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Os pesquisadores identificam as variações novas do gene que podem causar dystrophies retinas herdados

Uma equipe internacional dos pesquisadores, conduzida por cientistas na Universidade da California San Diego e no instituto do olho de Shiley na saúde de Uc San Diego, alargou e compreensão aprofundada de como os dystrophies retinas herdados (IRDs) afectam populações diferentes dos povos e, no processo, identificaram as variações novas do gene que podem causar as doenças.

Os resultados publicaram na introdução do 18 de outubro de 2021 da genética de PLOS.

IRDs é um grupo de doenças, do pigmentosa da retinite ao choroideremia, que conduzem à perda progressiva da visão, mesmo cegueira. Cada IRD é causado pelo menos por uma mutação genética, embora mutações no mesmo gene pode conduzir aos diagnósticos diferentes de IRD.

IRDs é raro, mas afectam os indivíduos de todas as idades, progredindo em taxas diferentes, mesmo dentro das famílias afligidos com a mesma doença. O diagnóstico específico depende de encontrar as mutações causais genéticas.

Os E.U. Food and Drug Administration aprovaram a terapia genética para tratar um formulário de IRD que envolve o gene RPE65, mas para o outro IRDs causado por mutações em mais de 280 genes diferentes, não há nenhum cura ou tratamento provada retardar a progressão da doença.

Os pesquisadores conduziram seqüências do inteiro-genoma (WGS) de 409 pessoas de 108 linhagens não relacionadas da família, cada um com um IRD previamente diagnosticado. O WGS é um processo de determinar a totalidade, ou a próximo-totalidade, da seqüência do ADN de um indivíduo. Fornece um retrato detalhado do genoma inteiro da pessoa, incluindo as mutações e as variações, que podem ser usadas para finalidades comparativas largas.

Os participantes do estudo foram recrutados de três regiões geográficas diferentes: Americanos de México, de Paquistão e de europeu que vivem nos Estados Unidos. As análises Genomic foram conduzidas das amostras de sangue tomadas de todos os participantes, que revelaram variações causais em 62 das 108 linhagens. Um total de 94 variações do gene foi encontrado nas 62 famílias: 52 variações tinham sido identificadas previamente como causal e 42 não tiveram. Surpreendentemente, mais do que a metade das variações novas não foram alistadas na base de dados da agregação do genoma, uma compilação internacional de dados genomic.

As variações totais, causais foram detectadas em 63 por cento de participantes mexicanos, em 60 por cento do paquistanês, e em 48 por cento do americano europeu.

O estudo igualmente identificou uma grande proporção de mutações causais novas de IRD específicas às populações estudadas e revelou os tipos de mutações que contribuem aos dystrophies retinas herdados. Aproximadamente 13 por cento das famílias indicaram mudanças atípicas ou inesperadas no genoma. Cinco das linhagens da família tiveram mutações em mais de um gene em todos os indivíduos afetados; as mutações levadas de uma família em genes diferentes em membros afetados diferentes e em uma mutação de novo foram encontradas em um paciente que não estava actual em ambos os pais.

Uns 8 por cento adicional das famílias tiveram grandes mudanças na estrutura de seu genoma que causa a doença retina herdada e o diagnóstico clínico inicial em quatro famílias foi reclassificado com base em seu genótipo.

Os autores disseram a compreensão nova do impulso dos resultados da distribuição de mutações causais de IRD nestas três populações diversas, que promoverão a compreensão da variação e da apresentação da doença. Isso, por sua vez, ajudará a projectar umas estratégias mais eficientes e umas terapias do teste genético aplicáveis às populações globais.

Source:
Journal reference:

Biswas, P., et al. (2021) Deciphering the genetic architecture and ethnographic distribution of IRD in three ethnic populations by whole genome sequence analysis. PLOS Genetics. doi.org/10.1371/journal.pgen.1009848.