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Le cellule T di molta gente riconoscono le stesse componenti di SARS-CoV-2

Come gli avanzamenti correnti di pandemia di coronavirus disease-2019 (COVID-19), il coronavirus 2 (SARS-CoV-2) di sindrome respiratorio acuto severo sta subendo una mutazione.  Oltre a comportare un rischio significativo di infezione severa, le varianti SARS-CoV-2 possono sfuggire agli anticorpi di neutralizzazione indotti dai vaccini attualmente disponibili.

Gli scienziati hanno proposto che i vaccini complementari che possono indurre le risposte a cellula T citotossiche verso le proteine virali multiple potessero essere più efficaci nelle varianti di combattimento di SARS-CoV-2 e possono anche risultare utile nell'impedire i sintomi severi in pazienti immunodeficienti senza o nelle risposte alterate del linfocita B.

Lo studio

Un nuovo studio pubblicato sulla pubblicazione preliminare del bioRxiv* ha mirato ad identificare gli epitopi a cellula T altamente immunoprevalent CD8 specifici a SARS-CoV-2 che sono confermati in modo endogeno per essere elaborati e per presentati sugli alleli frequentemente espressi di HLA.

Per amministrare il più alta dose possibile degli antigeni più immunogeni, è necessario da limitare il numero degli epitopi a quelli che inducono le risposte immunitarie più potenti nella maggior parte delle persone di una popolazione.

Questo studio ha identificato nove epitopi a cellula T specifici conservati SARS-CoV-2 CD8, limitati da quattro degli alleli della classe I di HLA più prevalenti in Caucasians.

Lo studio presente ha comportato la mappatura delle risposte a cellula T CD8 a cinque proteine SARS-CoV-2 in un grande gruppo di COVID-19 HLA-digitato convalescents-con la malattia delicato--severa ed i comandi sani in Norvegia.

Fra le 93 persone da cui il siero è stato estratto, 73 risposte indicate dell'anticorpo al dominio dell'ricevitore-associazione (RBD) ed alla proteina di Nucleocapsid di SARS-CoV-2. Lo studio ha compreso 14 la pandemia - reazione-negativo della polimerasi (PCR) e anticorpo-negativo a catena e 30 campioni di controllo pre-pandemici. Lo stato di riposo delle celle di T attraverso i gruppi è stato confermato.

La spettrometria di massa è stata usata per determinare gli epitopi esatti che hanno suscitato la risposta delle cellule di T CD8 per analizzare il ligandome di HLA di 25 linee cellulari mono-allelic B721.221 che overexpressing le proteine strutturali SARS-CoV-2 e cinque degli alleli della classe I di HLA più prevalenti nella popolazione (caucasica) norvegese. Ulteriormente, due linee cellulari che esprimono le proteine non strutturali sono state analizzate.

Le risposte a cellula T funzionali CD4 e CD8 contro il peptide SARS-CoV-2 riunisce (A) CD4 funzionale e le risposte a cellula T CD8 contro le proteine strutturali SARS-CoV-2 chiodano (s), la busta (E), membrana (m) e Nucleocapsid (n) e la proteina non strutturale ORF3a (O3a) in COVID-19 convalescente (n=96; Posizione SARS-CoV-2) e campioni di controllo sani (n=33, compreso 14 pandemici (quantità negativa SARS-CoV-2) e 19 pre-pandemici) valutati dopo che stimolo di PBMC con i raggruppamenti del peptide (che sovrappongono 15 mers) misurati dall
Le risposte a cellula T funzionali CD4 e CD8 contro il peptide SARS-CoV-2 riunisce (A) CD4 funzionale e le risposte a cellula T CD8 contro le proteine strutturali SARS-CoV-2 chiodano (s), la busta (E), membrana (m) e Nucleocapsid (n) e la proteina non strutturale ORF3a (O3a) in COVID-19 convalescente (n=96; Posizione SARS-CoV-2) e campioni di controllo sani (n=33, compreso 14 pandemici (quantità negativa SARS-CoV-2) e 19 pre-pandemici) valutati dopo che stimolo di PBMC con i raggruppamenti del peptide (che sovrappongono 15 mers) misurati dall'espressione degli indicatori CD134+CD137+ e CD69+CD137+ di attivazione sulle celle di T in tensione CD4 e CD8, rispettivamente (profilo schematico dell'impostazione di analisi e della strategia gating nella fig. del supplemento 2A+B). La prova di Wilcoxon è stata usata per confrontare i livelli di risposta fra i gruppi e una differenza significativa è stato osservato per la maggior parte dei raggruppamenti (P < 0,001), come indicato. (B) Heatmap di diverse risposte a cellula T CD4 e CD8 per ogni COVID-19 convalescente (n=96). Convalescents è ordinato dal più in basso all'più alta risposta globale (colonne: somma della risposta a tutti gli antigeni). Gli antigeni sono ordinati hanno basato sulle risposte globali in pazienti (righe). (C) al paio associazioni fra le risposte dell'anticorpo e la risposta a cellula T funzionale CD4 e CD8 ai raggruppamenti del peptide (correlazione dello Spearman). Le mattonelle sono state colorate dalla grandezza della risposta dove la correlazione era statisticamente significativa (FDR<0.01); per le mattonelle con lo sfondo bianco la correlazione non era statisticamente significativa.

In generale, 50 peptide-HLA-combinazioni attraverso le proteine selezionate sono state riconosciute, di cui 46 precedentemente non sono stati riferiti. I risultati hanno indicato che i due peptidi che hanno esibito l'omologia superiore a 70% - uno degli altri coronaviruses non hanno evocato una risposta nei campioni pre-pandemici, suggerenti che l'alta omologia da solo non fosse adeguata per il inter-riconoscimento.

Un secondo esperimento è stato eseguito per accertare delle risposte a cellula T CD8 a dieci epitopi con il immunoprevalence stimato >50% in un gruppo di 33 donatori convalescenti. Il immunoprevalence stimato era simile per nove di questi, mentre un epitopo era più raro in questo gruppo. Questi nove epitopi hanno mostrato un immunoprevalence di 70% o più alti, sei di cui erano immunogeni almeno in 90% delle persone.

I risultati hanno rivelato che sette fra questi epitopi specifici conservati SARS-CoV-2 in modo endogeno sono presentati. Inoltre, due epitopi altamente immunoprevalent erano novelli in questo studio-che precedentemente non era stato riferito nel database immune di epitopo. Per concludere, una profonda correlazione è stata registrata fra il immunoprevalence e il immunodominance fra i 29 epitopi immunogeni.

Inoltre, là esistente una forte correlazione fra le grandezze della risposta in campioni ottenuti dalla stessa persona a tempo differente indica - indicando che un singolo campione rappresenta precisamente lo stato immune di una persona. È stato specificato che combinare la previsione obbligatoria di HLA e del ms potrebbe fornire una strategia efficiente per identificare i peptidi.

I risultati hanno arguito che l'immunità a cellula T CD8 a SARS-CoV-2 è messa a fuoco di precedentemente ha pensato e principalmente comprende un insieme limitato gli epitopi che inducono le forti risposte immunitarie in quasi ogni persona infettata. Di conseguenza, identificare un piccolo gruppo di altamente immunoprevalent e immunodominant dovrebbe essere la base per i vaccini di sviluppo che suscitano le risposte a cellula T robuste CD8 e proteggono dall'infezione SARS-CoV-2.

Avviso *Important

il bioRxiv pubblica i rapporti scientifici preliminari che pari-non sono esaminati e, pertanto, non dovrebbero essere considerati conclusivi, guida la pratica clinica/comportamento correlato con la salute, o trattato come informazioni stabilite.

Journal reference:
Nidhi Saha

Written by

Nidhi Saha

I am a medical content writer and editor. My interests lie in public health awareness and medical communication. I have worked as a clinical dentist and as a consultant research writer in an Indian medical publishing house. It is my constant endeavor is to update knowledge on newer treatment modalities relating to various medical fields. I have also aided in proofreading and publication of manuscripts in accredited medical journals. I like to sketch, read and listen to music in my leisure time.

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