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Variante del delta SARS-CoV-2 transmitida por los individuos completo vacunados en Provincetown, Massachusetts

El departamento de Massachusetts de la salud pública (MADPH), en la 10ma de julio de 2021, recibió partes de una onda irruptiva en casos de la enfermedad 2019 del coronavirus (COVID-19) entre residentes de Provincetown, del mA, o de la gente que había visitado recientemente la ciudad.

Provincetown es una ciudad turística en Cape Cod que atrajo a millares de visitantes. Muchos visitantes denunciaron la asistencia del público grande múltiple y de reuniones interiores. Las visitas comenzaron con el 4to del fin de semana de julio y continuaron con la semana siguiente. Posteriormente, el coronavirus de la neumonía asiática 2 infecciones (SARS-CoV-2) en el área subió rápidamente.

A partir del 1 de julio, el régimen de la vacunación en el condado de Barnstable (donde se localiza Provincetown) era el 68%. el 74% del número total de casos denunciados era completo individuos vacunados, y los 79% eran sintomáticos. Este episodio del brote era primer el grande en una población altamente vacunada en los E.E.U.U. Esto llevó a una investigación completa, incluyendo la secuencia del genoma SARS-CoV-2.

Ahora, un nuevo estudio, asentado al servidor de la prueba preliminar del medRxiv*, describe la epidemiología genomic de este brote. Ofrece una comprensión más profunda de la transmisión viral y entre de individuos completo vacunados.

Un nuevo estudio

Las muestras cerco entre el 9 de julio y el 2 de agosto, y, los genomas SARS-CoV-2 fueron ordenados. Los científicos produjeron los genomas de alta calidad SARS-CoV-2 a partir de 467 individuos únicos, incluyendo 439 muestras que fueron asociadas al brote. el 80% de las muestras ordenadas vinieron de varones, la edad mediana era 43, y el 84% vinieron de individuos vacunados.

Conclusión principales

La variante del delta SARS-CoV-2 impulsó el brote de Provincetown con el 99% de las muestras ordenadas como delta. los 84% eran del linaje AY.25, que es raramente Norteamérica exterior pero muy común observados en los E.E.U.U.

Los investigadores analizaban los valores diagnósticos del Ct, que son una aproximación de la carga viral. Las cargas virales eran similares entre los individuos vacunados y sin vacunar y entre los individuos sintomáticos y asintomáticos.

Había, sin embargo, menos casos asintomáticos porque la prueba fue centrada en casos sintomáticos. Los genomas del delta en este grupo de datos no tenían variantes nuevas de la proteína del pico, ni tenían una frecuencia más alta de los cambios del aminoácido.

El tiempo medio puesto que la realización del curso de la vacunación era 111 días. Los científicos observaron que los préstamos virales disminuyeron ligeramente como más tiempo pasajero poste-vacunación. Sin embargo, esta tendencia de disminución no era estadístico importante en este grupo de datos. Además, no obstante insignificante, la carga viral disminuyó marginal con el aumento de edad en individuos vacunados. En la cohorte del estudio, por término medio, los individuos sin vacunar eran más jovenes que individuos vacunados.

Epidemiología de la reseña del brote y del grupo de datos de Provincetown. A. Organigrama que describe las acciones principales del brote de Provincetown y de los equipos relevantes de la muestra presentados aquí. Genomas del B. SARS-CoV-2 por la fecha de la colección. Donde las muestras múltiples cerco del mismo paciente, se utiliza la fecha más temprana de la colección. C. Distribución de todos los casos en el condado de Barnstable sobre el plazo del estudio y el presupuesto del Rt a lo largo del brote. Valores de la D. Ct del gen N1 para los 313 individuos conocidos para ser vacunado completo por uno de Janssen, de Moderna, o de Pfizer; incluye la regresión lineal con intervalo de confianza del 95%.
Epidemiología de la reseña del brote y del grupo de datos de Provincetown. A. Organigrama que describe las acciones principales del brote de Provincetown y de los equipos relevantes de la muestra presentados aquí. Genomas del B. SARS-CoV-2 por la fecha de la colección. Donde las muestras múltiples cerco del mismo paciente, se utiliza la fecha más temprana de la colección. C. Distribución de todos los casos en el condado de Barnstable sobre el plazo del estudio y el presupuesto del Rt a lo largo del brote. Valores de la D. Ct del gen N1 para los 313 individuos conocidos para ser vacunado completo por uno de Janssen, de Moderna, o de Pfizer; incluye la regresión lineal con intervalo de confianza del 95%.

Los científicos dedujeron que la variante del delta fue introducida en la población de muchas fuentes basadas en un análisis filogenético del árbol. Los genomas denunciados más tempranos dentro del atado eran de otros estados. Esto llevó a investigadores a creer que este linaje emergió fuera del mA y fue introducido en el estado apenas antes de la amplificación por el brote. También observaron una configuración, que indicó el rapid extendido de un único individual y - una firma de superspreading. Sin embargo, la investigación de la salud pública no encontró ningunas pruebas de un único sitio compartido entre muchos casos. La configuración específica de la transmisión no podría ser resuelta, pero la forma de la filogenia sugirió que algunos individuos fueran responsables de la mayoría de las acciones de la transmisión.

Después, científicos investigados si los casos del brote contribuyeron al aumento subsiguiente en casos en el mA y en todo el país. La mitad de los individuos brote-asociados era residentes del mA, mientras que la otra mitad visitados a partir de 20 otros estados de los E.E.U.U. Fue observado que la firma del atado dominante explicó una pequeña parte de infecciones del delta ordenadas en el mA durante las semanas siguientes.

Identificación de las acciones supuestas de la transmisión de individuos vacunados. La transmisión de la Alto-confianza del A. conecta de la investigación de trazado del contacto. B. Eslabones previstos de la transmisión basados en serie, variantes del intrahost, y fecha genomic del inicio del síntoma. La C. Genómica-predijo los eslabones de la transmisión corroborados por la continuación epidemiológica adicional. Los contactos supuestos se agrupan en los eslabones posibles (líneas grises) y los eslabones sabidos (líneas negras) para denotar plausible comparado con contactos confirmados entre los pares de la transmisión. Un par confirmado de la transmisión que es parte de un atado más grande de eslabones supuestos, descrito en el texto, se marca con un asterisco.
Identificación de las acciones supuestas de la transmisión de individuos vacunados. La transmisión de la Alto-confianza del A. conecta de la investigación de trazado del contacto. B. Eslabones previstos de la transmisión basados en serie, variantes del intrahost, y fecha genomic del inicio del síntoma. La C. Genómica-predijo los eslabones de la transmisión corroborados por la continuación epidemiológica adicional. Los contactos supuestos se agrupan en los eslabones posibles (líneas grises) y los eslabones sabidos (líneas negras) para denotar plausible comparado con contactos confirmados entre los pares de la transmisión. Un par confirmado de la transmisión que es parte de un atado más grande de eslabones supuestos, descrito en el texto, se marca con un asterisco.

La investigación adicional mostró que los atados más pequeños del brote tenían impacto insignificante en la extensión hacia delante dentro de Massachusetts y a otra parte dentro de los E.E.U.U.

A pesar de complejidades epidemiológicas, los datos proporcionaron el fuerte apoyo para 21 transmisiones de individuos vacunados. Los científicos concluyeron que la transmisión de infecciones vaccíneas de la ruptura a los individuos vacunados y sin vacunar era común.

Conclusión

El brote de Provincetown tenía sobre mil casos, y demostró que la variante del delta es capaz de causar un brote grande incluso en una población sobre todo vacunada. , Sin embargo, fue observado que este brote no contribuyó importante al aumento en casos en Massachusetts. Debe ser observado que el brote era efímero debido a la reacción rápida de la salud pública.

El impacto del brote se podía también atenuar por el combate activo de la comunidad afectada en la reacción epidemiológica. El efecto limitado de este episodio sugirió que aunque los altos regímenes de la vacunación no puedan garantizar la prevención de brotes Delta-impulsados, rápido y las medidas sanitarias públicas bien informadas pueden controlarlos de hecho.

Advertencia *Important

el medRxiv publica los partes científicos preliminares que par-no se revisan y, por lo tanto, no se deben mirar como concluyentes, conduce práctica clínica/comportamiento relativo a la salud, o tratado como información establecida.

Journal reference:
Dr. Priyom Bose

Written by

Dr. Priyom Bose

Priyom holds a Ph.D. in Plant Biology and Biotechnology from the University of Madras, India. She is an active researcher and an experienced science writer. Priyom has also co-authored several original research articles that have been published in reputed peer-reviewed journals. She is also an avid reader and an amateur photographer.

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