélation n'était pas statistiquement significative.

De façon générale, 50 peptide-HLA-combinaisons en travers des protéines sélectées ont été identifiées, dont 46 n'étaient pas précédemment rapportés. Les résultats ont prouvé que les deux peptides qui ont montré l'homologie au-dessus de 70% à un des autres coronaviruses n'ont pas évoqué une réaction dans les échantillons pré-universels, proposant que seule l'homologie élevée ne soit pas adéquate pour la croix-reconnaissance.

Une deuxième expérience a été entreprise pour établir les réactions CD8 à cellule T à dix épitopes avec l'immunoprevalence prévu >50% dans une cohorte de 33 donneurs convalescents. L'immunoprevalence prévu était assimilé pour neuf de ces derniers, alors qu'un épitope était plus rare dans cette cohorte. Ces neuf épitopes ont montré un immunoprevalence de 70% ou plus élevés, six dont étaient immunogènes dans au moins 90% de personnes.

Les découvertes ont indiqué que sept parmi ces épitopes SARS-CoV-2 spécifiques économisés sont de manière endogène présentés. En outre, deux épitopes hautement immunoprevalent étaient nouveaux en cela étude-qui n'avait pas été précédemment rapporté dans la base de données immunisée d'épitope. En conclusion, une corrélation marquée a été enregistrée entre l'immunoprevalence et l'immunodominance parmi les 29 épitopes immunogènes.

De plus, là existé une forte corrélation entre les importances de la réaction dans les échantillons obtenus à partir de la même personne au temps différent se dirige - indiquant qu'un échantillon unique représente avec précision le statut immunitaire d'une personne. On a affirmé que la combinaison de la prévision obligatoire de milliseconde et de HLA pourrait fournir une stratégie efficace pour recenser des peptides.

Les découvertes ont impliqué que l'immunité CD8 à cellule T contre SARS-CoV-2 est plus orientée qu'a précédemment pensé et comporte principalement un ensemble limité des épitopes qui induisent des réactions immunitaires intenses dans presque chaque personne infectée. Par conséquent, le recensement d'un petit groupe hautement d'immunoprevalent et immunodominant devrait servir de base aux vaccins se développants qui obtiennent les réactions CD8 à cellule T robustes et se protègent contre l'infection SARS-CoV-2.

Avis *Important

le bioRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
Nidhi Saha

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Nidhi Saha

I am a medical content writer and editor. My interests lie in public health awareness and medical communication. I have worked as a clinical dentist and as a consultant research writer in an Indian medical publishing house. It is my constant endeavor is to update knowledge on newer treatment modalities relating to various medical fields. I have also aided in proofreading and publication of manuscripts in accredited medical journals. I like to sketch, read and listen to music in my leisure time.

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